• No results found

Future Work

In document Global Optimisation for Energy System (Page 120-126)

La   IRM   s’ha   establert   com   una   eina   molt   valuosa   en   el   diagnòstic   clínic   i   en   recerca   perquè   es   tracta   d’una   tècnica   no   invasiva   i   de   gran   resolució,   que   permet  diferenciar  i  visualitzar  amb  nitidesa  els  teixits  tous  de  múltiples  àrees   del  cos.  Es  basa  en  la  capacitat  que  tenen  alguns  nuclis,  especialment  els  protons   de   l’aigua,   per   absorbir   ones   de   radiofreqüència   quan   són   sotmesos   a   l’efecte   d’un  camp  magnètic.  Aquesta  capacitat  genera  un  senyal  que  és  detectat  per  un   receptor  i  transformat  en  imatges  en  un  ordinador.    

La  idea  de  realitzar  un  estudi  morfomètric  amb  IRM  pot  donar  la  impressió  de   certa   simplicitat.   No   obstant,   obtenir   mesures   consistents   és   quelcom   relativament  complicat,  i  s’han  de  tenir  en  compte  diferents  aspectes  per  tal  de   garantir  una  feina  homogènia,  fàcilment  reproduïble  i  fiable.  

2.1.1.

Elecció  de  la  imatge  i  el  tall  adient  

És  molt  important  tenir  clar  el  teixit  o  l’estructura  que  es  vol  estudiar  per  saber   en   quin   tipus   de   seqüència   serà   preferible   efectuar   les   mesures.   Cada   teixit,   segons   la   seva   abundància   en   protons   i   el   temps   que   tarden   en   relaxar-­‐se   desprès  d’haver  estat  estimulats,  emet  un  senyal  de  major  o  menor  intensitat  que   és   captat   per   l’equip.   La   diferència   de   potencial   es   quantifica   numèricament   (imatge  digital)  i,  en  els  estudis  de  IRM  convencionals,  finalment  es  transforma   en  tons  d’una  escala  de  grisos.  Es  poden  modificar  diversos  paràmetres  tècnics   per  obtenir  un  contrast  diferent  entre  els  teixits.  En  les  imatges  potenciades  en   T1  es  poden  veure  estructures  amb  temps  de  relaxació  molt  curts,  com  el  greix  

 

(apareix  amb  alta  intensitat  de  senyal)  però  no,  en  canvi,  estructures  amb  temps   de  relaxació  més  perllongats,  com  l’aigua  (senyal  molt  poc  intensa).  Les  imatges   potenciades  en  T2  per  contra,  mostren  el  greix  com  un  senyal  de  baixa  intensitat,   i  els  líquids,  com  una  senyal  d’alta  intensitat.  Es  produeix  també  inversió  en  la   intensitat   de   senyal   de   la   substància   blanca,   que   s’observa   de   menor   intensitat   respecte  a  la  substància  gris.    

Tant  en  T1  com  en  T2  s’observa  el  moll  de  l’os  amb  intensitat,  i  en  canvi,  la  part   compacta  i  esponjosa,  de  color  negre.  A  la  Taula  9  es  resumeix  com  es  veuen  els   diferents  teixits  en  funció  del  tipus  d’IRM.  Per  realitzar  els  estudis  morfomètrics   presentats  en  aquest  treball,  es  van  utilitzar  imatges  potenciades  en  T1.  

Taula   9.   Visualització   dels   diferents   teixits   en   funció   dels   temps   de   relaxació   potenciats  (T1  o  T2).  

Blanc Gris Negre

T1 Greix Hemorràgia subaguda Contrast Substància blanca Moll de l’os Substància grisa Fetge Melsa Pàncrees Ronyó Músculs Lesions amb aigua

LCR Orina Quists Tendons Vasos Aire Fibrosi

Part compacta i esponjosa os

T2 LCR Orina Quists Tumors Ronyó, Melsa Aigua lliure Moll de l’os Substància grisa Greix Substància blanca Pàncrees Fetge Múscul Os cortical Tendons Aire Vasos

Part compacta i esponjosa os

D’altra   banda,   l’estudi   realitzat   en   un   pacient   implica   una   seqüència   d’imatges   corresponents   a   un   gran   nombre   de   talls   consecutius   (sagitals   i/o   axials)   de   la   regió  d’interès.  El  gruix  del  tall  pot  variar  entre  3  i  4  mm  i  la  distància  entre  ells,   entre  0,6-­‐0,8  mm.  Així  doncs,  la  secció  de  les  diferents  estructures  varia  al  llarg   dels   diferents   talls,   i   per   tant,   també,   la   seva   mida.   Quan   es   vol   mesurar   una   estructura  determinada,  és  molt  important  escollir  correctament  en  els  diferents   individus,   el   tall   i   l’alçada   on   es   realitzarà   l’anàlisi   o   mesura,   per   tal   d’evitar  

 

diferències  degudes  al  nivell  de  la  secció.  Per  uniformitzar  les  mesures,  en  aquest   treball   es   va   escollir   com   a   imatge   de   referència   en   tots   els   individus,   la   corresponent  al  tall  mig  de  l’estudi,  en  tall  sagital,  on  es  visualitzés  tota  la  dent  de   l’axis.  

2.1.2.

Selecció  dels  individus  per  a  l’estudi  

La   mida   mostral   de   la   població   és   un   aspecte   fonamental   a   l’hora   de   dissenyar   una  anàlisi  o  experiment,  ja  que  és  determinant  en  relació  al  poder  estadístic  de   l’estudi  (Lipsey  and  Hurley,  2009).  

L’edat   i   el   sexe   dels   individus   a   estudiar   són   dues   variables   importants   que   també   cal   tenir   en   compte   en   estudis   de   morfometria,   ja   que   poden   tenir   influència  en  l’anatomia,  i  sobretot,  en  la  mida  de  les  estructures.    

2.1.3.

Dificultats  afegides  en  els  estudis  d’IRM  retrospectius  

Normalment   els   estudis   per   IRM   s’utilitzen   fonamentalment   com   a   eina   diagnòstica,  la  qual  cosa  implica  una  sèrie  de  dificultats  afegides  a  l’hora  de  dur  a   terme  un  estudi  morfomètric  retrospectiu.  

Sovint  no  es  tenen  les  IRM  de  tots  els  pacients  inclosos  inicialment  en  l’estudi.  La   causa  principal  és  la  extraviació  dels  estudis  per  part  dels  pacients  amb  el  pas   dels  anys:  quan  els  estudis  es  realitzen  en  centres  diferents  del  de  diagnòstic  i  els   pacients   es   fan   càrrec   del   seu   manteniment,   el   pas   del   temps   facilita   la   seva   pèrdua.    

Un   altre   inconvenient   que   es   pot   presentar   és   l’aparició   d’artefactes  en   les   imatges.  Tot  i  que  aquests  no  dificulten  la  visualització  de  l’estructura  d’interès   per  al  diagnòstic,  en  aquest  cas  el  DA,  sí  que  poden  deteriorar  o  alterar  la  imatge   d’altres  estructures  d’interès  en  posteriors  estudis  de  morfometria.    

El  període  de  temps  que  passa  des  que  es  realitza  l’estudi  IRM  per  diagnosticar   fins  que  es  decideix  fer  l’anàlisi  morfomètrica  també  s’ha  de  tenir  en  compte,  no   només  per  la  probabilitat  de  pèrdua  de  les  imatges,  sinó  també  pel  fet  que  es  pot   produir  un  canvi  en  els  criteris  o  pautes  de  presa  d’IRM.  Aquest  canvi  de  criteri   o   pautes   pot   modificar   el   nombre   i   gruix   d’imatges   necessàries   per   obtenir   el  

 

diagnòstic,   fent   que   al   final,   cada   pacient   presenti,   per   al   mateix   diagnòstic,   un   estudi   d’IRM   amb   característiques   diferenciades.   Quan   el   tall   escollit   com   a   referència   no   hi   és,   cal   descartar   el   pacient   per   tal   d’evitar   alteracions   en   els   punts  de  referència,  que  posteriorment  acabaran  afectant  la  mesura.  El  fet  que   un   estudi   d’IRM   mostri   només   el   tall   de   referència   i   uns   pocs   de   flanquejants,   però  no  tota  l’estructura  en  si,  impedeix  realitzar  cert  tipus  de  mesures,  com  ara   les  volumètriques,  que  requereixen  tots  els  talls  de  l’estudi;  només  que  en  falti   un  o  que  no  s’especifiquin  les  característiques  de  cada  tall,  la  mesura  no  es  podrà   realitzar.  El  temps  també  afecta  el  tipus  de  mostra  que  arriba  (format  d’IRM),  ja   que  antigament  les  IRM  es  donaven  en  format  placa  i  actualment  s’obtenen  i  es   guarden   en   format   digital.   Aquest   problema   es   pot   resoldre   homogeneïtzant   la   mostra:   fotografiant   les   IRM   en   format   placa   per   tal   de   tenir-­‐les   totes   digitalitzades.  

Quan  l’origen  de  les  IRM  varia,  en  l’era  digital  s’afegeix  l’inconvenient  que  cada   centre   utilitza   un   programa   de   visualització   d’imatges   diferent,   de   manera   que   l’obtenció  dels  estudis  d’IRM  de  certs  pacients  requereix  un  temps  addicional  per   instal·lar  els  programes  necessaris  per  visualitzar  les  imatges,  que  sovint  estan   protegides   contra   còpies   i   modificacions.   Davant   la   dificultat   o   impossibilitat   d’introduir   estudis   d’IRM   d’altres   centres   en   el   programa   oficial   utilitzat   per   mesurar   en   el   centre   on   es   realitza   l’anàlisi   morfomètric,   és  necessària   la   utilització   de   programes   alternatius   d’anàlisi   d’imatges,   a   més   de   l’utilitzat   pel  centre.  Per  aquest  motiu  es  van  haver  d’utilitzar  dos  softwares  diferents  per   analitzar   i   mesurar   les   variables:   NUMARIS/4   syngo®   post-­‐processing   workstation,   versió   MR   2004A   (Siemens   AG,   Erlangen,   GE)   per   a   les   imatges   obtingudes  a  l’Hospital  Universitari  de  la  Vall  d’Hebron;  i  Image  J  software  versió   1.41  per  a  les  imatges  realitzades  en  un  altre  centre  o  en  format  placa.  

2.1.4.

Tests  de  consistència  

En   el   transcurs   de   l’anàlisi   morfomètrica   en   IRM   és   recomanable   avaluar   la   fiabilitat  de  les  mesures.  Realitzar  una  anàlisi  de  consistència  és  important  en  els   estudis  en  què  la  percepció  visual  és  fonamental,  ja  que  pot  haver-­‐hi  variabilitat   deguda  al  factor  humà.    

 

La   variabilitat   total   de   les   mesures   es   pot   desglossar   en   dues   components:   la   variabilitat  deguda  a  les  diferències  entre  els  diferents  individus,  i  la  deguda  a  les   diferències  entre  les  mesures  realitzades  per  cada  observador.  Aquesta  darrera   depèn   de   la   variabilitat   entre   observacions   i   d’una   variabilitat   residual   o   aleatòria   associada   a   l’error   que   comporta   tota   mesura.   És   important   realitzar   una   anàlisi   intraespecífica   per   comprovar   si   qui   realitza   les   mesures   és   consistent  amb  els  punts  de  referència  establerts  a  priori,  de  la  mateixa  manera   que   realitzar   una  anàlisi   interespecífica   és   important   per   certificar   que   la   utilització   de   diferents  softwares   d’anàlisi   d’imatge   no   alteren   les   mesures.   En   aquestes  anàlisis  és  important  el  nombre  de  mostres  que  es  mesuren,  escollides   aleatòriament,  el  nombre  de  vegades  que  es  repeteix  una  anàlisi,  i  el  temps  que   es  deixa  passar  entre  aquestes  repeticions,  per  tal  d’evitar  que  una  repetició  es   faci  més  per  memòria  que  no  pas  en  base  a  un  criteri  d’establiment  dels  punts  de   referència.  

L’índex   estadístic   més   idoni   per   avaluar   la   fiabilitat   de   les   mesures   és   el   coeficient   de   correlació   intraclasse   (CCI),   que   es   basa   en   un   model   d’anàlisi   de   variança  (ANOVA)  amb  mesures  repetides.  En  funció  del  nombre  d’observadors,   mètodes   i   mostres   a   valorar,   s’utilitzen   els   models   d’efectes   aleatoris,   fixes   o   mixtes  per  tal  d’evitar  possibles  errors  de  probabilitat.  Els  valors  del  CCI  poden   oscil·lar   entre   0   i   1   on   0   indica   absència   de   concordança   i   1,   la   concordança   o   fiabilitat  absoluta  dels  resultats  obtinguts.  Valors  superiors  al  0,70  representen   una  fiabilitat  excel·lent  (Prieto  et  al.,  1998).  

2.1.5.

Tests  d’anàlisi  de  dades  i  correccions  

Es  poden  comparar  dos  o  més  grups  utilitzant  test  estadístics  que  formulen  una   hipòtesi   nul·la   que   d’un   principi   pot   ser   rebutjada.   A   l’hora   de   contrastar   la   hipòtesi  nul·la  inicial  s’han  de  tenir  en  compte  diversos  factors  per  determinar  la   prova  estadística  més  adient:  nombre  de  mostres  que  es  vol  comparar  (dues  o   més   de   dues),   si   les   mostres   estan   aparellades   o   són   dependents,     el   tipus   de   variable   (contínua,   categòrica   o   binària)   i   la   distribució   de   les   variables.   Si   la   variable   presenta   una   distribució   normal   i   homogeneïtat   de   variàncies,   s’apliquen   tests   paramètrics;   si   en   la   mostra   no   es   compleix   una   de   les   dues  

 

característiques   s’apliquen   els   anomenats   tests   no   paramètrics,   menys   potents   (són  més  exigents  per  rebutjar  la  hipòtesi  nul·la)  i  a  més  propensos  a  cometre   errors   de   tipus   beta   (no   rebutjar   la   hipòtesi   nul.la   quan   aquesta   és   falsa,   fals   negatiu  o  error  de  tipus  II)  (du  Prel  et  al.,  2010).    

Quan   es   realitzen   moltes   mesures   augmenta   la   probabilitat   que   algun   resultat   sigui  estadísticament  significatiu  tan  sols  per  atzar  (fals  positiu  o  error  de  tipus   I).   Cal,   per   tant,   establir   llindars   de   significació   més   rigorosos   que   tinguin   en   compte  el  nombre  de  tests  realitzats.  No  hi  ha  un  mètode  universal  per  establir   aquests  nous  límits.  Una  correcció  inadequada  per  a  proves  múltiples  pot  derivar   en  dos  resultats  igualment  indesitjables:  increment  de  falsos  positius  (errors  de   tipus   I)   deguts   a   una   correcció   dèbil,   o   la   no   detecció   d’efectes   reals   de   les   variants  sobre  el  fenotip  (errors  de  tipus  II)  deguts  a  l’aplicació  d’una  correcció   massa   severa.   Per   resoldre   aquest   problema   es   poden   utilitzar   diferents   aproximacions   (Abou-­‐Sleiman   et   al.,   2006;   Chanock   et   al.,   2007;   Gordon   and   Finch,  2005).  El  mètode  més  utilitzat  fins  fa  poc  era  la  correcció  de  Bonferroni   per   a   múltiples   comparacions.   Aquesta   correcció   estableix   un   nou   llindar   de   significació  (α’)  segons  el  nombre  de  tests  independents  realitzats  (n)  seguint  la   relació   α’=α/n,   amb   α   típicament   igual   a   0,05.   Això   assegura   una   probabilitat   d’error   de   tipus   I   no   superior   al   5%   en   cadascuna   de   les   comparacions   realitzades.   El   problema   d’aquest   test   és   que   sovint   no   està   clar   el   nombre   d’hipòtesis   independents   que   es   contrasten,   de   manera   que   l’aplicació   estricta   d’aquest   mètode   és   extremadament   conservadora   (severa)   i   tendeix   a   incrementar   els   errors   de   tipus   II   (Abou-­‐Sleiman   et   al.,   2006;   Colhoun   et   al.,   2003;  Curran-­‐Everett,  2000).  

En   l’estudi   morfomètric   de   la   FCP   es   va   aplicar   la   correcció   de   Bonferroni.   En   canvi,   en   l’estudi   de   l’orofaringe,   aquesta   correcció   no   es   va   aplicar   per   evitar   incórrer  en  errors  de  tipus  II  ja  que  els  paràmetres  analitzats  es  van  considerar   tots  ells  independents  entre  si.  

In document Global Optimisation for Energy System (Page 120-126)