F V- Chromosome Testing
CONCLUSION
Publicación 1
: Gene, M., M. Fuentes, E. Huguet, E. Pique, F. Bert, A. Corella, A.Pérez-Pérez, J. Corbella & P. Moreno. 1998. Quechua Amerindian population characterized by HLA-DQA1, YNZ22, 3’APO B, HUMTH01 and HUMVWA31A polymorphisms. J. Forensic Sci.43(2):403-405
1. Caracterizar una muestra de población Quechua de la región de Oruro para los marcadores genéticos STRs, HLA-DQα, YNZ22, 3´APOB, HUMTH01 y HUMVWA31A.
2. Determinar la posible divergencia del equilibrio Hardy-Weinberg para cada marcador.
3. Calcular el desequilibrio de ligamiento para los distintos marcadores. 4. Calcular los valores de poder de discriminación y oportunidad de exclusión.
Publicación 2
: Gene, M., P. Moreno, N. Borrego, E. Pique, A. Xifro, M. Fuentes, F. Bert, A. Corella, A. Pérez-Pérez, D. Turbón, J. Corbella & E. Huguet. 2000. Population study of Aymara Amerindians for the PCR-DNA polymorphisms HUMTH01, HUMVWA31A, D3S1358, D8S1179, D18S51, D19S253, YNZ22 and HLA-DQA1. Int. J. Legal Med. 113: 126-128. Sci. 43(2): 403-4051. Caracterizar una muestra de población Aymara de la región de Pacajes y Murillo para los marcadores genéticos STRs, HLA-DQα, YNZ22, HUMTH01 HUMVWA31A, D3S1358, D8S1179, D18S51, D19S253.
2. Determinar la posible divergencia del equilibrio Hardy-Weinberg para cada marcador.
3. Calcular el desequilibrio de ligamiento para los distintos marcadores. 4. Calcular los valores de poder de discriminación y oportunidad de exclusión.
Publicación 3
: Bert F, Corella A, Gené M, Pérez-Pérez A and Turbón D, (2001)Major Mitochondrial DNA Haplotype Heterogeneity in Highland and Lowland Amerindian Populations from Bolivia. Hum. Biol.73:1-16
1. Proponer una metodología de análisis jerárquico que permita la determinación de haplogrupos del ADNmt en poblaciones amerindias.
2. Caracterizar las poblaciones Chimane, Mosetén, Aymará, Quechua, Yuracaré, Movima, Ignaciana y Trinitaria para los haplogrupos principales de ADN mitocondrial.
3. Describir las condiciones de análisis (primers, condiciones de PCR y de digestión) para cada una de las posiciones seleccionadas para la determinación de haplogrupos mitocondriales.
4. Determinar la diversidad genética de los grupos estudiados utilizando los indicadores h de Nei (1987), theta Weir (1990) y el análisis de la varianza molecular o AMOVA (Excoffier et al. 1992).
5. Comparar los resultados de diversidad genética entre las distintas poblaciones utilizando diferentes distancias genéticas para generar árboles filogenéticos UPGMA.
Publicación 4
: Bert F, Corella A, Gené M, Pérez-Pérez A y D Turbón, (2004) Mitochondrial DNA diversity in the Llanos de Moxos: Moxo, Movima and Yuracaré Amerindian populations from Bolivia lowlands Ann. Hum. Biol.31 (1): 9-281. Describir la variación del ADNmt en la poblaciones estudiadas.
2. Contribuir a la caracterización de la estructura genética de cada población, concretamente:
a. Verificar si existen diferencias en la composición del DNAmt de las tres poblaciones estudiadas.
b. Evaluar y comparar los niveles de diversidad observados intra e interpoblacionales utilizando otras poblaciones del contexto sudamericano. 3. Determinar la diversidad genética de los grupos estudiados utilizando los indicadores
h de Nei (1987) y el análisis de la varianza molecular o AMOVA (Excoffier et al. 1992)
4. Utilizar el análisis filogenético para relacionar entre sí las diferentes poblaciones.
Publicación 5
: Corella A., Bert F., Pérez-Pérez A., Gené M. y Turbón D., (2007)Mitochondrial DNA diversity of the Amerindian Populations living in the Andean Piedmont of Bolivia: Chimane, Mosetén, Aymara and Quechua. Ann. Hum. Biol. 34(1): 34-55
1. Describir la variación del ADNmt en la poblaciones estudiadas.
2. Contribuir a la caracterización de la estructura genética de cada población, concretamente:
a. Verificar si existen diferencias en la composición del DNAmt de las tres poblaciones estudiadas.
b. Evaluar y comparar los niveles de diversidad observados intra e interpoblacionales utilizando otras poblaciones del contexto sudamericano. 3. Determinar la diversidad genética de los grupos estudiados utilizando los indicadores
h de Nei (1987) y el análisis de la varianza molecular o AMOVA (Excoffier et al. 1992).
4. Situar y relacionar mediante el análisis filogenético las diferentes poblaciones en el contexto de las poblaciones sudamericanas.
Publicación 6
: Corella A., Bert F., Pérez-Pérez A., Gené M. y Turbón D.HUMTH01, HUMVWA31A, HUMCSF1PO and HUMTPOX polymorphisms in Amerindian populations living in the Beni Department of Bolivia, (2008), Ann. Hum. Biol. 35 (5): 556- 564
1. Caracterizar una muestra de población Quechua, Aymará y Beniana de la región de Moxos para los marcadores genéticos STRs, HUMTH01, HUMVWA31A, HUMCSF1PO y HUMTPOX.
2. Determinar la posible divergencia del equilibrio Hardy-Weinberg para cada marcador y para población.
3. Calcular el desequilibrio de ligamiento para los distintos marcadores en las diferentes poblaciones.
4. Calcular los valores de poder de discriminación y oportunidad de exclusión.
5. Determinar la similitud genética entre las distintas poblaciones sudamericanas incluidas las del presente trabajo mediante la técnica de Análisis de componentes principales.
Publicación 7
: López-Parra AM, Tirado M, Baeza C, Bert, F, Corella A, Pérez-PérezA, Gamba C, Fernández E, Arroyo-Pardo E. Genetic structure of the population of Beni department (North Bolivia), (2008), For. Sci. Int. 1: 348-349
1. Analizar marcadores Y-STR en una muestra de poblaciones del departamento del Beni (Bolivia).
2. Determinar el grado de diferenciación genética de las poblaciones estudiadas comparándolas con otras del continente sudamericano mediante Multidimesional Scalling (MDS) a partir de la matriz de distancias Rst.
3. Valorar el grado de mestizaje de las poblaciones benianas.
4. Comparar los resultados de diversidad genética entre las distintas poblaciones utilizando diferentes distancias genéticas para generar árboles filogenéticos Neighbor joining.
Publicación 8
: Tirado M., López-Parra A.M., Baeza C., Bert F., Corella A., Pérez- Pérez A., Turbón D. y Arroyo-Pardo E. Y-chromosome haplotypes defined by 17 STRs included in AmpFlSTR Y filer PCR Amplification Kit in a multi ethnical population from El Beni Department (North Bolivia) (2009) Leg. Med.11(2): 101-103
1. Analizar 17 marcadores Y-STR en una población multiétnica del departamento del Beni (Bolivia).
2. Determinar el grado de diferenciación genética de las poblaciones estudiadas comparándolas con otras del continente sudamericano mediante Multidimesional Scalling (MDS) a partir de la matriz de distancias Rst.
Publicación 9
: Bert F, Corella A, Pérez-Pérez A,Gené M, and Turbón D. Piedmontand Llanos de Moxos living in the Beni Department (Bolivia) characterized by HUMTH01, HUMVWA31A, HUMCSF1PO and HUMTPOX polymorphisms. (en preparación)
1. Caracterizar una muestra de población Aymará; Chimane; Ignaciano; Mosetén; Movima; Quechua; Trinitario; Yuracaré del departamento del Beni para los marcadores genéticos STRs, HUMTH01, HUMVWA31A, HUMCSF1PO y HUMTPOX.
2. Determinar la posible divergencia del equilibrio Hardy-Weinberg para cada marcador y para población.
3. Calcular el desequilibrio de ligamiento para los distintos marcadores en las diferentes poblaciones.
4. Calcular los valores de poder de discriminación y oportunidad de exclusión.
5. Determinar la similitud genética entre las distintas poblaciones sudamericanas incluidas las del presente trabajo mediante la técnica de Análisis de componentes principales, tècnicas Kriging de interpolación lineal y árboles filogenéticos UPGMA.