Los murciélagos de diferentes gremios alimenticios respondieron a distintas características de hábitat y del paisaje (composición y estructura) y a distintas escalas, aunque los patrones no fueron muy obvios. Por ejemplo, las especies frugívoras respondieron a dos variables a una escala de 100 m y a una escala de 1500 m, mientras que las especies insectívoras respondieron a dos variables a una escala de 250 m y una variable a una escala de 1500 m. La falta de congruencia en las respuestas de murciélagos de diferentes gremios alimenticios a las variables de hábitat y paisaje sugiere que cada gremio responde de manera distinta a los hábitats y al paisaje que los rodea, y que por lo tanto no es posible utilizar un gremio para explorar patrones e inferir respuestas de otros gremios. Aunque Meyer (2007), argumenta que la falta de existencia de una relación entre las características del hábitat y la comunidad de murciélagos frugívoros puede estar determinada por la poca variación global en la estructura de la vegetación entre las islas de bosques, en este estudio la falta de relación puede ser producto de la capacidad de desplazarse de este grupo y por la alta disponibilidad de recursos en el agropaisaje.
Otros estudios han encontrado que gremios distintos responden de manera distinta a características y escalas del paisaje como producto de sus requerimientos de forraje (Klingbeil
murciélagos de un mismo gremio alimentico a la estructura y composición del hábitat y del paisaje a distintas escalas (Galindo-González y Sosa et ál. 2003, Quesada et ál. 2003, Gehrti y Chelsving 2003), apoyando la idea de que el gremio alimenticio no es un variable explicativa óptima de las relaciones entre organismos y el paisaje circundante.
Según los resultados de este estudio la riqueza de murciélagos frugívoros es favorecida en agropaisajes con muchos parches de bosques secundarios de tamaño pequeño, posiblemente por la disponibilidad de frutos en bosques donde el efecto de borde es mayor y proporcionan la mayor disponibilidad de plantas pioneras para forrajear (p.e., Byrsonima, Cecropias, Ficus, Piper, Solanum). También es favorecida en agropaisajes con muchos parches de potreros alta y baja cobertura arbórea de tamaño pequeño y mayor riqueza de parches de distintos hábitat de tamaños pequeños, probablemente porque pueden reducir la hostilidad de la matriz o que el agropaisaje se encuentre mayormente conectado para facilitar el desplazamiento de los murciélagos.
En cambio, la riqueza es afectada negativamente en agropaisajes con mayor densidad de parches de bosques ribereños y mayor densidad de cercas vivas, dado que estos hábitats principalmente los bosques ribereños son hábitats de percha, alimentación y funcionan como corredores para que los murciélagos se desplacen por el agropaisaje en busca de alimento o nuevos territorios para percha. Por lo tanto al haber mayor número de bosques ribereños y cercas vivas de tamaños pequeños y no conectados entre sí, la matriz se hace más hostil para el desplazamiento de los murciélagos frugívoros en el agropaisaje para forrajear.
Estos resultados concuerdan con lo encontrado en otros estudios, indicando la importancia de bosques secundarios, sucesiones secundarias o sitios de agricultura en abandono, así como bosques ribereños y árboles aislados en pastos para los murciélagos frugívoros, brindándole refugio, percha y sitios de forraje (Cosson et ál. 1999, Galindo- González y Sosa 2003, Klingbeil 2007, Meyer 2007). Sin embargo, especies frugívoras de sotobosque pueden ser afectadas por altas densidades de parches de bosques secundarios (fragmentos de bosques secundarios de tamaños pequeños) producto de su sensibilidad a la fragmentación (Cosson et ál. 1999).
La abundancia y riqueza de murciélagos nectarívoros se favorece principalmente por características de hábitat, como mayor riqueza de árboles, abundancia y diversidad de árboles,
dado que estas variables determinan la disponibilidad de alimento y refugio en los hábitats. Algunos estudios han encontrado que los murciélagos nectarívoros responden mejor a variables de hábitat y en menor grado a características del agropaisaje, aunque el grado de perturbación del hábitat los puede favorecer (Cosson et ál. 1999, Klingbeil 2007, Meyer 2007).
Las relaciones positivas de los murciélagos nectarívoros con características de composición del agropaisaje (porcentaje de bosque secundario, porcentaje de potrero alta cobertura arbórea, densidad de parches de alta cobertura arbórea) sugiere que la comunidad de murciélagos nectarívoros es favorecida por agropaisajes con mayor cobertura de bosque secundario y potreros de alta cobertura arbórea de tamaños pequeños; mientras que los murciélagos nectarívoros son desfavorecidos en agropaisajes que son homogéneos.
Los nectarívoros pueden ser afectados por el grado de aislamiento y el tamaño de los parches de bosque (Cosson et ál. 1999), como se ha registrado en este estudio, donde se observa respuesta de los murciélagos nectarívoros a características del hábitat y respuestas a la composición del agropaisaje a escalas pequeñas en comparación con la comunidad de frugívoros.
La riqueza y abundancia de murciélagos insectívoros es favorecida tanto por características de hábitat como de composición y estructura del agropaisaje. Ocho características de hábitats y de paisaje tuvieron relación con la riqueza y abundancia de insectívoros, de las cuales tres fueron características de hábitat (riqueza y abundancia de arbustos y área basal), sin embargo ninguna tuvo una relación positiva con la comunidad de insectívoros. Posiblemente estas relaciones negativas existen porque son características que obstaculizan la navegación de estos animales en el agropaisaje. Los murciélagos insectívoros prefieren forrajear en áreas de borde o en cauces de ríos que están con poca vegetación (Gehrti y Chelsving. 2003, Klingbeil 2007, Tuttle com. per. 2008) y evitan así la obstaculización de la navegación.
Las relaciones de la comunidad de murciélagos insectívoros con la composición del agropaisaje sugiere que estos son favorecidos en agropaisajes con mayor porcentaje de bosque
potreros de baja cobertura arbórea, debido a que tendrían mayores áreas de perchas, forraje y una matriz menos hostil para su desplazamiento en el agropaisaje.