5.3 Discussion
6.2.2 Filtering tissue-specific age-associated transcripts before en-
1.8.2.1. Tipo de secuencias: PRESS y STEAM
Al igual que en la RM, en la espectroscopía también se utilizan secuencias de adquisición, que consisten en una serie de pulsos de radiofrecuencia y de gradientes de campo magnético que se activan a tiempos determinados para obtener la señal de
resonancia. Los factores claves para obtener una espectroscopía de óptima calidad son la correcta elección de los pulsos y de los parámetros de adquisición. Existen dos métodos básicos usados en espectroscopía: STEAM (stimulated echo acquisition
mode) y PRESS (point resolved spectroscopy)
La técnica STEAM genera un vóxel cúbico o rectangular tras la obtención de un eco estimulado con tres pulsos selectivos de 90º. La utilización de estos pulsos da lugar a un vóxel bien delimitado dentro de la muestra. Esta técnica hace posible que se minimice la contaminación de la señal por el ambiente externo a la región de interés. La segunda técnica, PRESS, también genera un vóxel cúbico o rectangular tras la obtención de un eco espín mediante la adquisición de un pulso de 90º seguido por otros dos de 180º.
Figura 26. Representación del tipo de secuencias comúnmente utilizadas en espectroscopía de vóxel único. La localización espacial se obtiene agrupando las señales de la intersección de tres pulsos de secuencias selectivos aplicados en planos ortogonales (a). La secuencia STEAM consiste en tres pulsos selectivos de 90º (b), la secuencia PRESS consiste en un pulso de 90º seguido de dos pulsos de 180º (c).
El vóxel generado por PRESS no queda tan bien definido como con la técnica STEAM, sin embargo resulta mejor en cociente señal /ruido. Ambas técnicas necesitan que se suprima la señal de agua que se encuentran en sus vóxeles, por lo general se usa la técnica CHESS (chemically selective saturation), que se aplica antes de la localización seleccionada, por medio de tres pulsos de frecuencia selectiva con un gradiente de desfasamiento para suprimir el agua. La mayoría de las técnicas fallan por la inadecuada supresión del agua, que surge mientras se muestran regiones inhomogéneas. La ERM posee mayor sensibilidad que la RM convencional a las heterogeneidades del campo magnético. Por ello, la ERM requiere el uso de un proceso de calibración conocido como shimming, que mejora el campo magnético global y local.
En resumen, las características del método STEAM incluyen el que pueda ser realizado con tiempo de eco (TE) cortos, que exista recuperación incompleta de la señal y que necesita un volumen preciso (vóxel). Las características del método PRESS incluyen el que pueda ser realizado con tiempo de eco cortos y largos y que la señal se recupera completamente.
1.8.2.2. Vóxel único o multivóxel
Dentro de las técnicas de espectroscopía, se puede elegir entre secuencias de vóxel único y secuencias multivóxel. Las secuencias multivóxel presentan la ventaja de poder estudiar en una misma sesión las características metabólicas de múltiples vóxeles. En una primera valoración, esto las haría de elección en cualquier situación. No obstante, presentan una serie de inconvenientes a tener en cuenta. En primer lugar, cuanto mayor es el área a estudiar, mayores son las dificultades técnicas para obtener un registro de calidad. A efectos prácticos, la calidad del registro será menor, tanto en relación señal/ruido, como en homogeneidad del campo y definición de los picos. En segundo lugar, el tiempo de adquisición es mayor en las secuencias multivóxel. En tercer lugar, el método de localización que utilizan estas secuencias es menos preciso que en secuencias de vóxel único, con pérdida de señal por el método utilizado, y contaminación desde vóxeles vecinos. Por último, el procesamiento de los registros es más largo y está menos automatizado. En la práctica, cuando la región a estudiar está claramente definida será de elección la realización de secuencias de vóxel único por su mayor calidad y rapidez en cuanto a obtención y procesado. El vóxel debe de ser
colocado lejos de los artefactos de susceptibilidad y de los lípidos. Cuando se desea valorar diferentes regiones a la vez o el área a estudiar no está claramente definida serán de elección las secuencias multivóxel al obtener una mejor valoración espacial.
Figura 27. Representación de un vóxel único y multivóxel en el estudio del parénquima testicular
1.8.2.3. Tiempo de Eco
Similar a la resonancia magnética convencional la información depende de las condiciones de la técnica, en particular el tiempo de repetición (TR) y tiempo de eco (TE) empleados, debido a que los metabolitos tienen diferentes tiempos de relajación en T1 y T2. Para optimizar la adquisición del espectro se pueden variar diferentes parámetros. La modificación de estos parámetros influirán no sólo en la apariencia del espectro, sino también en la información que puede ser extraída.
Uno de los más relevantes es el tiempo de eco (TE). En la actualidad, el TE usado “in vivo” por la mayoría de grupos varía entre 18 y 288 ms. A este respecto, se habla de estudios con TE corto o largo, utilizando la mayoría de estudios con TE corto un TE entre 18 y 45 ms. y los estudios con TE largo entre 120 y 288 ms. Se han planteado diferentes argumentos a favor y en contra de cada opción.
Un TE largo permite observar un número reducido de metabolitos con menor distorsión de la línea de base. El resultado es un espectro más sencillo de procesar, analizar e interpretar.
largo. De esta manera, es necesario un TE corto para mejor valoración de algunos compuestos como por ejemplo lípidos, mioinositol, glutamina o glutamato.