• No results found

The influence of soil biotic factors on the ecology of Trichoderma biological control

agents 

A. Stewart{ XE "Stewart, A." }, Y.W. Workneh and K.L. McLean 

Bio‐Protection Research Centre, PO Box 84, Lincoln University, Canterbury 7647, NZ 

INTRODUCTION 

The influence of environmental factors such as pH, moisture, 

temperature and other abiotic factors such as fertiliser and 

pesticide application on the establishment, proliferation and 

persistence of biocontrol agents in the field has been intensively 

investigated (1). However, there is little understanding of the 

nature of biotic influences which are likely to play an equally 

important role in determining the nature of the biocontrol 

outcome.  This  paper  reports  on  a  preliminary  study  that 

examines the effect of common soil microbes on two biocontrol 

agents, Trichoderma atroviride LU132 active against onion white 

rot and Trichoderma hamatum LU593 active against Sclerotinia 

lettuce rot (2). 

MATERIALS AND METHODS 

Soil  microbes.  Forty‐eight  microbes representing 11  fungal 

genera  (AcremoniumAlternariaAspergillusBeauveria

ChaetomiumCladosporiumFusariumMetarhizium

PaecilomycesPenicillliumVerticillium), seven bacterial genera 

(AgrobacteriumAzotobacterBacillusBurkholderia

Flavobacterium Paenibacillus) and four actinomycete genera 

(ActinomycesArthrobacterRhodococcusStreptomyces) were 

obtained  from  NZ  culture  collections  (Lincoln  University, 

Landcare Research, AgResearch).  

Dual culture assays. Test microbes were inoculated 3d prior to 

or simultaneously with the Trichoderma on 9 or 15cm diameter 

PDA plates. An inoculum plug of the test microbe was placed 

3cm apart from the Trichoderma in the centre of the plate. 

Colony interactions were monitored every 24h until Trichoderma 

colony growth stopped or was constrained by the edge of the 

plate.  Trichoderma  colony  area  (mm2)  was  measured  and 

percentage inhibition compared to the Trichoderma control 

calculated.  

Soil pot assays. Inocula of six test microbes were produced on 

rice grains and incorporated into Templeton silt loam soil in pots 

to give 106 cfu/g soil. Trichoderma was applied to the soil (106 

cfu/g soil) as a granular formulation (Agrimm Technologies Ltd). 

Pots were incubated at constant temperature and moisture for 

30d. At weekly intervals, soil samples were taken from three 

random spots in each pot and Trichoderma population counts 

(cfu/g soil) determined using soil dilution plating on Trichoderma 

selective medium.  

Statistical analyses. Data was analysed using one‐way ANOVA 

and treatment means compared using Fishers LSD. 

RESULTS 

Dual culture assays. Co‐culture on PDA revealed six fungi and 

one bacterium that significantly inhibited Trichoderma colony 

growth (Table  1).  Greatest inhibition (>85%)  occurred  with  Aspergillus niger and Paecilomyces lilacinus for T. atroviride and 

T. hamatum, respectively. In general, T. hamatum was less 

sensitive than T. atroviride to the test microbes, in particular to  C. globosum

Soil pot  assays. T.  atroviride populations were significantly 

reduced in soil treated with AlternariaAspergillusMetarhizium

Paecilomyces and Daldinia (Fig. 1) T. hamatum was less sensitive 

to the test microbes but the trend was similar (data not shown). 

Table 1. Percentage inhibition of Trichoderma colony growth after 10d 

dual culture with test microbes 

Test microbes  T. atroviride  T. hamatum 

Alt. alternata  94.7 a*  72.8 c  P. lilacinus  84.6 b  85.1 a  Asp. niger  96.5 a   82.2 ab  C. globosum  87.2 b  44.5 d  M. anisopliae  82.5 b  74.2 bc  D. eschscholzii  56.4 c  51.2 d  Agrobacterium sp  67.1 c  31.3 e  * Values within columns followed by the same letter are not significantly different.  0.00E+00 2.00E+04 4.00E+04 6.00E+04 8.00E+04 1.00E+05 1.20E+05 1.40E+05 A. a ltern ata A. n iger C. g lobos um M. a niso pliae P. lil acin us D. e schs chol zii Agro bacte rium Cont rol CF U /g ram so il  

Figure 1. T. atroviride population (cfu/g soil) after 30d in soil treated with 

different test microbes. 

DISCUSSION 

Six fungi and one bacterium significantly inhibited Trichoderma 

colony  growth  on  agar  plates  with  differential  sensitivity 

observed between the two Trichoderma strains. Preliminary 

studies suggest the inhibition  is due to the production of 

antifungal metabolites by the test microbes. The high inhibition 

observed in culture was not reproduced in the soil assay where 

five of the seven test microbes reduced Trichoderma populations 

but only by ten‐fold. Since test microbe populations in the field 

are likely to be lower than those used here, the results likely 

overestimate the potential negative impact on Trichoderma 

biocontrol  agents  applied  to  soil.  However,  further  work 

examining the effect of the test microbes in different soil types is 

needed since metabolite production by the test microbes may 

be influenced by soil abiotic factors.  

ACKNOWLEDGEMENTS 

Funding  for this  project  was  provided  by  the  NZ Tertiary 

Education Commission.  

REFERENCES 

1.  Kredics L, Antal Z, Manczinger L, Szekeres A, Kevei F, Nagy E (2003)  Influence of environmental parameters on Trichoderma strains  with biocontrol potential. Food Tech. and Biotechnol. 41, 37–42.  2.  Stewart A,  McLean  K L  (2004)  Optimising Trichoderma bio‐

inoculants for integrated control of soilborne disease. Proc 3rd 

Australasian Soilborne Diseases Symposium 55–56.   

Session

 

6C—Alternatives

 

to

 

chemical

 

control

Understanding Trichoderma bioinoculants in the root system of Pinus radiata 

P. Hohmann{ XE "Hohmann, P." }A, E.E. JonesB, R. HillA, A. StewartA 

A

Bio‐Protection Research Centre, PO Box 84, Lincoln University, Lincoln 7647, New Zealand 

B

Department of Ecology, Faculty of Agriculture and Life Sciences, PO Box 84, Lincoln University, Lincoln 7647, New Zealand 

INTRODUCTION 

The genus Trichoderma are beneficial soil‐borne fungi and a well 

known source of biological control agent active against a wide 

range of crop diseases, including those of pine trees (1). Several 

isolates  of  Trichoderma  have  been  shown  to  improve 

establishment and reduce pathogen infection of Pinus radiata in 

the nursery and in forestry plantations (2). Three isolates of 

different Trichoderma species were selected for this study. T.  hamatum (LU592) and T. harzianum (LU686), known to stimulate 

growth and improve establishment of P. radiata seedlings, and T.  atroviride (LU132) which had no stimulatory activity. To enable 

more  predictable  and  effective  use  of  Trichoderma  bio‐

inoculants, their establishment and population dynamics was 

determined. In addition, the effect of each isolate on P. radiata 

seedling vitality and growth was assessed. 

MATERIALS AND METHODS 

Each Trichoderma isolate was applied either as a seed coat 

formulation (4 x 105 spores/seed; SC) or a spore‐suspension (5 x 

106 spores/pot; SA) sprayed directly after sowing the P. radiata 

seeds. P. radiata seeds were grown in root‐pruning containers 

for 7 months under conditions reflecting those used in the 

commercial PF Olsen nursery. Health and growth assessments 

included mortality rate, shoot height and shoot and root dry 

weight  measurements.  During  the  7  month  trial  period, 

Trichoderma populations were enumerated in the bulk potting 

mix, rhizosphere, rhizoplane and endorhizosphere subsystems 

by dilution plating.  At the 20 week  assessment, recovered 

Trichoderma colonies were identified using morphological and 

molecular techniques to differentiate between introduced and 

indigenous species. A large‐scale experiment was set up at the 

PF Olsen nursery under commercial conditions to verify the 

results for LU592. 

RESULTS 

T.  hamatum  LU592  performed  the  best  out  of  the three 

introduced isolates. Seedling mortality rate was reduced from 

5.2% for  the  control  to  0.2% for  LU592 and 0.4%  for T.  harzianum LU686 SC. LU592 and LU686 SC also increased shoot 

height by 17% and 11%, respectively. Results also indicated that  T. atroviride LU132 increased the root/shoot ratio. 

Trichoderma populations of all SA treatments were significantly 

higher in the rhizosphere (by 2.1 to 3.3 times) compared with 

the control. Applied Trichoderma spp. could be differentiated 

from indigenous isolates by colony morphology and confirmed 

by molecular sequencing. Introduced Trichoderma isolates could 

be detected even though overall Trichoderma populations did 

not  reveal  significant  differences  to  the  control.  In  the 

rhizosphere, introduced isolates established with levels of ~20% 

for LU132 SA and LU592 SC. T. harzianum LU686 was not 

recovered from the rhizosphere after 20 weeks. T. hamatum 

LU592,  when  spray  applied,  was  the  only  isolate  clearly 

dominating all four subsystems bulk potting mix, rhizosphere, 

rhizoplane and endorhizosphere. 

T.  hamatum  LU592  as  a  seed  coat and  spray application 

significantly increased shoot height, shoot and root dry weight 

and stem diameter compared with the control in the large‐scale 

experiment (Table 1). 

Table 1. Increase (%) in P. radiata seedling growth parameters by T. 

hamatum LU592 compared with the control. All values significant at P >  0.05 from the control. 

Growth factor  Seed coat  Spray Suspension 

Shoot height  7.4  9.5 

Dry weights  ‐ roots  17  21 

  ‐ shoots  23  24 

Stem diameter  9.0  9.4 

number root tips  11  n.s. 

n.s. = not significant 

DISCUSSION 

Both T. hamatum LU592 and T. harzianum LU686 increased the 

growth of P. radiata seedlings, with the subsequent large‐scale 

experiment confirming the growth promotion effects of LU592. 

The spray application performed slightly better than the seed 

coat application. This reduction in seedling morality and increase 

in seedling growth represents a substantial economic benefit to 

the industry. 

The  spray  application  method  clearly  promoted  the 

establishment of the introduced isolates in the root system of P. 

radiataT.  harzianum  LU686  was  found  to  be  an  early 

rhizosphere  coloniser  (declining  after  12  weeks).  Strong 

rhizosphere competence was identified for T. hamatum LU592. 

The ability of Trichoderma, LU592 in particular, to establish in 

the rhizosphere and penetrate the roots is a crucial indicator of 

beneficial activity (1).  

LU592, being the most effective isolate at colonising all P. 

radiata  root  subsystems,  was  selected  for  more  detailed 

ecological studies using a genetically marked strain. Future 

experiments will focus on the use of a fluorescently marked 

isolate of LU592 to verify rhizosphere competence, examine 

spatio‐temporal  distribution  within  the  rhizosphere  and 

determine  endophytic  activity  including  interactions  with 

ectomycorrhizae. 

ACKNOWLEDGEMENTS 

This study is part of the Ecosystem Bioprotection program 

LINX0304 funded by the NZ Foundation for Research Science and 

Technology (FRST). We would like to thank PF Olsen for nursery 

access. 

REFERENCES 

1.  Harman, G.E., Howell, C.R., Viterbo, A., Chet, I. & Lorito, M. (2004).  Trichoderma species—Opportunistic, avirulent plant symbionts.  Nature Reviews Microbiology2(1): 43–56. 

2.  Hood, I.A., Hill, R.A., Horner, I.J. (2006). Armillaria Root Disease in  New Zealand Forests. A Review. Review document written for the  Forest Biosecurity Research Council. 

Session

 

6C—Alternatives

 

to

 

chemical

 

control

Outline

Related documents