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Reduction of unwanted abundant sequences in CSF samples

Chapter 4 Depletion of Abundant Sequences by Hybridization (DASH): using Cas

4.3.3 Reduction of unwanted abundant sequences in CSF samples

SITUACIÓN

Este afloramiento se sitúa entre dos túneles de la carretera de Calanda a Mas de las Matas, en torno al Km. 10.5 de la misma. El corte se sitúa en un barranco perpendicular a la carretera (Val de la Piedra) en el se pue- den estudiar las unidades del intervalo Jurásico Medio y Superior. Las coordenadas de la base son X=733.550 e Y=4.531.560, y las del techo X=733.535 e Y=4.531.552.

BASE

La sección estudiada se sitúa por encima de los materiales de la Fm. Chelva de edad Bajociense- Bathoniense medio (Ramajo et al., 1998; y Meléndez et al., 1999). Se trata de 12 metros calizas masivas en facies de packstone - grainstone de bioclastos, peloides y ooides parcialmente dolomitizadas.

TRAMO 1

1,8 metros de calizas grises

Las calizas de aspecto masivo se disponen en niveles de espesor decimétrico. Tienen facies de packstone de bioclastos y peloides algo bioturbadas. El tramo culmina con un nivel de unos 0,40 m de potencia, en cuyo interior se observa una superficie de discontinuidad irregular, sobre el cual se encuentra un deposito en facies de wackestone de bioclastos y peloides ferruginosos o fosfáticos, muy bioturbados. Este nivel está culminado por un hardground ferruginizado con perforaciones y ammonites truncados a techo. que. se interpreta como el límite Bathoniense medio-superior (Biozona Bremeri) (K. Page com. pers.).

TRAMO 2

5 m de calizas blancas a beiges.

Las calizas se disponen en estratos tabulares de entre 0,2 a 0,5 m, con ocasionales interestratos margosos. en facies de packstone o wackestone–packstone de peloides y bioclastos (filamentos), con abundantes restos fósiles, (ammonites, bivalvos y braquiópodos); que evoluciona a techo, a calizas en facies de wackestone de bioclastos (filamentos). Se observan algunas secuencias métricas con ordenación estratocreciente, así como bioturbación a techo. En su parte inferior se han recogido ammonoideos característicos de la Biozona Retrocos- tatum del Bathoniense superior, mientras que a techo se encuentra ammonites pertenecientes a la Biozona Bu- llatus del Calloviense Inferior, (K. Page com. per.).

TRAMO 3

0,2 m de calizas con ooides ferruginosos

Se corresponde con la Capa de Arroyofrío que consta de dos niveles.

El primero presenta facies de wackestone- de peloides y bioclastos (filamentos) con ooides ferruginosos de pequeño tamaño y dispersos (<5%). Por encima se desarrolla una costra irregular y ligeramente ferruginizada.

El segundo nivel presenta de facies wackestone de bioclastos con ooides ferruginosos y fosfáticos hetero- métricos, a veces de gran tamaño >0,5mm. Dentro de estas facies se observan restos de espículas y tuberoides de esponjas. La parte inferior se atribuye por la presencia de filamentos al Calloviense inferior, mientras que la superior podría corresponder a la Biozona Plicatilis o base de la Biozona Transversarium del Oxfordiense me- dio.

TRAMO 4

2,8 m de calizas con esponjas de tonos blanquecinos.

En su base se observa un estrato de calizas aspecto irregular de unos 0,8 m de espesor, que presenta facies de wackestone de esponjas y bioclastos con restos de ooides ferruginosos y fosfáticos en los primeros centíme- tros. Estos ooides presentan signos de haber sido retrabajados del nivel inferior. Hacia la parte media de este tramo se observa un nivel cubierto de unos 0,80 cm. de espesor, a partir de cual se observan calizas de aspecto lajoso, dispuestas en niveles centimétricos a decimétricos,. Estas calizas presentan facies de wackestone a packstone bioclástico con esponjas muy fragmentadas, tuberoides y glauconita. Dentro de su contenido fósil se identifican fragmentos de ammonoideos, crinoides, belemnites braquiópodos y bivalvos. Su edad puede atri- buirse a la Biozona Transversarium.

TRAMO 5

1, 2 m de espesor de calizas con glauconita con interestratos margosos.

Las calizas se presentan en estratos tabulares, de espesores decimétricos (0,2 a 0,4 m), con facies de packs- tone de peloides y bioclastos con glauconita. Se observan braquiópodos, ammonoideos y bivalvos. Por su fa- cies y posición estratigráfica se atribuye una edad de Oxfordiense medio o quizás superior, Biozonas Bifurcatus y Bimammatum.

TECHO

Por encima de un tramo cubierto de se sitúan los materiales del Kimmeridgiense de la formación Lorigui- lla, que ha sido estudiados por Bancora et al. (2005).

6.3.3. MASDELA MATAS

SITUACIÓN

Se sitúa en la carretera de Calanda a Mas de las Matas entre los puntos kilométricos 6 a 6,2 aflorando en el talud situado en el borde derecho de la carretera. En este perfil se reconoce las Fms. Chelva, Yátova, la Sot de Chera y la parte basal de la Fm. Loriguilla (Mb. Calanda). Su base se sitúa en las coordenadas UTM. X=773.979 e Y=4.529.500 mientras que su techo se sitúa en el punto de coordenadas X=773.980 e Y=4.529.585 (ver Fig.6.3)

BASE

Consisten en unas calizas dolomitizadas rojizas fuertemente tectonizadas y atribuidas al Bajociense- Bathoniense medio, que terminan en un nivel coronado por una superficie irregular ferruginizada y con moldes de fósiles truncados de manera similar a la columna de Calanda–Túnel, de edad Bathoniense medio-superior.

TRAMO 1

5 m de calizas de color rosáceo con intercalaciones de margas.

Las calizas están dispuestas en estratos tabulares de potencia decimétrica (0,2 a 0,5 m). Las calizas presen- tan facies de wackestone a packstone de peloides y bioclastos (filamentos), algo dolomitizadas. En su parte superior se observa un estrato que presenta una superficie de discontinuidad irregular y perforada, con ammoni-

tes truncados a techo de la misma. Por su posición estratigráfica se le puede atribuir una edad de Bathoniense superior (Biozona Retrocostatum) a Calloviense inferior (Biozona Bullatus).

TRAMO 2

0,1 m de calizas con ooides ferruginosos, (Lámina 6.1.B).

Se trata de un nivel ferruginizado de 0,02 a 0,1 m de espesor, en facies de wackestone a packstone de bio- clastos con ooides y pisoides ferruginosos mal clasificados (1 a 6 mm de diámetro), observándose también res- tos de espículas de esponjas. Su contenido fosilífero es escaso, presentando ammonoideos reelaborados del Calloviense inferior y medio, Macrocephalites, Hecticoceras, Homeoplanulites y Bullatimorphites. La presen- cia de restos de esponjas indica que podría tener una edad de Oxfordiense medio, Biozona Plicatilis o la base de la Biozona Transversarium, Subbiozonas Parandieri o Luciaeformis (Ramajo et al., 1998).

TRAMO 3

0,50 m de calizas gris-blancas.

Se trata de calizas de aspecto noduloso a lajoso, dispuestas en dos estratos decimétricos, con alguna inter- calación margosa, en facies de mudstone a wackestone con abundantes restos de esponjas fragmentadas, tube- roides, bioclastos y peloides. Se encuentran recristalizadas y dolomitizadas. Se identifican ammonoideos, be- lemnites, crinoides y bivalvos. En cuanto a su edad, tanto por la facies como por los ammonites encontrados, de los generos Perisphinctes y Larcheria, puede atribuirse la misma a la Subbiozona Schilli de la Biozona Trans- versarium del Oxfordiense medio (Ramajo et al., 1998).

TRAMO 4

2,4 m de calizas-dolomíticas de color crema

Se trata de calizas y dolomías dispuestas en estratos tabulares de espesores decimétricos (0,2 a mas de 0,5). Las dolomía son de grano muy fino, con textura de mosaicos equigranulares a inequigranulares, dentro de las mismas es posible distinguir granos de glauconita, y "fantasmas" bioclastos y peloides. En la base del tramo se observan facies no dolomitizadas de packstone de peloides y bioclastos, con glauconita. En cuanto a su conte- nido fósil, se identifican restos de ammonoideos, belemnites, bivalvos y braquiópodos. Los fragmentos de am- monites observados no permiten precisar la edad, pero podría corresponder tanto al Oxfordiense medio (Biozona Bifurcatus), como al Oxfordiense superior (Biozonas Bimammatum, Hypselum y Hauffianum).

TRAMO 5

1,2 a 1,5 m de margas grises con intercalaciones calizas limosas.

Este tramo pertenece Formación Sot de Chera. La margas se presentan en niveles decimétricos de aspecto masivo, parcialmente cubiertos. Intercaladas entre las mismas se observan unos niveles tabulares de calizas grises limosas con espesores decimétricos 0,1 a 0,3 metros, en facies de mudstone con granos de cuarzo y esca- sos bioclastos (bivalvos, braquiópodos y ammonoideos). Dentro de este tramo se han recogido ammonoideo de la Biozona Planula del Kimmeridgiense inferior (Ramajo et al., 1998).

TECHO

Por encima de este tramo se encuentra serie alternante de calizas limosas, con facies de mudstone, atribui- das al Miembro Calanda, de la Formación Loriguilla (Atrops y Meléndez, 1985 a y b).

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