CHAPTER 7 A GENETICALLY ENCODED Β LACTAMASE REPORTER FOR
III. Representative automation program for Topspin
/* AU program "yw-stability-test" */
/* used with pulse sequence "zgps_hyper_cest" */ #include <stdlib.h>
char *envpnt;
int expTime, zgsafety, sleeptime = 20; int NumOfExp = 20;
// GETINT ("Enter number of experiments :",NumOfExp); // the above line is optional
envpnt = getenv("UXNMR_SAFETY"); zgsafety = 0; if(envpnt != NULL) { if(strcasecmp(envpnt, "on") == 0) { zgsafety = 1;
CPR_exec("env set UXNMR_SAFETY=off", WAIT_TERM); }
}
GETCURDATA;
WPAR("cest_yw","all");
// collect three null points in the beginning as variability is usually observed when delivery is first initiated
// the expnos of these three null points follow the last valid data point
WRA(NumOfExp + 1); REXPNO(NumOfExp + 1);
// acquire three null points TIMES(3) system("closeall.exe"); sleep(sleeptime); SETCURDATA; RPAR("CEST_yw","all"); system("openall.exe"); ZG;
// auto process current data EFP;
APK;
XCMD("abs n");
XCMD("abs n"); APK;
XCMD("abs n");
// go to next data set IEXPNO;
END
// go to the beginning of dataset REXPNO(1); TIMES(NumOfExp) system("closeall.exe"); sleep(sleeptime); SETCURDATA; RPAR("cest_yw","all"); system("openall.exe"); ZG;
// auto process current data EFP; APK; XCMD("abs n"); APK; XCMD("abs n"); APK; XCMD("abs n"); IEXPNO; END if(zgsafety == 1)
CPR_exec("env set UXNMR_SAFETY=on", WAIT_TERM); QUITMSG("--- yw-stability-test finished ---");
BIBLIOGRAPHY
(1) Shapiro, M. G.; Atanasijevic, T.; Faas, H.; Westmeyer, G. G.; Jasanoff, A.
Magnetic Resonance Imaging2006, 24, 449.
(2) Berthault, P.; Huber, G.; Desvaux, H. Progress in Nuclear Magnetic Resonance Spectroscopy2009, 55, 35.
(3) Taratula, O.; Dmochowski, I. J. Current Opinion in Chemical Biology
2010, 14, 97.
(4) Palaniappan, K. K.; Francis, M. B.; Pines, A.; Wemmer, D. E. Israel Journal of Chemistry2014, 54, 104.
(5) Schröder, L. Phys. Medica2013, 29, 3.
(6) Miller, K. W.; Reo, N. V.; Schoot Uiterkamp, A. J.; Stengle, D. P.; Stengle, T. R.; Williamson, K. L. Proc Natl Acad Sci U S A1981, 78, 4946.
(7) Walker, T. G.; Happer, W. Rev. Mod. Phys.1997, 69, 629.
(8) Albert, M. S.; Cates, G. D.; Driehuys, B.; Happer, W.; Saam, B.; Springer, C. S., Jr.; Wishnia, A. Nature1994, 370, 199.
(9) Gabard, J.; Collet, A. Journal of the Chemical Society, Chemical Communications1981, 1137.
(10) Bartik, K.; Luhmer, M.; Dutasta, J. P.; Collet, A.; Reisse, J. J Am Chem Soc1998, 120, 784.
(11) Robbins, T. A.; Knobler, C. B.; Bellew, D. R.; Cram, D. J. J Am Chem Soc
1994, 116, 111.
(12) Bartik, K.; Luhmer, M.; Heyes, S. J.; Ottinger, R.; Reisse, J. J Magn Reson Ser B1995, 109, 164.
(13) Fukutomi, J.; Adachi, Y.; Kaneko, A.; Kimura, A.; Fujiwara, H. J Incl Phenom Macro2007, 58, 115.
(14) Brotin, T.; Dutasta, J.-P. Chem. Rev.2009, 109, 88.
(15) Taratula, O.; Hill, P. A.; Bai, Y.; Khan, N. S.; Dmochowski, I. J. Org Lett
2011, 13, 1414.
(17) Chambers, J. M.; Hill, P. A.; Aaron, J. A.; Han, Z. H.; Christianson, D. W.; Kuzma, N. N.; Dmochowski, I. J. J Am Chem Soc2009, 131, 563.
(18) Hill, P. A.; Wei, Q.; Eckenhoff, R. G.; Dmochowski, I. J. J Am Chem Soc
2007, 129, 11662.
(19) Jacobson, D. R.; Khan, N. S.; Colle, R.; Fitzgerald, R.; Laureano-Perez, L.; Bai, Y.; Dmochowski, I. J. Proc Natl Acad Sci U S A2011, 108, 10969.
(20) Huber, G.; Brotin, T.; Dubois, L.; Desvaux, H.; Dutasta, J. P.; Berthault, P. J Am Chem Soc2006, 128, 6239.
(21) Gao, L.; Liu, W.; Lee, O.-S.; Dmochowski, I. J.; Saven, J. G. Chemical Science2015.
(22) Taratula, O.; Hill, P. A.; Khan, N. S.; Carroll, P. J.; Dmochowski, I. J. Nat Commun2010, 1, 148.
(23) Fogarty, H. A.; Berthault, P.; Brotin, T.; Huber, G.; Desvaux, H.; Dutasta, J. P. J Am Chem Soc2007, 129, 10332.
(24) Fairchild, R. M.; Joseph, A. I.; Holman, K. T.; Fogarty, H. A.; Brotin, T.; Dutasta, J. P.; Boutin, C.; Huber, G.; Berthault, P. J Am Chem Soc2010, 132, 15505.
(25) Spence, M. M.; Rubin, S. M.; Dimitrov, I. E.; Ruiz, E. J.; Wemmer, D. E.; Pines, A.; Yao, S. Q.; Tian, F.; Schultz, P. G. Proc Natl Acad Sci U S A2001, 98, 10654.
(26) Spence, M. M.; Ruiz, E. J.; Rubin, S. M.; Lowery, T. J.; Winssinger, N.; Schultz, P. G.; Wemmer, D. E.; Pines, A. J Am Chem Soc2004, 126, 15287.
(27) Wei, Q.; Seward, G. K.; Hill, P. A.; Patton, B.; Dimitrov, I. E.; Kuzma, N. N.; Dmochowski, I. J. J Am Chem Soc2006, 128, 13274.
(28) Roy, V.; Brotin, T.; Dutasta, J. P.; Charles, M. H.; Delair, T.; Mallet, F.; Huber, G.; Desvaux, H.; Boulard, Y.; Berthault, P. Chemphyschem2007, 8, 2082.
(29) Kotera, N.; Dubost, E.; Milanole, G.; Doris, E.; Gravel, E.; Arhel, N.; Brotin, T.; Dutasta, J. P.; Cochrane, J.; Mari, E.; Boutin, C.; Leonce, E.; Berthault, P.; Rousseau, B. Chem. Commun.2015, 51, 11482.
(30) Seward, G. K.; Wei, Q.; Dmochowski, I. J. Bioconjugate Chem2008, 19, 2129.
(31) Seward, G. K.; Bai, Y.; Khan, N. S.; Dmochowski, I. Chemical Science
(32) Klippel, S.; Döpfert, J.; Jayapaul, J.; Kunth, M.; Rossella, F.; Schnurr, M.; Witte, C.; Freund, C.; Schröder, L. Angew. Chem. Int. Edit.2014, 53, 493.
(33) Palaniappan, K. K.; Ramirez, R. M.; Bajaj, V. S.; Wemmer, D. E.; Pines, A.; Francis, M. B. Angew Chem Int Edit2013, 52, 4849.
(34) Boutin, C.; Stopin, A.; Lenda, F.; Brotin, T.; Dutasta, J.-P.; Jamin, N.; Sanson, A.; Boulard, Y.; Leteurtre, F.; Huber, G.; Bogaert-Buchmann, A.; Tassali, N.; Desvaux, H.; Carrière, M.; Berthault, P. Bioorg. Med. Chem.2011, 19, 4135.
(35) Aaron, J. A.; Chambers, J. M.; Jude, K. M.; Di Costanzo, L.; Dmochowski, I. J.; Christianson, D. W. J Am Chem Soc2008, 130, 6942.
(36) Schnurr, M.; Sydow, K.; Rose, H. M.; Dathe, M.; Schröder, L. Advanced healthcare materials2015, 4, 40.
(37) Rose, H. M.; Witte, C.; Rossella, F.; Klippel, S.; Freund, C.; Schröder, L.
Proc Natl Acad Sci U S A2014, 111, 11697.
(38) Riggle, B. A.; Wang, Y.; Dmochowski, I. J. J Am Chem Soc2015, 137, 5542.
(39) Sloniec, J.; Schnurr, M.; Witte, C.; Resch-Genger, U.; Schröder, L.; Hennig, A. Chem. Eur. J.2013, 19, 3110.
(40) Ripmeester, J. A. J Am Chem Soc1982, 104, 289. (41) Ito, T.; Fraissard, J. J. Chem. Phys.1982, 76, 5225.
(42) Springuel-Huet, M. A.; Bonardet, J. L.; Gedeon, A.; Fraissard, J. Magn. Reson. Chem.1999, 37, S1.
(43) Weiland, E.; Springuel-Huet, M. A.; Nossov, A.; Gedeon, A. Microporous Mesoporous Mat.2016, 225, 41.
(44) Lerouge, F.; Melnyk, O.; Durand, J.-O.; Raehm, L.; Berthault, P.; Huber, G.; Desvaux, H.; Constantinesco, A.; Choquet, P.; Detour, J.; Smaihi, M. Journal of Materials Chemistry2009, 19, 379.
(45) Albert, M. S.; Schepkin, V. D.; Budinger, T. F. Journal of Computer Assisted Tomography1995, 19, 975.
(46) Bifone, A.; Song, Y.-Q.; Seydoux, R.; Taylor, R. E.; Goodson, B. M.; Pietrass, T.; Budinger, T. F.; Navon, G.; Pines, A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.1996, 93, 12932.
(47) Boutin, C.; Desvaux, H.; Carrière, M.; Leteurtre, F.; Jamin, N.; Boulard, Y.; Berthault, P. NMR Biomed.2011, 24, 1264.
(48) Bai, Y.; Wang, Y.; Goulian, M.; Driks, A.; Dmochowski, I. J. Chem. Sci.
2014, 5, 3197.
(49) Stevens, T. K.; Ramirez, R. M.; Pines, A. J Am Chem Soc2013, 135, 9576.
(50) Klippel, S.; Freund, C.; Schröder, L. Nano Letters2014, 14, 5721. (51) Wang, Y.; Dmochowski, I. J. Chem. Commun.2015, 51, 8982. (52) Bai, Y.; Hill, P. A.; Dmochowski, I. J. Anal. Chem.2012, 84, 9935. (53) Wang, Y.; Roose, B. W.; Philbin, J. P.; Doman, J. L.; Dmochowski, I. J.
Angewandte Chemie International Edition2016, 55, 1733.
(54) Schnurr, M.; Sloniec-Myszk, J.; Dopfert, J.; Schroder, L.; Hennig, A.
Angew Chem Int Edit2015, 54, 13444.
(55) Finbloom, J. A.; Slack, C. C.; Bruns, C. J.; Jeong, K.; Wemmer, D. E.; Pines, A.; Francis, M. B. Chem. Commun.2016, 52, 3119.
(56) Gilad, A. A.; Winnard, P. T.; van Zijl, P. C. M.; Bulte, J. W. M. Nmr Biomed2007, 20, 275.
(57) Shapiro, M. G.; Ramirez, R. M.; Sperling, L. J.; Sun, G.; Sun, J.; Pines, A.; Schaffer, D. V.; Bajaj, V. S. Nat. Chem.2014, 6, 629.
(58) Gilad, A. A.; McMahon, M. T.; Walczak, P.; Winnard, P. T.; Raman, V.; van Laarhoven, H. W. M.; Skoglund, C. M.; Bulte, J. W. M.; van Zijl, P. C. M. Nat. Biotechnol.2007, 25, 217.
(59) Waugh, J. S. Magnetic Resonance in Medicine1988, 7, 253.
(60) Keeler, J. Understanding NMR Spectroscopy, 2nd Edition; Wiley, 2010. (61) Richard R. Ernst, G. B., and Alexander Wokaun Principles of Nuclear Magnetic Resonance in One and Two Dimensions; Oxford University Press, 1990.
(62) Jeong, K.; Slack, C. C.; Vassiliou, C. C.; Dao, P.; Gomes, M. D.;
Kennedy, D. J.; Truxal, A. E.; Sperling, L. J.; Francis, M. B.; Wemmer, D. E.; Pines, A.
Chemphyschem2015, 16, 3573.
(63) Ripmeester, J. A.; Ratcliffe, C. I.; Tse, J. S. Journal of the Chemical Society-Faraday Transactions I1988, 84, 3731.
(64) Bouchiat, M. A.; Carver, T. R.; Varnum, C. M. Physical Review Letters
1960, 5, 373.
(65) Goodson, B. M. Journal of magnetic resonance2002, 155, 157.
(66) Happer, W.; Miron, E.; Schaefer, S.; Schreiber, D.; van Wijngaarden, W. A.; Zeng, X. Physical Review A1984, 29, 3092.
(67) Woolley, E. 2007.
(68) Cates, G. D.; Benton, D. R.; Gatzke, M.; Happer, W.; Hasson, K. C.; Newbury, N. R. Physical Review Letters1990, 65, 2591.
(69) Gatzke, M.; Cates, G. D.; Driehuys, B.; Fox, D.; Happer, W.; Saam, B.
Phys Rev Lett1993, 70, 690.
(70) Schröder, L.; Lowery, T. J.; Hilty, C.; Wemmer, D. E.; Pines, A. Science
2006, 314, 446.
(71) Ruppert, K.; Brookeman, J. R.; Hagspiel, K. D.; Mugler, J. P. Magn. Reson. Med.2000, 44, 349.
(72) Ward, K. M.; Aletras, A. H.; Balaban, R. S. Journal of magnetic resonance2000, 143, 79.
(73) Zhang, S.; Winter, P.; Wu, K.; Sherry, A. D. J Am Chem Soc2001, 123, 1517.
(74) McConnell, H. M. The Journal of Chemical Physics1958, 28, 430. (75) Zhou, J.; Zijl, P. C. M. v. Progress in Nuclear Magnetic Resonance Spectroscopy2006, 48, 109.
(76) Zaiss, M.; Schnurr, M.; Bachert, P. J Chem Phys2012, 136, 144106. (77) Caravan, P. Chemical Society Reviews2006, 35, 512.
(78) Shao, H. L.; Yoon, T. J.; Liong, M.; Weissleder, R.; Lee, H. Beilstein J Nanotech2010, 1, 142.
(79) An, M.; Wijesinghe, D.; Andreev, O. A.; Reshetnyak, Y. K.; Engelman, D. M. Proc Natl Acad Sci U S A2010, 107, 20246.
(80) Thevenin, D.; An, M.; Engelman, D. M. Chemistry & Biology2009, 16, 754.
(81) Vavere, A. L.; Biddlecombe, G. B.; Spees, W. M.; Garbow, J. R.; Wijesinghe, D.; Andreev, O. A.; Engelman, D. M.; Reshetnyak, Y. K.; Lewis, J. S.
Cancer Res2009, 69, 4510.
(82) Andreev, O. A.; Engelman, D. M.; Reshetnyak, Y. K. Mol Membr Biol
2010, 27, 341.
(83) Gillies, R. J.; Raghunand, N.; Garcia-Martin, M. L.; Gatenby, R. A. Ieee Engineering in Medicine and Biology Magazine2004, 23, 57.
(84) Lee, E. S.; Gao, Z. G.; Bae, Y. H. J Control Release2008, 132, 164. (85) Gillies, R. J.; Raghunand, N.; Karczmar, G. S.; Bhujwalla, Z. M. J Magn Reson Imaging2002, 16, 430.
(86) Martinez, G. V.; Zhang, X. M.; Garcia-Martin, M. L.; Morse, D. L.; Woods, M.; Sherry, A. D.; Gillies, R. J. Nmr Biomed2011, 24, 1380.
(87) Garcia-Martin, M. L.; Martinez, G. V.; Raghunand, N.; Sherry, A. D.; Zhang, S. R.; Gillies, R. J. Magnetic Resonance in Medicine2006, 55, 309.
(88) Zhang, S. R.; Zhou, K. J.; Huang, G.; Takahashi, M.; Sherry, A. D.; Gao, J. M. Chem. Commun.2013, 49, 6418.
(89) Huang, X. N.; Huang, G.; Zhang, S. R.; Sagiyama, K.; Togao, O.; Ma, X. P.; Wang, Y. G.; Li, Y.; Soesbe, T. C.; Sumer, B. D.; Takahashi, M.; Sherry, A. D.; Gao, J. M. Angewandte Chemie, International Edition in English2013, 52, 8074.
(90) Nwe, K.; Huang, C. H.; Tsourkas, A. J Med Chem2013, 56, 7862. (91) Crayton, S. H.; Tsourkas, A. Acs Nano2011, 5, 9592.
(92) Sheth, V. R.; Li, Y. G.; Chen, L. Q.; Howison, C. M.; Flask, C. A.; Pagel, M. D. Magnetic Resonance in Medicine2012, 67, 760.
(93) Zhang, S.; Merritt, M.; Woessner, D. E.; Lenkinski, R. E.; Sherry, A. D.
Acc Chem Res2003, 36, 783.
(94) Dorazio, S. J.; Olatunde, A. O.; Tsitovich, P. B.; Morrow, J. R. J Biol Inorg Chem2014, 19, 191.
(95) Hancu, I.; Dixon, W. T.; Woods, M.; Vinogradov, E.; Sherry, A. D.; Lenkinski, R. E. Acta Radiol2010, 51, 910.
(96) McMahon, M. T.; Gilad, A. A.; DeLiso, M. A.; Berman, S. M. C.; Bulte, J. W. M.; Zijl, P. C. M. v. Magnetic Resonance in Medicine2008, 60, 803.
(97) Chan, K. W.; Yu, T.; Qiao, Y.; Liu, Q.; Yang, M.; Patel, H.; Liu, G.; Kinzler, K. W.; Vogelstein, B.; Bulte, J. W.; van Zijl, P. C.; Hanes, J.; Zhou, S.; McMahon, M. T. J Control Release2014, 180, 51.
(98) Longo, D. L.; Sun, P. Z.; Consolino, L.; Michelotti, F. C.; Uggeri, F.; Aime, S. J Am Chem Soc2014, 136, 14333.
(99) Raftery, D. Annu Rep Nmr Spectro2006, 57, 205.
(100) Berthault, P.; Desvaux, H.; Wendlinger, T.; Gyejacquot, M.; Stopin, A.; Brotin, T.; Dutasta, J. P.; Boulard, Y. Chem-Eur J2010, 16, 12941.
(101) Meldrum, T.; Schroder, L.; Denger, P.; Wemmer, D. E.; Pines, A. Journal of magnetic resonance2010, 205, 242.
(102) Klippel, S.; Dopfert, J.; Jayapaul, J.; Kunth, M.; Rossella, F.; Schnurr, M.; Witte, C.; Freund, C.; Schrӧder, L. Angewandte Chemie, International Edition in English
2014, 53, 493.
(103) Klippel, S.; Freund, C.; Schroder, L. Nano Letters2014, 14, 5721. (104) Sloniec, J.; Schnurr, M.; Witte, C.; Resch-Genger, U.; Schroder, L.; Hennig, A. Chemistry--A European Journal2013, 19, 3110.
(105) Bai, Y. B.; Hill, P. A.; Dmochowski, I. J. Anal Chem2012, 84, 9935. (106) Schroeder, L.; Lowery, T. J.; Hilty, C.; Wemmer, D. E.; Pines, A. Science
2006, 314, 446.
(107) Meldrum, T.; Seim, K. L.; Bajaj, V. S.; Palaniappan, K. K.; Wu, W.; Francis, M. B.; Wemmer, D. E.; Pines, A. J Am Chem Soc2010, 132, 5936.
(108) Stevens, T. K.; Palaniappan, K. K.; Ramirez, R. M.; Francis, M. B.; Wemmer, D. E.; Pines, A. Magnetic Resonance in Medicine2013, 69, 1245.
(109) Subbarao, N. K.; Parente, R. A.; Szoka, F. C.; Nadasdi, L.; Pongracz, K.
Biochemistry-Us1987, 26, 2964.
(110) Nakaya, H. I.; Wrammert, J.; Lee, E. K.; Racioppi, L.; Marie-Kunze, S.; Haining, W. N.; Means, A. R.; Kasturi, S. P.; Khan, N.; Li, G. M.; McCausland, M.; Kanchan, V.; Kokko, K. E.; Li, S.; Elbein, R.; Mehta, A. K.; Aderem, A.; Subbarao, K.; Ahmed, R.; Pulendran, B. Nat Immunol2011, 12, 786.
(111) Nicol, F.; Nir, S.; Szoka, F. C. Biophys J1999, 76, 2121.
(112) Nishimura, Y.; Takeda, K.; Ezawa, R.; Ishii, J.; Ogino, C.; Kondo, A. J Nanobiotechnol2014, 12.
(113) Sasaki, K.; Kogure, K.; Chaki, S.; Nakamura, Y.; Moriguchi, R.; Hamada, H.; Danev, R.; Nagayama, K.; Futaki, S.; Harashima, H. Anal Bioanal Chem2008, 391, 2717.
(114) Nouri, F. S.; Wang, X.; Dorrani, M.; Karjoo, Z.; Hatefi, A.
Biomacromolecules2013, 14, 2033.
(115) Clever, H. L. Krypton, Xenon, and Radon: Gas Solubilities; Pergamon Press: Oxford, 1979.
(116) Zhang, X.; Lin, Y.; Gillies, R. J. Journal of nuclear medicine : official publication, Society of Nuclear Medicine2010, 51, 1167.
(117) Etzerodt, T. P.; Trier, S.; Henriksen, J. R.; Andresen, T. L. Soft Matter
2012, 8, 5933.
(118) Boutin, C.; Stopin, A.; Lenda, F.; Brotin, T.; Dutasta, J. P.; Jamin, N.; Sanson, A.; Boulard, Y.; Leteurtre, F.; Huber, G.; Bogaert-Buchmann, A.; Tassali, N.; Desvaux, H.; Carriere, M.; Berthault, P. Bioorgan Med Chem2011, 19, 4135.
(119) Li, W. J.; Nicol, F.; Szoka, F. C. Adv Drug Deliver Rev2004, 56, 967. (120) Piggot, P. J.; Hilbert, D. W. Curr. Opin. Microbiol.2004, 7, 579. (121) Setlow, P. J. Appl. Microbiol.2006, 101, 514.
(122) Rupnik, M.; Wilcox, M. H.; Gerding, D. N. Nat. Rev. Micro.2009, 7, 526. (123) Mock, M.; Fouet, A. Annu. Rev. Microbiol.2001, 55, 647.
(124) Driks, A. Mol. Aspects Med.2009, 30, 368.
(125) McKenney, P. T.; Driks, A.; Eichenberger, P. Nat. Rev. Micro.2013, 11, 33.
(126) Traag, B. A.; Driks, A.; Stragier, P.; Bitter, W.; Broussard, G.; Hatfull, G.; Chu, F.; Adams, K. N.; Ramakrishnan, L.; Losick, R. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A.
2010, 107, 878.
(127) Taylor, K. M. L.; Lin, W. J. Mater. Chem.2009, 19, 6418.
(128) Xu, H.; Rao, X.; Gao, J.; Yu, J.; Wang, Z.; Dou, Z.; Cui, Y.; Yang, Y.; Chen, B.; Qian, G. Chem. Comm.2012, 48, 7377.
(129) Cable, M. L.; Kirby, J. P.; Levine, D. J.; Manary, M. J.; Gray, H. B.; Ponce, A. J. Am. Chem. Soc.2009, 131, 9562.
(131) Oh, W.-K.; Jeong, Y. S.; Song, J.; Jang, J. Biosens. Bioelectron.2011, 29, 172.
(132) Stöckel, S.; Meisel, S.; Elschner, M.; Rösch, P.; Popp, J. Anal. Chem.
2012, 84, 9873−9880.
(133) Liu, G.; Bettegowda, C.; Qiao, Y.; Staedtke, V.; Chan, K. W. Y.; Bai, R.; Li, Y.; Riggins, G. J.; Kinzler, K. W.; Bulte, J. W. M.; McMahon, M. T.; Gilad, A. A.; Vogelstein, B.; Zhou, S.; van Zijl, P. C. M. Magn. Reson. Med.2013, 70, 1690.
(134) Youngman, P. J.; Perkins, J. B.; Losick, R. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A.
1983, 80, 2305.
(135) Bozue, J.; Moody, K. L.; Cote, C. K.; Stiles, B. G.; Friedlander, A. M.; Welkos, S. L.; Hale, M. L. Infect. Immun.2007, 75, 4498.
(136) Giorno, R.; Bozue, J.; Cote, C.; Wenzel, T.; Moody, K.-S.; Mallozzi, M.; Ryan, M.; Wang, R.; Zielke, R.; Maddock, J. R.; Friedlander, A.; Welkos, S.; Driks, A. J. Bacteriol.2007, 189, 691.
(137) Driks, A.; Roels, S.; Beall, B.; Moran, C. P.; Losick, R. Gene. Dev.1994,
8, 234.
(138) Zheng, L. B.; Donovan, W. P.; Fitz-James, P. C.; Losick, R. Gene. Dev.
1988, 2, 1047.
(139) Raftery, D. In Annu. Rep. NMR Spectrosc.; Elsevier Academic Press Inc: San Diego, 2006; Vol. 57, p 205.
(140) Ratcliffe, C. I. In Annu. Rep. NMR Spectrosc.; Elsevier Academic Press Inc: 1998; Vol. 36, p 123.
(141) Sunde, E. P.; Setlow, P.; Hederstedt, L.; Halle, B. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A.2009, 106, 19334.
(142) Ghosh, S.; Setlow, B.; Wahome, P. G.; Cowan, A. E.; Plomp, M.; Malkin, A. J.; Setlow, P. J. Bacteriol.2008, 190, 6741.
(143) Bowers, C. R.; Storhaug, V.; Webster, C. E.; Bharatam, J.; Cottone, A.; Gianna, R.; Betsey, K.; Gaffney, B. J. J. Am. Chem. Soc.1999, 121, 9370.
(144) Desvaux, H.; Dubois, L.; Huber, G.; Quillin, M. L.; Berthault, P.; Matthews, B. W. J. Am. Chem. Soc.2005, 127, 11676.
(145) Rubin, S. M.; Lee, S.-Y.; Ruiz, E. J.; Pines, A.; Wemmer, D. E. J. Mol. Biol.2002, 322, 425.
(146) Tilton, R. F.; Kuntz, I. D. Biochemistry-Us1982, 21, 6850.
(147) Rubin, S. M.; Spence, M. M.; Dimitrov, I. E.; Ruiz, E. J.; Pines, A.; Wemmer, D. E. J. Am. Chem. Soc.2001, 123, 8616.
(148) Kaieda, S.; Setlow, B.; Setlow, P.; Halle, B. Biophys. J.2013, 105, 2016. (149) Leuschner, R. G. K.; Lillford, P. J. Int. J. Food Microbiol.2001, 63, 35. (150) Isaacs, L. Chem. Commun.2009, 619.
(151) Lagona, J.; Mukhopadhyay, P.; Chakrabarti, S.; Isaacs, L. Angewandte Chemie International Edition2005, 44, 4844.
(152) Freeman, W. A.; Mock, W. L.; Shih, N. Y. J Am Chem Soc1981, 103, 7367.
(153) Hoffmann, R.; Knoche, W.; Fenn, C.; Buschmann, H.-J. Journal of the Chemical Society, Faraday Transactions1994, 90, 1507.
(154) Zolnai, Z.; Juranić, N.; Vikić-Topić, D.; Macura, S. Journal of Chemical Information and Computer Sciences2000, 40, 611.
(155) Kim, B. S.; Ko, Y. H.; Kim, Y.; Lee, H. J.; Selvapalam, N.; Lee, H. C.; Kim, K. Chem. Commun.2008, 2756.
(156) El Haouaj, M.; Luhmer, M.; Ko, Y. H.; Kim, K.; Bartik, K. Journal of the Chemical Society, Perkin Transactions 22001, 804.
(157) Buschmann, H. J.; Mutihac, L.; Schollmeyer, E. J Incl Phenom Macro
2005, 53, 85.
(158) Thomas, T.; Thomas, T. J. CMLS, Cell. Mol. Life Sci.2001, 58, 244. (159) Russell, D. H.; Russell, S. D. Clin. Chem.1975, 21, 860.
(160) Uriel Bachrach, Y. M. H. The Physiology of Polyamines; CRC Press, Inc, 1989; Vol. Volume 1.
(161) Gaboriau, F.; Havouis, R.; Moulinoux, J.-P.; Delcros, J.-G. Analytical Biochemistry2003, 318, 212.
(162) Tassali, N.; Kotera, N.; Boutin, C.; Leonce, E.; Boulard, Y.; Rousseau, B.; Dubost, E.; Taran, F.; Brotin, T.; Dutasta, J. P.; Berthault, P. Anal Chem2014, 86, 1783.
(163) Kim, K.; Selvapalam, N.; Ko, Y. H.; Park, K. M.; Kim, D.; Kim, J. Chem Soc Rev2007, 36, 267.
(164) Zhang, B.; Isaacs, L. J Med Chem2014, 57, 9554.
(165) Minami, T.; Esipenko, N. A.; Zhang, B.; Kozelkova, M. E.; Isaacs, L.; Nishiyabu, R.; Kubo, Y.; Anzenbacher, P. J Am Chem Soc2012, 134, 20021.
(166) Cheng, C. Y.; McGonigal, P. R.; Schneebeli, S. T.; Li, H.; Vermeulen, N. A.; Ke, C. F.; Stoddart, J. F. Nat. Nanotechnol.2015, 10, 547.
(167) Whitesides, G. M.; Grzybowski, B. Science2002, 295, 2418. (168) Browne, W. R.; Feringa, B. L. Nat. Nanotechnol.2006, 1, 25. (169) Wang, Y.; Dmochowski, I. J. Chem. Commun.2015, 51, 8982. (170) Kunth, M.; Witte, C.; Hennig, A.; Schroder, L. Chem. Sci.2015. (171) Demarquay, J.; Fraissard, J. Chem. Phys. Lett.1987, 136, 314.
(172) Sozzani, P.; Bracco, S.; Comotti, A.; Mauri, M.; Simonutti, R.; Valsesia, P. Chem. Commun.2006, 1921.
(173) Mugler, J. P., 3rd; Altes, T. A. J. Magn. Reson. Imaging2013, 37, 313. (174) Brotin, T.; Dutasta, J. P. Chem. Rev.2009, 109, 88.
(175) Klippel, S.; Freund, C.; Schröder, L. Nano Lett.2014, 14, 5721.
(176) Kim, K.; Selvapalam, N.; Ko, Y. H.; Park, K. M.; Kim, D.; Kim, J. Chem. Soc. Rev.2007, 36, 267.
(177) Walker, S.; Oun, R.; McInnes, F. J.; Wheate, N. J. Isr. J. Chem.2011, 51,