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H Variable Description and Coding

n el lote E (con mayor % de daño), se puede apreciar que la

e los atamientos sobre las poblaciones y comunidades bacterianas del o anterior indica que el pH, el contenido de materia orgánica, de humedad, de elementos nutrientes y el manejo de la nutrición vegetal, pueden determinar la actividad y diversidad de los microorganismos del suelo, la estructura de sus comunidades y la severi de daño por pat

época de muestreo.

El análisis de los datos por agrupamiento jerárquico mostró que las comunidades bacterianas en las diferentes épocas de cada lote son similares entre sí y diferentes entre tratamientos, mostrando que posiblemente éstos últimos influyen sobre la población y las comunidades bacterianas (figura 58).

época de muestreo.

El análisis de los datos por agrupamiento jerárquico mostró que las comunidades bacterianas en las diferentes épocas de cada lote son similares entre sí y diferentes entre tratamientos, mostrando que posiblemente éstos últimos influyen sobre la población y las comunidades bacterianas (figura 58).

E E

estructura de las comunidades bacterianas se agrupan de acuerdo con las épocas de muestreo, separándose la etapa vegetativa de la de bulbificación y maduración, lo que indica que existen diferencias en las comunidades de acuerdo a la época.

En el lote F, las comunidades bacterianas se agrupan de acuerdo con el tratamiento aplicado a las unidades experimentales, separándose el T3 de T2 y T1, indicando que hay efectos d

estructura de las comunidades bacterianas se agrupan de acuerdo con las épocas de muestreo, separándose la etapa vegetativa de la de bulbificación y maduración, lo que indica que existen diferencias en las comunidades de acuerdo a la época.

En el lote F, las comunidades bacterianas se agrupan de acuerdo con el tratamiento aplicado a las unidades experimentales, separándose el T3 de T2 y T1, indicando que hay efectos d

tr tr suelo. suelo. LL da

F

E

Figura 58. Agrupamiento jerárquico con base en la separación de

amplicons de rDNA 16S de Bacteria por DGGE.

Se representan los promedios obtenidos por tratamiento en las diferentes épocas de muestreo en los lotes E=Estancia y F=Flores.

El suelo es un sistema complejo con una gran variedad de micro- hábitat, caracterizados por propiedades físicas, químicas y biológicas particulares, con gran variabilidad espacio-temporal (Tôrsvik, 1994). El pH, los contenidos de materia orgánica en el suelo, la temperatura, la concentración de nutrientes y las prácticas de manejo pueden influenciar la actividad de los microorganismos del suelo y las estructuras de las comunidades microbianas (Singh

et al., 2006).

El análisis de correlación de Spearman (tabla 15) muestra como el pH del suelo, sodio, potasio intercambiable, densidad aparente, y la microporosidad, se correlacionan de forma directa con la riqueza bacteriana de estos suelos. Confirmando lo enunciado por Shing et

al (2006). Además se presentó relación inversa con el contenido de

materia orgánica

Tabla 15. Análisis de correlación de Spearman para la variable

Riqueza microbiana (Ra).

Variable r Pr>F pH 0,59 <0,0001 Materia Orgánica -0,68 <0,0001 K intercambiable -0,56 0,0004 Na intercambiable 0,58 0,0002 Densidad aparente 0,65 <0,0001 Microporos 0,69 <0,0001 Es de resaltar que para esta investigación, el lote E (con mayor

ontenido de materia orgánica) presento correlación inversa con la

que más del 80% de las bacterias se localizan en s microporos de microagregados del suelo (Mummey & Stahl,

ndo que el tipo de uelo es un factor preponderante en la organización de las

explicar las diferencias en queza bacteriana en los lotes en estudio.

omo se verá en el siguiente apartado, la diversidad microbiana las condiciones dadas por la c

riqueza bacteriana, situación que puede deberse al menor valor en el pH respecto a F, toda vez que el grado de acidez o alcalinidad influye sobre la actividad de los microorganismos, siendo las bacterias asociadas en mayor medida a altos valores de pH.

Se ha observado lo

2004). Por otro lado la granulometría del suelo puede determinar la estructura de la comunidad bacteriana, asociándose de preferencia a las fracciones arcilla y limo (Lambais et al., 2006).

Suelos con características similares, tienden a seleccionar comunidades bacterianas poco variables, indica

s

comunidades bacterianas (Lambais et al., 2006 citando a Gelsomino

et al., 1999). Las comunidades microbianas responden de forma

diferencial a factores como humedad, difusión de gases, temperatura, pH, textura, mineralogía, concentración de nutrientes, tenores de materia orgánica, vegetación, interferencias antrópicas, entre otros, lo que posiblemente puede

ri C

(bacteriana, en este caso), tiene alta relación con el daño producido por S. cepivorum. Posiblemente

descomposición de raíces y/o los exudados de la especie favorezcan en mayor medida a determinadas comunidades bacterianas.

El mayor % de daño se presentó en la época de máxima bulbificación y maduración (90 – 120 dds), lo que puede explicar las diferencias encontradas en el agrupamiento jerárquico, indicando que en la medida que el cultivo es afectado por S.

cepivorum, las comunidades bacterianas disminuyen posiblemente

or encontrar un substrato alimenticio específico que beneficia a algunas poblaciones y desfavorece a otras.

Lo anterior puede confirmarse con el hecho de que el T3 –que obtuvo el menor % de daño-, mostró los menores valores en riqueza bacteriana. Por tanto, podría decirse que el efecto que tiene el mal blanco en A. cepa, favorece el establecimiento de mayores comunidades bacterianas.

6.4.2. Variación del daño producido por S. cepivorum. La

interacción entre el ambiente, el hospedero y el patógeno determina la severidad con que la planta puede ser afectada. Por tanto, para que una enfermedad se desarrolle se debe presentar la interacción entre ambiente adecuado, planta susceptible y el patógeno con capacidad de producir infección (Aguirre y Piraneque,

eterminar las épocas de mayor severidad y el efecto de los p

2006 citando a Agrios, 1997 y Ávila, 1991).

En el presente apartado se evaluará el comportamiento del daño producido por S. cepivorum en los lotes en estudio, a fin de d

tratamientos sobre la misma (figura 59). Los datos fueron transformados por la expresión: Y = ArcSen

(

daño/100

)

a fin de satisfacer el supuesto de homostaticidad, aditividad y normalidad en la variable respuesta.

l análisis de varianza (tabla

E 16) mostró que en las diferentes épocas de muestreo se presentaron diferencias significativas entre tratamientos (Pr>F=0,0004) más no así entre lotes (Pr>F=0,0317). El Lote F y el T3 presentaron el menor promedio de daño (Y=7,505 y Y=3,93, respectivamente), mientras que el lote E y T1 mostraron el mayor promedio en la variable medida (Y=10,056 y Y=11,318, respectivamente).

Tabla 16. Análisis de medias repetidas de la varianza. Variable:

%Daño.

FUENTE DE

VARIACION GL SC Tipo III CM F Pr>F

LOTE 1 117,19805 117,198 6,75 0,0317 BLOQUE LOTE*BLOQUE 2 19,993144 9,99657 0,58 0,58 11,76 0,0041 2 21,412433 10,7062 0,62 0,5636 TRATAMIENTO 2 847,60254 423,801 24,41 0,0004 LOTE*TRATAMIENTO 2 408,43943 204,219 ERROR 8 138,90262 17,3628 4,00 6,00 8,00 10,00 12,00 14,00 D AÑO ( % 16,00 18,00 ) 8,00 10,00 12,00 14,00 16,00 18,00 DA Ñ O ( % ) E F

Figura 59. Variación del %daño producido por S. cepivorum.

Aguirre (2006), encontró respuestas similares a 0,00 30 60 90 120 DDS T1-1 T1-2 T1-3 T2-1 T2-2 T2-3 T3-1 T3-2 T3-3 0,00 30 60 90 120 DDS T1-1 T1-2 T1-3 T2-1 T2-2 T2-3 T3-1 T3-2 T3-3 2,00 4,00 6,00 2,00 la aplicación de los atamientos, pero reportó diferencias en la respuesta al daño entre

iodo evaluado, resentó mayor promedio en el 60% de las variables medidas de

ndo con lo reportado por Aguirre (2006). tr

lotes con características similares y pertenecientes a la misma área geográfica, lo que sugiere que existe alta variabilidad espacial y temporal del daño y que el manejo adecuado de la nutrición puede reducir la severidad con que S. cepivorum afecta a A. cepa.

Por otro lado, el T3, con menor daño en el per p

las cuales el 18,5% corresponden a variables medidas a nivel físico, el 30% pertenecen a la fase intercambiable, el 11% a la fase soluble y el 33% a tejidos (tabla 17).

Adicional a lo anterior, cabe resaltar que el T3 mostró el mayor número de esclerocios y mayor masa seca al final del periodo evaluado, coincidie

Tabla 17. Variables medidas en los tratamientos con mayor (T1) y

menor (T3) daño producido por S. cepivorum.

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