A
b
s
t
r a c
t
N i
c o
l
e
G
r e
g
o
ri
c u s
M
o n
i
t
o r
i
n
g
N
e u r o v
i
r u
l
e n
t
P
o
l i
o v
ir u s e s
in
t
h
e
A
m
e r
i
c a s
(
u nd
e rt
h
ed ir e c
ti
on
of
D
r .M
a rk S
ob
s ey
)
W
o rl d w i d
ep
ol io
e r ad i
c at
io n
d
ep
e nd
s o nh i
g
h
va
c cin
e c o v e r ag
e.W
h
e n v a c cin a
t
io n
d
e c r e a s es
,o
r al p
oUo
va c
cin
e c a nr e
v e rt t
o ne
u ro
vi
ru
l
en
t
p
ol i
o
vi
r u s a nd
c a
us e
o utb
re a
k
s,
a sw
a s r e c e nt
l
y
d
em
o n st
r at
ed
on
H i
sp
a ni
ola
.h
ith i
s st
ud
y
,w
em
on
i
t
o r ed f
o rp
ol io v
i
r u sin
w
at
e rs a
m p l
e s ob
t
ain
e
d fi
"o
m T
e x a s,H
ai
t
i
an
d
E
c u ad
o rb y
c el l
c ul
t
u r e o nR D
an
d
L
2 0B
c el l
s.P
o si
ti
v ep
ol i
o vir u s
i
s ol
at
e sw
e r eg
e n et
ic a
l l
y
ch
a r a ct
e ri
z ed
fo r
p
r e s um
ed
n e u r o vi
r ule n c e
m
a rk
e r sin c
l
ud in
g
a n am
in o
a
ci d
s ub
st
it
ut
i
o n at
p
o si
t
io n
14
3 in
V P l
a nd
a n u cl
e ot
i d
es u
b
st
it
ut
io n
at
p
o
si
t
i
o n4 8 1 i
nt
h
e5
'-U
T R
.
P
o
U
o vira
sw
a sd
et
e c
t
ed i
n s am
p l
e
sfi
rom
H
ai
ti
an
d
E
c u ad
o r,b
ut
n ot
i
n s am
p
le s
fr
om T
e x a s.A l l
s e r ot
y
p
e2
(
n=
7
)
a nd
s e r ot y p
e3
(
n=
l
)
i
s ol
at
e sg
r ew
at 4 0
°C
a nd i
nt
h
ep
r e s e n c e of S
ab i
n-n e u
t
r al i
zin
g
m
o n o cl
on
al
an
t
i b
od i
e s, a nd h
ad
m
ut
at
i
on
sin
th
e5
'U T R
an
d
V P
l
a s s o cia
t
ed w i
th
n e u r o vir u
l
e n c e.B
y
s eq
u e n ci
ng
,th
ec o
m p l
et
eV P l
g
e n e of
al l
st
r ain s
d
em
o n st
r at
ed
>
9 9
%
i d
en
ti
t
y
t
oS
ab in
s
tr a
i
n s.F
o u r s e r ot y
p
e2
st
r ai
n sfr
om
E
c u ad
o rw
e r e sh
ow
n
to
b
e n e u r o vir u
l
e n c ei
ntr a n s
g
en
i
cm
i
c e e xp
r e s si
ng
th
eD E D I
C A
T I
O N
I
w
o ul d l i k
et
od
ed ic a
te
t h
i
st h
e si
sto
m
y
m
om
,b
r ot
h
e r a nd
al
s ot
om
y
f
at
h
e rw
h
ow
at
ch
e sfr
om
ab
o v e.Y
o u r s up p
o rt
an
d
g
ui d
a n c eh
el
p
ed
m
ep
e r s e v e r et
h
r o ugh
t
h i
sj
o u r n ey
w h i
ch h
ad
a r o ck
y
st
a rt
.T
h
an
k y
o ut
r em
e nd
o u sl
y
fo r
t
h
el
o v e an
d
s up p
o rt
y
o uh
a v eg
i
v en
m
e.M
y
ad
v e nt
u r e s sh
al l
co
nti
n u e an
d I
a
m
e ag
e rt
o s e ew h
e
r et
h
e r o ad
sh
al l l
e a
d
.I
sh
al l b
et
el l i
ng t
h i
sw i
th
a si gh
S
om
ew h
e r e ag
e s a nd
ag
e sh
e nc
e :T w
o r o ad
sd i
v e rg
ed i
n
aw
o od
, a
n
d I
-I
t
o o
k
th
e o n e
le s s
t
ra
ve
l
e
d b y
,A
n
d
t
h
a
t
h
as
m
ad
e
al l
t
h
ed i ff
e r
e n c e.-
R
ob
e rt
F
r o st
A C K N O
W
L E D
G
E
M
E N T
S
I w
o ul d l i k
et
ot
h
a nk
M
a rk D
.So
b
s ey
f
o rth
e op p
o rt
u ni
t
y
an
d
r e s ea
rc
h
s up p
o
rt
du r
i
n
g
m y
st
ud ie s
at
U N C
.T
h
a nk
y
o uf
o rd i
r e ct
in
g m
et
oth
ep
ub l i
ch
e alt
h p
r oj
e ct
"t
h
at
i m p
a ct
sp
eo
p l
e,so
m
eth i
n
g b i g
"a s
I d
e s c ri b
ed
m
y
s el f w
an
t
in
g
t
o
w
o rk
o nd
u ri
n
g
o ne
of
ou
rfi
r st
m
e et
in
g
s.T h i
sp
r oj
e ct
h
a s an
"i
m
p
a ct
" an
d i
s s om
et
h i
n
g
"b i
g
, "b
u
t
i
sh
a s al
s oim
p
a ct
ed
m
e.T h
a
nk
y
o uf
o rt
h
e op p
o rtu n
i
t y t
ow
o rk
o nt
h i
sPo
l i
oE
r ad i
c at
io
nP
r oj
ec
t
,I
am
f
o r e v e rg
r at
ef
u
l
.M
y g
r at
i
tu
d
et
oD
r.J
a nV i
n
j
e.Y
o u r v a st
e xp
e ri
e n c ei
nm
ol
e c ul
a rb i
ol
og y
, c el l
c u
lt
u r e, a nd
m
o r ea r e
an
i
n v al
ua
b le
a
s s et
t
ot
h
e
U
ni
ve
r si
t
y
.I
k h
eb d
ea
fg
e
l
o
p
e nj
a r e
no
n
t
z et t
en
d
v e el k
e rm i
s op g
ed
a a n e nb
e
n u v e el d
a nk
v e r s ch
ul d i
g
d
v o o rd
e v el
eg
o ed
ea
d
vie z e n
d i
e um
eg
eg
e v e nh
e eft
.(
I h
a v e a c c om
p
l is
h
ed
ag
r e at
am
o un
t
in
m
y t
im
eh
e
r e an
d
I
ow
ey
o um y
si
n
c e r e st
g
r ad i
t
ud
ef
o ry
o u ri
n st
r u cti
o n)
.M
y d
e ep
e st g
r at
it
ud
e
t
o
D
o ug
W
ai
t
a nd D
o r ot
h y
T
h
om
p
s o n .D
o ug
,y
o ut
r ul
y
a
r eth
e"
r
o c
k
"i
nth
el
ab
t
h
at
k
e ep
s o u rl i
v e s al l
st
e ady w h
e nw
e a r ef
e el i
ng
o v e rw h
eh
n
ed w i
th l
ab
,s c
h
o ol
, a nd l i f
e.M
y
d
e ep
e st th
a nk
sf
o ry
o u rk
n
ow l
ed
g
ea
nd
ad
vic
e
y
o uh
a v ei
m
p
a rt
ed
o nt
om
ei
nt
h
ep
a st
fe
w
y
e a r s.A l
s o,t
h
a nk
y
o uf
o ry
o u rk
n ow l
ed
g
e a nd h
el
p
c o n c e nt
r at
i
ng
s a
m
p l
e s a nd f
o rte a c
h i
n
g
m
et
h
e r op
e s ab
o ut
c el l
c ul
t
u r e.D
o r oth
y
,t
h
an
k
y
o uf
o
ry
o u rp
at
i
en
c ew i
th
th
em
an
y
m
an
y
c el l
cu
lt
u r e o rd
e rs
th
at I p
r e s en
t
ed
t
oy
ou
at th
el
a st
m
i
n u
t
e.T h
an
k
y
ou
t
om
y
d
e a rf
ri
e nd
sw h
oh
a v eb
e e nm
y
"f
am
i l y
aw
ay
fr
om
h
om
e. "T
h
es
t
r e s s r eU
ef I
t
r ul
y
ap p
r e ci
at
el i k
et
h
eq
ui
ck
l y t
hr o
w
n
t
og
et
h
e rp
a rti
e s an
d d i
nn
e r s(
fr
en
e)
,n
i gh
t
s s al
s ad
a n cin
g
(
R
ay
et t
a a nd So n
n
i
e)
,g
a rd
e ni
ng
,h i k in
g
in
st
at
ep
a rk
s(
T
i i
n
a)
,m
o vi
en
i gh
t
s(
t
h
eg i
rls
)
,t
ri p
t
oC h
a rl
e st
o n(
S
j
on
,R
ad i
, an
d
T
i i
n a)
, an
d
m
o r e.T
h
an
k
y
o ut
ofo r
t h
en e v e r
-e n
d in
g
s up p
o rt
C h
ri
s.T
h
a nk
y
o um
y
f
am
i l
y
an
d
"e x
t
en
d
ed f
am
i l
y
"f
o ry
o u r su
p p
o rt
T A B
L E
O
F
C O N
T E N T
S
L I
ST O
F T
A B L
E
S
L I
ST O F
F I
G U R
E
S
L I
S
T
O
F
A B
B R E V I
A
T I
O N S
C h
ap
t
er
1
.IN T R O D U C
T I
O N
1
2
.S E L E C T
E D L I T
E
R
A
T
U
R
E
R E
V I
E
W
5
2
.1 P
ol i
o vi
r u sI
n
f
e ct
i
o n s5
2
.2 P
o
l i
o vi
r u s6
2
.3 E p i d
em
i
ol
og y
of
t
h
eD i
s e a s e7
2
.4 D
et
e ct
i
o nM
et
h
od
s9
2
.4
.1 I
nt
e rt y
pi
cd i f f
e r en
t
i
at
i
o n9
2
.4
.2 I
nt
r at y p
i
cd i f f
e r e nt
i
at
i
on
10
2
.5 P
r e v e nt
i
on
12
2
.5
.1 V
al i d
at
i
ng t
h
eO
P
V S
af
et y
1 5
2
.5
.1
.1
M
o nk
ey
an
d
M
i
c eN
e u r o vi
r ul
en
c eT
e st
i
ng
15
2
.5
.1
.2
M
ut
a nt
A
n
al
y
si
sP
ol
y
m
e r a s eC h
ai
nR
e st
ri
ct
i
on
E
n zy
m
eC l
e a v ag
e1
6
2
.6 E
r ad i
c at
i
o n of P
ol i
o vi
r u s1 7
2
.6
.1
O b
st
a cl
e sw i
t
h
E
r ad i
c at
i
o n19
2
.6
.2
M
o nit
o ri
ng
f
o rP
ol i
o vi
r u st
h
r ou
g
h
ou t t
h
eE
r ad i
c at
i
o nP
r o c e s s2 0
2
.6
.3 R
e c e nt
O
ut
b
r e ak
s a nd C i
r c ul
at
i
o n of P
ol i
o vi
r u s2 0
2
.7 E
n
vi
r
o nm
e nt
al S
u r v ei l l
an
c e2 1
3
.M
A T E
R
I A
L
S A N D
M
E
T
H O
D
S
2 6
3
.1 T
e x a s :S
t
ud y S i
t
e s2
6
3
.2 H
ai
t
i
:S
t
u
d
y
S i
t
e s2 6
3
.4
Sa
m
p
le
C
ol l
e ct
i
o n a nd V ir u s
C
o n c e nt
r ati
o n2
7
3
.5
C
el l C
ul t
u r e2 8
3
.6 R
e
v e r s eT
r a n s c ri
p t
i
on
-P
o
l y m
e r a s eC h
ain
R
e a ct
io n
(
R
T
-P
C R
)
2 9
3
.7 P
ol i
o vir u s a n
d S
e r ot y
p
eA
nt
i
s e r a3 0
3
.8 P
o ol
ed
M
o n o cl
o n al A
n
t
i b
od i
e s3 0
3
.9 D N A S
eq
u e n c eA
n
al
y
sis
3 0
3
.1 0
N
eu
r o vir u
l
e n c eT
e st
i
ng
3 0
4
.R E
SU
L T
S
3 6
4
.1 V i
r u sI
s ol
at
i
on
36
4
.2 I
n
t
r at
y p i
c
D i f fe
r en
ti
a
t
i
o n
(
I
T D
)
3 7
4
.2
.1 G
r ow
t
h
at
E l
e v ate
d T
em
p
e r atu r e
3 7
4
.2
.2
S
ab i
n-
n
e utr
a
l i
zi
ng
M
o n o cl
o n al A
n
t
i b
od i
e s3 8
4
.2
.3 N
u cl
e oti d
eS
eq
u e n ce
A
n
al
y
si
s of
V P l R
eg i
on
3 8
4
.3
M
a rk
e r s of N
e u r o vi
r ul
e n c e a nd N
e u r o vir u
le n c e
3 9
4
.4 S
um
m
a ry
4
0
5
.D I S C U S SI O N
4 6
5
.1
O
v e r vi
ew
4 6
5
.2 S
a
m p l i
n
g
4 9
5
.3 C
el l C
ult
u r e4 9
5
.4 T
e x a s50
5
.5
H
ai
t
i
5
0
5
.6 E
c
u ad
o r5 2
5
.7 R i
s
k
so
f V
a
ria
n
t
Po
l i
o vir
u s e s
5 3
5
.8 C h
a ra c
t
e ri
st
i
c so
f P
ol i
o vir
u sR i
sk
s
in
R
e
g i
o
n sSt
u
d i
ed
5 5
6
.C O N C
L
U S
I
O N S
6 0
7
.SU G G
E
ST
E D F
U
T U R E R E
S E A R C H
6 2
L I
S
T
O
F F I
G
U
R
E
S
2
.1 E g yp
t
ia n
l i
th
og
r ap h
2
.2
.D
e cl
i
n
e of P
ol
io
m
y
el
i
t
is
C
a s e sin
t h
eU
n
i
t
ed Sta
t
e s(
1 9 5 1
-
1 9 8 0
)
2
.3
S
e r ot
y p
eS
p
e ci f
i cP
ri
m
e r s2
.4 O
rg
a n
i
z at
i
o n of
th
eP
oUo v
i
r u sG
en
om
e2
.5 G l
ob
al
P
ol i
oSt
at
u sL I S T O
F T
A B L E S
3
.1
T
e x a s :D
e s cri
p t
io n
of S
ew
ag
eS
am
p
l in
g
Si
te s
3
.2
H
ai
t
i
:D
e s cri p
t
i
o n of S
t
r e am
W
ate r
S
am
p l i
ng S i
t
e s3
.3
E
c u ad
o r :D
e s cri
p
t
io n
of S
ew
ag
e an
d
W
ate r
Sa
m
p l
in
g
Si
t
e s3
.4 P ri
m
e r s
f
o r
V i
r
us
A
m
p l i fi
c a
t
i
o n
b y R T
-P C R
4
.1
C
el l C
ul
tu r e o
f V ir u s e s
fr
om
T
e xa
sSa
m
p l
e s4
.2 C
el l C
ul
tu r e
I
s ol
at
i
o n a nd
P
h
en
ot y
p i
cC h
a r a ct
eri
za
ti
on
of V i
r u s e sfr
om
H
ai
t
i S
am
p
l
e s4
.3 I d
e nt
i fi
c at
i
on
an
d
M
ol
e c ul
a
rG
e n et
i
cA
n
al
y
sis o
f P
ol i
o vi
r u s es
in
H
ai
ti
a nS
am
p l
e s4
.4 R
ef
e r e n c eP
ol i
o vi
m
sSt
r ai
n
s a nd
t
h
ei
rK
ey
M
ol
e c ul
a rG
en
et
i
cP
r op
e rt
ie s
4
.5 C
e
l l C
u
l
t
ur e
I
s
ol
at
i
o
n a nd P h
e
n ot
y p i
cC h
a r a ct
eri
z ati
o n of V i
r u s e sfr
om
E
c u ad
ori
a nSa
m
p l
e s4
.6
I
d
e nt
i fi
c at
i
o n a nd
M
ole c u
l
a rG
e n et
i
cA
n
al
y
si
s of
P
ol i
o vi
r u sI
s ol
at
e sfr
om
E
c u ado r
4
.7 R
ef
e
r en
c eP
oUo v
i
r u sS
tr a
i
n s an
d
t
h
ei
rK
ey
M
ol
e c ul
a rG
e n et
i
cP
r op
e rt
ie s
4
.8 N
e u r o vir u
l
e n c eM
i
c e
T
e st
in
g
of E
c u
ad
o rP
ol i
o vi
r us
I
s ol
at
e sL I
ST O
F
A
B B
R
E
V
I
A T
I
O
N
S
3 0 PV
th
r e ed
o s e s of
th
e o r al
p
ol i
o vir u s v a c c
in
eA
ad
en
i
n eA F
P
a c ut
efl
a c ci d
p
a r al
y
si
sB G
M
b
uf fa
l
og
r e en
m
o nk
ey
C
cy t
o si
n eC C
ID
c el l
c ul
t
u r ei
nf
e ct
iv
i
t
y d
o s eC D C
C
e nt
e r s of D i
s ea
se
C
o
nt
r ol
a nd Pr e
ve n
ti
o n ,U
n
i
t
e
d S
t
ate
s
C N S
ce
nt
r al
n e r v o u s sy
st
em
D N A
d
e o xy
ri b
o s en
u cl
eic a c
i d
D T
P
d i p h
t
h
e ri
a,t
et
an
u s,p
e rtu s s
i
sF
C S
f
et
al
c al f
s e r um
G
g
u an
i
n eI P
V
in a c
ti
v ate
d p
ol i
o vir u s v a c c
i
n
eI R
E S
in
t
e rn
al
ri b
o s om
e e nt
ry
si
t
e
I T
D
in
t
r at y p
i
cd i f f
e r e nt
ia
t
io n
L 2 0 B
m
o
u s eL
c el l
s e xp
re s
si
ng
t
h
eh
um
an
p
o
l i
o vi
r u s r e c ep
t
o rL
l i
t
e rM
A b
sm
o n o cl
o n al
an
t
i b
od i
e sm
g
m
i l l i
g
r am
m in
m
i
n
ut
es
m
L
m i l l i l i
t
e r
m
M
m
i l l im
ol
a rM
O
I
m
ul
t
i
p l
i
ci
t
y
of
i
nf
e ct
io n
N
I
D
sn
at
i
o n al i m
m
u niz a
t
i
o nd
ay
sO PV
o r al p
ol i
o
vi
r u s v a c ci
n eP A H O
P
an
A
m
e ri
c a nH
e al
t
h O
rg
a niz a
t
i
on
P
C
R
p
ol
y
m
e r a s e ch
ai
n r e a ct
io n
P
E G
p
ol y
et
h
y
le
n
eg l
y
c
ol
P
M
K
p
rim
a ry
m
o nk
ey
k i d
n ey
P V R
p
ol i
o vi
r u s r e c ep
t
o
rO P V
o r al p
o
l i
o
vi
r u s va
c ci
n eR
C T
r ep
r od
u
ct
iv
i
t y
c ap
a ci
t y
at
s
up
r a op t
im
al
t
em p
e r at
u r eR
D
rh
ab d
om
y
s a r c om
aR I V
M
N
at
i
o n al I
n st
i
t
ut
e of P
ub l i
cH
e al
t
h
a nd
t
h
eE
n vi
r o nm
en
t
R N A
ri b
o nu c
l
ei
c a ci d
R
T
r e
v e r s et
r a
n s c ri p
t
i
o nT
t
h
y
m
in e
U
u r a ci l
U T R
u nt
r a n sl
at
ed
r eg
i
o nV A PP
v ac c
in e
- as s o c
i
at
ed p
a
r al y
t
i
cp
o
l i
om y
eh
t
i
s
v
d
P
V
v a c cin e
-d
e ri
v ed p
ol i
o vir u s
C
H A
P T E
R
1
I N T R O D U C T I O N
P
ol i
om
y
el i
t
i
si
sn
e a rl
y
e r ad i
c at
ed w
o rl d w i d
e,b
ut
sp
o r ad i
c o ut
b
r e ak
s o c c u r a nd
e n
d
em
i
cp
e r si
st
e n c e c o nt
in u e s
in
c o u nt
ri
e sw i
t
h p
o o r v a c ci
n
e c o v e r ag
e.F
u rt
h
e rm
o r e,p
o o rv a c c
in e c o v e r a
g
ei
n c o im
t
ri
e s an
d
r eg
i
o n s cl
e a r ed
of w i l d
-t
y p
ep
ol i
o vi
r u s e s a r e st
i l l
at
ri
sk
of
h
a vi
n
g
t
h
el iv e
at t
e n u at
ed
v a c ci
n
e vir u s e s s e
ri
al l
y
i
nf
e ct
s u s c ep t
i b l
ep
op
ul
at
i
on
s an
d
r e v e rt t
on
e u
r o vi
r ul
e nc
eb y
m
ut
at
i
on
s o c c u rri
n
g
o v e rt
i m
e an
d w i
t
h
s u c c e s siv
e
p
a s s ag
ei
n
hu
m
a
nh
o st
s.T h
e s ed
ef
i cie n c
i
e s a r ep
r o vin
g
t
ob
ep
r ob l
em
at
i
cf
o rt
h
e e r ad i
c a
t
io n
p l
a n s et
b
y t
h
eW
o rl d H
e al
t
h
O
rg
a ni
z at
io
n
(W
H O
,2 0 0 2
)
.I
nd i
vi du a
l
s r e c eiv
i
n
g
t
h
e o r al
p
ol i
o vir u s v a c c
in e
(
O
P
V
)
w i l l
sh
e
d
t
h
e vi
r u si
nt
h
eir
fe c e s
an
d
r e ci
r c ul
a
t
i
o
n of
t
h
e s e sh
ed
vi
r u s e s c an o
c c u rb
y
t
h
ef
e c al
-o r al
r o ut
eb
ot
h
d ir e c
t
l
y
fr
om
p
e r s o n-t
o-p
e r s o n an
d
p
o s si b l
y
i
nd ir e c
t
l
y
b
y
c o n s u
m
p
t
i
o n of f
e c al l y
-c o nt
am i
na
t
ed w
at
e r.
A p
o
l io v
i
r u s of
v a cc
i
n e ori gi
n
b
ut
h
a
vi
ng
ap
e r c en
t
m
ut
at
i
on
>
1%
, c om
p
a r ed
t
ot
h
e ori g i
n al
v a c ci
n
e st
r ain
,i
s
a v a c cin e
-
d
eri
ve
d
p
ol io v
i
r u s(
vd
P
V
)
c on
si d
e r ed
t
op
r e s e nt
ap
ub l i
ch
e al
t
h ri
sk f
o rn
e u r o vi
r ul
e n c ei
n s u s c ep t
i b le
h
o st
s(
WH O
,19 9 7
)
.T
h
eA
m
eri
c a sw
e r ed
e cl
a r ed
p
ol i
o-fr
e e
in
19 9 3
,b
ut
fr
om
2 0 0 0
t
o2 0
0
1
a n o ut
b
r e ak
o n
t
h
e
i
sl
a nd
of H i
sp
a ni
ola
r e s ul
t
e
d i
n2 1
c on
fi
rm
ed
c
a s e s of p
ol i
om
y
el i
t
i
s,i
n cl
ud in
g
t
w
o
b
e en
p
e r si
st
e n t
in
t h
e en
vi
r on
m
e nt
an
d
am
o ng
t
h
ep
op
ul
at
i
o nf
o r on
et
ot
w
oy
e a r s,b
a s ed
o ns e
q
u en
c e an a
l y
s e s of
th
eV P l
c ap
si d g
e
n e(
K
ew
e t
al
.,2 0 0 2
)
.P
o o rp
op
ula
t
i
on
i
m m
u ni
t y
,d
u et
ol
a ck
o
f
v a cc
i
n e c o v e r ag
e
,p l
ay
ed
a ni m p
o rt
a nt
r ol
ei
nt
r an
sm i
s si
o n of
t
h
e vi
r u s an
d i
t
se v e n
tu
al
a cq
ui
sit
i
o n of
n e u r o vi
r ul
e n c et
r ait
s
(
K
ew
et
al
.,2
0 0 2
)
.N
o n-v a c c
i
n ep
ol i
o vi
r u s e s, o rt
h
o s ew i
t
h p h
e n ot y
p i
c o rg
e ne
ti
cd i f f
e re
n c e sfr
om
th
ev a c c
i
n e st
r ain
s, c a n ci
r c ul
at
ei
n aw
el l
-v a c ci
n at
ed
p
op
ul
at
i
o nw i
t
h
o rw i
t
h
o ut
cl i
n
i
c al
c a s e s(
B
o
t t
i
ng
e r et
al
.,1 9 9 2
;
H
o
vi
et
al
.,19 8 6
;
K
ew
et
al.
,199 3
;
P
oy
ry
et
al
.,19 8 8
;
R i
ch l
e r et
al
.,1 9
9
7 ;
Sl
at
e r et
al
.,19 8 8
;
Sw
a rt
z et
al
.,19 93
)
.E
r ad i
c ati
on
w i l l
on
l
y
b
ep
r o v e ni f b
oth
t
h
el
a ck
of
p
ol i
o
m
y
el i
t
i
s c a s e s an
d
n
eg
at
i
v e r e s ult
sfr
om
c on
t
i
n u
ed
su
r v ei l l
an
c ef
o rw i l d
-t y p
ep
ol i
o vi
r u s a r ed
o c um
e nt
ed
(M
a n o r et
al
.,
1
9 9 9
)
A
c ut
e
f l
a cc
i d
p
a r al
y
si
s(
A
F
P
)
s u r ve
i l l
an
c e c o n si
st
s of
c ol l
ec
t
i
n
g
sp
ec
i
m
e n sfr
o
m
al l
r e
p
o rt
ed
c a se
s of
A
F P
an
d
r ap i d l y
t
e sti
ng
th
e s e sp
e ci m
e n sf
o rp
ol i
o vi
r u s at
o n e of
t
h
eg l
ob
al
p
ol i
o vi
r u s n et w
o rk l
ab
o r at
o ri
e s(W
H O
,1
9 9 7
)
.M
et
h
od
s of
A
F P
s u r v ei l l
an
c e c ap
ab l
e of
d
et
e
ct
in
g
an
d
r ep
o rt
i
ng
n
on
-v a c ci
n
ep
ol i
o vi
r u s e s a r ew
el l
e st
ab l i
sh
e
d
an
d
A
F
P
s u r v ei l l
a n c es
h
o
ul d
c o nt
in
u em
a ny
y
e
a r sp
o st
e r ad i
ca
t
i
o n .E
n vi
r o nm
en
t
al
s u r v ei l l
an
c ei
s a vi
m
s-
d i
r e ct
ed
a
p p
r o a ch
t
o s u r v ei l l
a n c e,w h
e r e a s a c ut
ef l
a c ci d p
a r al
y
si
s(
A
FP
)
i
sa
c a s e -d i
r e c
t
ed
ap p
r o a ch
(
H
o v
i
et
al
.,2 0 0 1
)
.A
st
h
e
i
nc
i d
en c
e of p
ol i
om
y
el i
t
i
sa
p p
ro
a ch
e s z e r o, en
vi
ro
nm
e nt
al
s u r v e
i l l
an
c ei
sm
o r e s e n sit
i
v et
h
an
t
h
eA
FP
s u r v ei l l
a n c e(
H
o vi
et
al
.,2 0 0
1,
R
a nt
a et
al
.,2 0 0 1
;
T
am b i
ni
et
al
.,1
9 9 3
)
.D
et
e ct
i
ng p
ot
e nt
i
al l
y
h
a rm f
ul
n u e r o vi
r ul
en
t
st
r ai
n s of p
ol i
o vi
r u si
nth
e e n vi
r o nm
e nt
c a nl
e ad
t
od
e ci
si
o n st
oi m
m
u ni
z e a nd
,t
h
e r eb
y
p
o s si b l
y p
r e v e nt
a no u
t
b
r e ak
.A l
t
h
o ug h
th
eA
m
e ri
c a s a r e c on
si d
e r ed
"p
o
l i
o-fr
e e ,"
r e
g
i
on
sw i
t
h in
t
h
eA
m
e ric a s
w
e r e ch
o s e nf
o r st
ud
y
of
p
oli
o vi
r u s e si
n
en
vir o n
m
en t
al
s am
p
l
e s,e a c
h w i
th d i f f
e ri
ng
a nd
u ni q
ue
si
tu a
t
i
o
n s.T h
e se
r eg i
o n sw
e r e s c r ee
n ed f
o rth
ep
r e s e n ce o
f
v a c c
i
n
e-d
e r
iv e
d p
o
l i
o vir u s e s
.T
e x a sw
a s ch
o s e nb
e c a u s eit
h
ad
sw i
t
ch
ed
t
ot
h
ein a c
ti
v ated
p
ol
io v
i
r u s v a c cin e
in
J
a n u a ry 2 0 0 0
, o n ey
e a rb
ef
o r ew
at
e r a nd
s ew
ag
e s am
p
l
e sw
e
r e ob
t
ai
n
ed
f
o rt
h i
s st
ud
y
.T
h
e s am
p l
i
n
g
si
te s
w
e r e ch
o s e n al
o ng t
h
eU
n
i
t
ed S
t
ate s
's
i d
e of
t
h
eR
i
o
G
r an
d
eR i
v e rin
cl
o s e
p
r o xi
m
i
t
y
t
oM
e xi
c ob
e c a us e
M
e xic a n
a r e st
i l l
va
c ci
n
at
ed w i
t
h
t
h
eHv e
a
t t
en u a
t
e
O P V
va c c
i
n
e a nd
th
e r ef
o
re
vi
r u sm
i gh
t
b
ei
n
t
r od
u
c ed i
n
t
ot
h
eU
n
it
ed St
a
t
e sfr
om
M
e xi
c o.H
ai
t
i w
a s ch
o s e n a s af
ol l
ow
-up t
o a r e c e nt
o ut
b
r e ak w i
t
h i
nH i
sp
a ni
ola
,H
ai
t
i
a nd
th
eD
om
in
i
c a nR
ep
ub l i
c.T
h
e
o ut
b
r e ak
of
p
ol i
om
y
el i
t
i
sh
ad
o c cu
r r ed
t
h
e r ein
2 0 0 0
-
2 0 0
1
a nd
a
f fl i
ct
ed
at
l
e a st
2 1 i
nd i
vi d
u al
s,i
n cl
ud i
ng
t
w
of
at
al i
t
i
e s(
K
ew
et
ah
,2 0 0
2
)
.T
h
e o ut
b
r e ak w
a sc a u s e
d b y
a v a c cin e
-d
e riv e
d
t
y p
e1 p
o
l i
o vir u s
t
h
at
h
ad
tr a n
sm
i
t t
ed
si l
e nt
l y w i
t
h i
n ap
o o rl y
-v a c c
in a
t
ed
c om
m
u ni
t y
f
o r up t
ot w
oy
e a r s.T h i
sf
ol l
ow
up
st
ud
y
w
a sto
i
n
su
r et
h
at
no
l in
g
e rin
g
v a c ci
n
ed
e ri
v ed p
ol i
o vir u s s
tr a
i
n s r em
ain e
d i
n ci
r c ul
ati
o n.E
c u ad
o rw
a s ch
o s en
a sit
w
a sd
e
t
e rm i
n
ed
a c o u ntr
y
at
h i gh
ri
sk fo r
ap
ol i
o vir
u
s o utb
r e ak b
a s ed
o n ep i d
em i
olo
g i
c al
fi
nd i
ng
st h
at
i
n clu
d
ep
o o r v a c cin e
c o v e r ag
e a nd i
n ad
eq
u at
e r ep
o rt
i
n
g
of
a c ut
efl
a c ci d
p
a ra
l y
si
s
(
D
ay
an
e t
al
.,
2 0 0 3
)
.F i
nd i
ng
va
c ci
n e
-
d
e ri
v ed p
ol i
o
vi
r u se
sw i
t
h p
r o
p
e rti
e s of
c o
n
c e r n , s u ch
a sh i g h
m
ut
ati
o n
r at
e s a nd
n e
u r o vi
r ul
e n c em
a rk
e r sm
ay l
e ad
t
o a ne
nh
an
c ed
o rm
o r et
h
o r o ug
h i
m m
un
iz a
ti
o n c am
p
ai
g
n a nd p
o s si b l
y p
r e v en
t
an
o ut
b
r e ak
.T
h
e r e s e a r ch
ob
j
e ct
iv e s
f
o rt
h i
s stu
d
y
a r e :1.
T
od
ete r
m in e
w h
eth
e r e n vi
r o nm
e nt
al
s u r v ei l l
a n c eis a
b l
et
od
et
e ct
p
ol i
o vi
r u s e sin
r eg i
o n sw h
e r eth
eIP V w
as
r e c e nt
l
y
i
nt
r od
u c ed
(
T
e x a s)
,w h
e
r et
h
e r ew
a s a no
utb
r e ak w it
h i
nth
ey
ea
rw
a s
s el
e c
t
e
d f
o
rs
p
e c
i fi
c
ch
a ra c
t
eri
st
i
cs
re
l
at
ed
t
o va c c
in e
p
r ac
t
i
c
e s, va
c ci
n ec o
v e r ag
e
, a nd
p
o
t
e nti
al f
o rt
h
ep
r e s en
ce
of
m
ut
a
t
ed
v a c cin e
-d
e
ri
v ed p
o
l i
o vir u
s e
si
n co
m
m
u nit
i
e s.2
.P
ol i
o vi
r u s e sd
et
e ct
ed
a r et
ob
e ch
a r a ct
eri
z ed
a s v a c ci
n e o r n o n-v a c ci
n e st
r ain s
.St
a nd
a rd
m
et
h
od
sf
o r ch
a r a ct
eri
z at
i
o ni
n clu
d
e s eq
u e n c e a n al y
si
s of t h
eV
P l g
e n e a nd
c om
p
ari
ng
t
h
ep
e r c en
t
d
e
via
t
io n
w i
t h
i
nt
h i
sg
e n om
i
c re
g i
o nf
r om
t
h
e v a c ci
n
e str a
i
n
.A p
e r c en t
d
e vi
a
t
io n
fi
-o
m
th
e v a c ci
n
es
t
r ain
>
1
%
,b
a s ed
o n ap p
r o xi
m
at
el y 9 0 0
n
u cl
e ot
i d
e s,i
s ch
a r a ct
eri
z ed
a s an
o n-v a c c
i
n e st
r ai
n o r v a c ci
n e-d
eri
v e
d
p
ol i
o vi
r u s.3
.L
ab
o r at
o ry
m
eth
od
s s el
e ct
i
ng
ag
ai
n st
v a c ci
n e vi
r u s e s a nd f
o r v a c ci
n
e-d
eri
v ed m
ut
a nt
s(
s u
ch
a sn e
ut
r al i
za
t
i
o n e s c
ap
e an
d
e
l
e
v at
ed
t
em p
e
ra
t
u r eg
r ow
t
h
m
ut
an
t
s
)
a re
t
o
b
e em p l
o
y
ed
a n
d
e v alu a
t
ed
.T
h
e ch
a r a ct
eri
st
i
c s a s s o ci
at
ed w it
h
n o n
-v a c c
in e s
t
r ai
n
s of
p
ol i
o vi
r u sth
at
w i l l
b
e em
p
l
oy
ed
t
o s ele c
t
f
o rn
o n-v a c c
i
n
e st
r ain
si
n clu
d
et
h
e ab i l i
t y t
op
r op
ag
at
e at
el
e
v ated
t
em
p
e r at
u r e an
d i
nt
h
ep
r es
en
c e of
v a c cin e
C
H
A P T E R 2
SE L E C T E D L I T E R A T U R E R E V I E
W
2
.1 P
ol i
o vi
r u sI
nf
e ct
i
o ns
an
d
I
l l
n e s s e sP
ol i
o vi
r u s e sa
r et
r a n sm i
t t
ed b
y t
h
ef
e c al
-o r al
r o ut
e.
T h
ei
n c ub
at
i
o np
e ri
od
of
a ni
nf
e
ct
i
o n
r an
g
e s
fr
om 4
-3 5 d
ay
s,
b
ut
i
s
u s u al l y 7
t
o
14 d
a
y
s.T h
e
p
ri
m
a ry
si
t
e o
f i
n
f
e ct
i
o
ni
sl ym p h
o
i d
t
i
s
s ue
i
nt
h
e o
r al p h
a ry
nx
r eg i
o
na
nd
t
h
e
g
ut
.S
u
b
se
q
ue n
t
o r s e co n
d
a
ry i
n
v as
i
o n o
f
t
h
e sy
st
e
m
i
cl y
m
p h
n od
e s,b
o n em
a r r ow
,l i
v e r, an
d
sp
l
e e n c a nl
e ad
t
oi
n
v a si
o n of
t
h
e c e nt
r al
n e r v o u s s
y
st
em
(
C N S
)
.M
o st
i
nd i
vi d
u
al
s,
h
ow
e v e r, a r e ab l
et
oc
o nt
r ol
t
h
ei
nf
e ct
i
o nb
e
f
o r et
h
e vi
r u s r e a ch
e st
h
eC N S
(
K
ni
p
e,2
0 0
1
)
.A b
o ut
9 0
%
of w i l d p
ol i
o vi
r u si
nf
e ct
i
o n s a r es u
b
cl i
n
i
c al
o rm
i l d
.T h
e
m
ec
h
an
i
sm
b y w h i
ch p
ol i
o vi
r u s e nt
er s
t
h
eC N S i
s n ot
c e rt
ai
n
.V i
r em
i
a
i
s c ri
t
i
ca
l
f
o rt
h
e vi
r u st
o e nt
e rt
h
eC N S
.H
ow
e v e r, e xp
e ri m
e nt
al
st
ud i
e
s s up
p
o rt
i
n
v a si
o n of
t
h
ep
e ri p h
e r al
n
e r v e sb
y
p
ol i
o vi
r u s(
N
at
h
o n s o n et
al
,1
9 6 3
)
.C
on
s eq
u en
t
l
y
,p
ol i
o vi
r u si
nf
e ct
i
o nc a
n
al
s o
l
e ad
to
a s ep t
i
cm
en
i
ng
i
t
i
sw i
t
h
sy
m
p
t
om
si
n cl
ud i
ng
a st
i f f
n e ck
an
d b
a ck
.M
o st
d
am
a
g i
ng
a r ei
nf
e ct
i
on s
l
ea
d i
ng
t
o a sy m
m
et
ri
cfl
a c ci d p
a r al y
si
s,w h i
c
h i
s u s u al l y p
r e ce
d
e
d
Hi
b y
t
w
ot
ot
h
r ee
d
ay
so
f
n o sy
m
p t
om
s o r am
i
no
ri l l
n e ss
.(
K
n
i p
e,
2 0 0 1
)
.T h
em
o rb i d i
t
y
t
oi
n
f
e ct
i
on
r at
i
oi
s1
:1 0 0
t
o1
:1 0 0 0 d
ep
en
d
i
n
g
on
p
oU
ov
i
r u s s e r ot
y p
e(
H
ov
i
et
al
.A l l i
n
f
e ct
ed
in
d i
vi d
u
al
s, r eg
a rd l
e s s of
cl i
n
i
c al
sy
m
p
t
om
s,w i
l
l
e x c r et
eth
e vi
r u sin
th
e
i
r st
o ol
s
f
o
r ar
el
at
i
v el y l
o ng
t
im
e, us
u al l y
up
t
o si
xt
o ei g h
t
w
e ek
s
(
H
o vi
,2 0 0 1
)
.T h
ec o n c e n
t
r at
i
o n of
vi
r u si
n st
o ol
v a ri
e s,b
ut
b
e a sh i
g
h
a s10
^
c e
l l
c ult
u r ei
nf
e ct
i
o us
vi
r u sp
a rt
i
cl
e sp
e rg
r am
of
st
o ol
d
u ri
ng
th
ef
i
r st t w
ow
e ek
s of i
nf
e ct
i
o n.P
ol i
o vi
r u si
s al
s op
r e s e nt
i
nth
e o r op h
a ry
ng
al
r eg
i
o n ,b
ut
i
n am
u ch
l
ow
e r c o n c e nt
r ati
o n s(
H
o vi
,2
0 0
1
)
.Im
m
u n o c om
p
r om i
s ed i
nd i
vi d
u al
s, e sp
e ci
al l y
t
h
o s ew i
t
h B
-c e
l l
d
efi
c
ie
nc
i
e s
, a re
p
a
rt
i
c ul
a rl
y
at
ri
sk
of
p
ol i
o vi
r u si
nf
ec
t
i
o n a st
h
ey
c a nn
ot
m
o un
t
a s uf fi
ci
e nt
h
um
o r al im
m
u n er e
s
p
on
s et
ofi g h
t
a ni
nf
e c
t
i
on
an
d p
r e v e nt
vi
r em
i
c sp
r e ad
t
ot
h
eC N S
.V
a c cin
ep
r e ve
nt
i
on
s
t
r at
eg
i
e si
ni
ti
al l
y
ad d
r e s s ed im
m
u n od
efi
ci
e nt
i
nd i
vi d
u al
s a sb
ei
ng
at
h i
g h
ri
sk f
o r v a c ci
n
e-a s s o c
i
at
ed
p
a r al
y t
i
cp
ol i
om
y
el i
ti
s
(N i gh
t
i
ng
al
e,19 7 7
;
CD
C
,1 9
82
)
.N
ow i
t
is
e vi d
en
t t
h
at
im
n um
o c om
p
r om
i
s ed i
n
d i
vi d
u al
s c a n al
s o e x c r et
ep
ol i
o vi
r u sf
o r ap
r ol
o ng
ed
p
e ri
od
of
ti
m
ea
n
d w i
th
ah i
g
h
e rm
u
t
at
i
o n
r at
e(
K
ew
et
al
.,19 9 8
)
.O
n
e st
u
d y
sh
ow
ed
t
h
at
p
ol i
o vi
r u s st
r ai
n
si
s ol
at
ed fi
rom
th
e s am
ei
nd i
vi d
u al 18 9 d
ay
s ap
a rt
sh
ow
ed
am
ut
at
i
o n ra
t
e of 3
.4
%
i
nt
h
ec a
p
si d
g
e n e(
K
ew
et
al
.,19 9 8
)
.A
s su
m
i
ng
a c on st
a nt
m
u
t
ati
on
r at
e,it
w
a s e sti
m
at
ed
t
h
a
t t
h i
si
nd i
vi d
u al b
e c am
ei
nf
e ct
ed 9
.3
y
e a r s e a rl i
e r(
K
ew
et
al
.,
19 9 8
)
.O
t
h
e
r r ep
o rt
s al
s o n ot
ed
p
ro
l
o n
g
ed
ex
c r et
i
o ni
n
in
d i
vi d
ua
l
sw i
t
h B
-c el l d
e
fi
ci
en
cie
s,
b
u
t
o
nl y
u
p
to
3
.5 y
e
a r s(
D
o
w d l
ee
t
al
.,19 9 7
;
Y
o n ey
am
a et
al
,1
9 82
)
.2
.2
P
ol i
o vi
r u sP
ol i
o vi
r u si
s am
em
b
e r of
t
h
eg
e
n u sE
n
t
e r o vi
r u s e s of
t
h
ef
am
i l y P
i
c om
a vi
ri
d
a e o r"
s
m
al l
R
N
A
vi
r u s e s."