© 2 0 0 8
T
i
n aS
.L
u sk
A
L L R I G
H
T
S
R E
SE R
V E
D
A
B
ST
R A C
T
T
in a
L
u sk
:C
om
p
a ri
s o n of
F
iv e
M
et
h
od
sf
o rE
c ol
i D
et
e ct
i
o ni
nW
ate r :
T
h
e s e a r ch f
o r al
ow
-c o s
t
d
rin
k i
ng
w
at
e rt
e st
f
o r u s ein
l
ow
-r e s o u -r c e
(
U
nd
e rt
h
ed
i
r e ct i
o n of
P
r of
e s s o rM
a rk D
.S
ob
s ey
)
E
v e ry y
e a r1 8 m i l l i
o np
e op l
ed ie
fr o
m d i
a r rh
e al d i
s e a s e s(
i
n cl
ud i
ng
ch
ol
e r a);
9 0 %
a r e c
h i
l
dr e n
u nd
e r5
,m
o stl
y i
nd
e v el
op i
ng
c o u ntr
i
e sA p p
r o xi
m
ate
l
y
8 8
%
of
d i
a r rh
e al
d i
s e a s ei
s at t
ri b
ut
ed
t
o u n s af
ew
ate r
s up p
l
y
, a nd i
n ad
eq
u ate
s a nit
at
io n
a nd h
y g
ie n e
D
rin
k
i
ng
w
at
e rt
e st
s c u r r e nt
l
y
in
u s et
od
et
e ct
m i
c r ob
e si
nd i
c at
iv e
of f
e c al
c o n
t
am i
n at
i
o n of w
ate r r e
q
ui
r e e xp
e n siv e e
q
ui p m
e nt
a nd k
n ow
le
d
g
e ab l
ep
e r s o n n el
,b
o
t
h
of
w
h i
ch m
ay b
e u na
v ai l
ab l
ei
nm
o st
d
e v el
op i
ng
c o u nt
rie s a n
d i
nt
h
e af
t
e rm
at
h
o
f
n at
u r al d i
s a ste r s
.T
h
ep
u rp
o s e of
th
i
s r e s e a r ch w
a sto
i d
e nt
i f
y
al
ow
-c o s
t
m
ed
i
um
t
h
at
c o ul d b
e u s ed
t
o r el i
ab l
y
d
et
e ct E
. c ol
i
in
dr
in
k i
ng
w
ate r a
t
am
b i
e nt
in c u
b
at i
o nt
em p
e r at
u r e sw
i
t
h
o ut t
h
e u s e of
a nin c u
b
ato r
.F i
v ek
ey
c u r r e nt
l
y
a v ai la
b l
em
et
h
od
si
n cl
ud
i
ng
m
em b
r a n efi l
t
r at
i
o n u si
ng
M
I
ag
a r a nd
B i
o-R
ad
's
R
A
P I D E
c oli
ag
a r,3
M
P
etr
i fi l m
P
l
at
e s,C
ol i
s c a nE
a sy g
el
, a nd C
ol i l
e rt
Q
u a nt
it
r ay 2
0 0 0 w
e r e e x am i
n ed f
o rd
et
e ct
i
ng E
. c oli i
nd
rin
k i
ng
w
ate r
w
h
e n ap p l
ie
d
t
o sp i
k
ed w
at
e r s am
p
le s
.T h
es a
m
p
l
e sf
r om
e a ch
t
e st
w
e r e e v alu a
t
ed
at
6 i
nc
ub
at
i
o nt
em
p
e r at
u r es
(
2 0
,2 5
,3 0
,3
5
,4 0
, a nd
4 4
.5
d
eg
r e e sC
)
a nd
o v e r3
i
n c ub
at
i
o nt
i m
ep
e ri
od
s(
2 4
,
4
8
, a nd
1 2
0 h
o u r s)
u s
in
g
fi
v ed i f f
e r e nt E
c ol
i
str a
i
n s a sw
el l
a s s ew
ag
eW
it
h in
e a ch m
eth
od
, n os
i g
ni fi
c a nt
d i ff
e r e n c e sw
e r e n ote
d
a c r o s st
em
p
e r at
u r e s2 5
-4
5
°C
af
t
e r2 4 h
o u r si
n c ub
at
i
o n .P
etr
i fi l m
a nd
E
a sy g
el m
et
h
od
s r eq
ui
r e r ela
t
iv e
l
y
l i
tt
l
e eq
ui
p
m
e nt
a nd
t
e chn
i
c al
sk i l l
t
op
e rf
o rm m
ak in
g
th
em
e a sy
to
tr a n s
f
e rd
u ri
ng
c ap
a ci
t
y
b
ui
l
d
i
ng
.B
oth
m
et
h
od
s, e s
p
e ci
al
l y P
et
ri
fi
l
m
,d
e s e r v e ad
d
i
t
i
o n al
r e s e a r ch
i
nt
o ap p l i
c ab i
l
it
y i
nr e s o u r c e-
l i m i
t
ed
s ett
i
ng
s.A C
K
N O
W
L E D G E
M
E N
T
S
I
w
o ul d l i k
et
ot
h
a nk
D
r.M
a rk
S
ob
s ey
f
o rg
iv
i
ng m
et
h
e op p
o rtu
n
i
t y t
ow
o rk i
nh
i
sl
ab
a nd
t
od
ed i
c at
em
y
eff
o rts
t
o s u ch
aw
o rth w
h i
l
ep
r oj
e ct
T h
e e xp
e ri
e n c eh
a sb
e e no n e o
f
t
h
em
o st
ch
al l
e ng
in
g
a nd
m
e a ni
ng
f
ul
of m
y
l i f
e.D
r.S
ob
s ey
h
a sb
e e n a c o nt
i
n u o u ss
o u r c e of
s upp
o rt
a nd w is
d
om
w
h i
ch m
ad
e c om p l
et
i
o n of
th i
sp
r oj
e ct
p
o s sib l
e.I
al
so
g
r e at
l
y
ap p
r e cia
t
et
h
e s o u nd
adv
ic e
a nd
g
e n e r o u s a s si
st
a n c e of
c om
m
it t
e em
em b
e r sD
rL
o ui
s eB
al l
a nd
D
rC
h i p
Si
m m
o n s.I
'd l i k
et
oth
a nk D
r.C h
ri
st
in e
St
a ub
e rf
o rh
e ri
n v alu a
b l
eg
ui d
a n c ei
n al l
a r e as
of
t
h i
s r e s e a r ch f
r om
t
h
e v e ry
b
eg
i
n nin
g
I
w
a sl
u ck
y
t
oh
a v e s u ch
ap
at
i
e nt
a nd d
ed ic a
t
ed
m
e nt
o r .I
am
al
s o
v e ry g
r at
ef
ul
t
oD
o ug
a nd D
o r ot
h y f
o
r al l
t
h
eir
h
el p
, a nd
to
al l So
b
s
ey
l
ab m
em b
e r sw h
oh
el
p
ed m
e at
v a ri
o u sp
oi
nts
d
u ri
ng
m
y
t
i m
ei
nt
h
el
ab
.F i
n al l
y
,I
'd l i k
et o t
h
a nk
t
h
e cl
o s ef
ri
e nd
sI
'v e
m
ad
ew
h i l
ei
nC h
ap
el H
i
l l
, a sw
el l
a s
b
el
o v ed f
ri
e nd
s a nd fa
m i l
y
af
a r,f
o rbr
i
ng i
ng i
m m
e a s u r ab
l
ej
oy
t
om
y
li
f
e a nd w it
h
o ut
T A B
L
E
O
F
C O
N T E N T
S
1
.IN
T R O D
U
C T I O
N
A
.O
b j e c t i v e s
2
B
.E
x p e r i
m
e n t a l
D
e s i g n
3
R E
V
I E
W
O F
T H E L IT E R A
T
U R
E
4
A
.E
.c o L i
D
e t e c t i o n
M
e t h o d s i n
D
e v e l o p e d
C
o u n t r i e s
4
B
C
r i t e r i a f o r
L
o
w
-c o s t
D
r i n k i n g
Wa t e r
T
e s t F O R
E
.c o l i
6
i
.U
nit
c o st
9
i
i
.N
e ed f
o r s up p
le
m
e
nt
al
eq
ui
p
m
e nt
/
P
e rf
o rm
a n c e of m
et
h
od
s at
n o n-c o n v e n
ti
o n al
t
em
p
e r at
u r e s9
i i i
.N
e ed f
o r ele c
t
ri
cit
y
10
iv
.P
o rt
ab i
l i
t
y
/
c om
p
a ctn e s s
1 1
V
V
ol
um
e of
s am
p
l
et
h
ete s
t
a n al
y
z e s(
1
a nd
5
m
L
is
t
o o sm
al l
)
1 2
v
i
.R
e ad i l
y
d
et
e ct
ab
l
e e nd
p
oi
nt
13
v
i i
.E
a si l
y
vis u a
l i
z eE
c ol i
e nd p
oin
t
(
r a ng
e of
c o u nt
ab l
eCP
U
s)
14
v
i i
i
.Q
u a nt
i f ic a
t
i
o nm
et
h
od
16
i
x .1
st
ep
v sm
ul
ti
p
l
e st
ep
-
N
e ed f
o rt
r ain
i
ng
16
X.
C h
r om
ag
e n v sf
lu o r o
g
e n17
x
i
.Se n s
it
i
vi
t
y
17
x
i i
.S
p
e ci f
i ci
t
y
18
x
i i i
.P
r e ci
s
i
o n19
x
i
v .P
r e s e n c e/A
b
s e n c e2 0
c
.S
u
m m
a r y
2 1
3
M
A
T E
R
I
A
L
S A N
D
M
E
T H
O D
S
2 2
A
.E
s c h e r i c h i a
,c o l i s t r a i n s r e c e i v e d f r o
m
M
S U
2 2
B
.P
r e p a r a t i o n O F
P
u r e A N D
C
l o n a l
S
t o c k s
2 2
i
.P
u r eSto c
k
p
r ep
a r ati
o n2
2
i i
.C lo n a
l S
to c
k
p
r ep
a r at
io n
2
3
i i i
.W
o rk in
g
S
t
o ck
p
r ep
a r at
io n
2
3
c
.E
.c o L i
P
u r e
C
u l t u r e
P
r e p a r a t i o n
2 4
D
.Se
w
a g e
2 5
E
.P
r e p a r a t i o n O F
Sa
m
p l e
W
a t e r
2
5
F
.E
n u
m
e r a t i o n O F
E
.c o L i i N
T
e s t
W
a t e r
2
6
i
.M
em b
r a n eF
i l
tr a
t
i
o n2 8
i i
.I D E X
X C
ol
i
l
e rt
®
2 8
i i i
.3
M
™
P
et
ri f
il m
™
2 9
i
v .C
ol i
s c a n™
E
a sy g
el ®
2
9
G
.D
a t a
A
n a l y s i s
30
i
.S
ta
t
i
sti
c al A
n al
y
sis
A
c c o rd in
g t
oM
et
h
od
3
1
i
i
.St
at
is
ti
c al A
n al
y
sis
A
c c o
rd
i
ng
t
oT
em
p
e ra t
u r e3 2
i i i
.St
at
is
t
i
c al A
n al
y
si
sA
c c o rd in
g
to
I
n c ub
at
i
o nT
i m
e32
4
.R E
SU L
T
S
3 3
A
.E
.
c o L i
D
e t e c t i o n i n
S
e e d e d
W
a t e r f o r
a l l
T
e s t
S
t r a in s
C
o
m
b i n e d
3 3
i
.C
o
m
p
a ri
ng
M
et
h
o
d
s3 5
i
i
.I
n c ub
at
i
o nT
em
p
e r at
u r e3 7
i i i
.I
n c ub
at
i
o nT
i m
e3
9
i
v .E
. c ol i
S
tr a
i
n4
2
5
.D I
S
C
U S
S I
O N
4
8
A
.M
e t h o d
4
8
i
.P
et
ri f
il m
4 8
i i
.E
a sy g
el
5
0
i i
i
.C
ol i
l
e rt
5
1
i
vM
em b
ra
n ef
il
tr a
t
i
o n52
B
.I
n c u b a t i o n
T
e
m
p e r a t u r e a n d
T
i
m
e
5
3
c
E
.C O L I
S
t r a i n
5 4
D
.C
o
m
p a r i s o n O F
C
h a r a c t e r i s t i c s O F
E
.c o l i
D
e t e c t i o n
M
e t h o d s
5
5
i
.C
o st
a nd U
s ei
nF i
el d
5
7
i i
.U
s e of
M
et
h
od
sf
o rR
eg
ul
at
o ry
C
om
p
l i
a n c e5
8
6
C O N C
L
U S
I
O N S
6 1
A
.M
e t h o d
6 1
B
T
e
m
p e r a t u r e
6
1
c
.T
i
m
e
6 2
D
.E
.C O L I s t r a in
6 2
A
P P E
N
D I
X
6 4
R E F E R E
N C
E
S
6 6
L I S T
O
F T
A
B L E S
T
ab l
e1 C
ri
t
e ri
af
o rlo
w
-c o st
si
m
p l
ed
ri
n
k i
ng
w
at
e rt
e st
f
o r£
■
c o
l
i
8
T
ab l
e2
.E
l
e ctr
ic
i
t y
n e ed
s of 5 E
c o/z
de
t
e ct
io n
m
et
h
od
s1
1
T
ab l
e3
.E
c oli
st
r ai
n si
n clu
d
ed
i
nt
h
e st
ud
y
2 2
T
ab l
e4
M
et
h
od
s,E
c oli
str a
i
n s, a nd
i
n c ub
ati
o nt
em
p
e r atu r e s
i
n cl
ud
ed i
nt
h i
s st
ud
y
2 7
T
ab l
e5
.D
et
ai l
s of
ad
j
u st
m
e nt
of
T
N
T
C
v alu e s
3
0
T
ab l
e6 Su
m m
a ry
of
D
ata
A
n al
y
sis
P
e rf
o rm
ed
-
B y
V
a ri
ab l
e3 1
T
ab
l
e7
.S
um m
a ry
of
S i g
ni f
i c a nt
D i f f
e r e n c e si
nE
c ol i
C
o n c e nt
r at
i
o n sb
etw
e e nPa
ir
-w i
s eC
om
p
a ri
s o n s of
M
et
h
od
sf
o rA l l
T
em
p
e r at
u r e sT
e ste
d
(
m
ed i
a nd i f f
e r e n c ef
o r al l
th
r e ei
n c ub
at
i
o np
e ri
od
s)
3 6
T
ab l
e8 Su
m m
a ry
of Si g
ni f
i c a nt D
i f f
e r e n c e si
nE
c oli
C
o n c e nt
r at
i
o nb
etw
e e nP
air
-w i
s e
C
om
p
a ri
s o n s of
M
et
h
ods
f
o r al l T
em
p
e r atu r e s
(
m
ed i
a nd i f f
e r e n c ef
o r al l
t
h
r e ein c u
b
ati
o np
e ri
od
s)
-E
xp
e ri m
e nt
sw i
t
h m i
s si
ng
v al
u e s r em
o v ed
3
7
T
ab l
e9
.K
r u sk
al
W
al l i
ste s
t
f
o rd i f f
e r e n c e sin
E
c ol
i
c o n c e nt
r at
i
o n sa
m
o ng
in c u
b
ati
o nte
m
p
e r at
u r e s(
f
o r al l m
eth
od
s,w i
th
a nd
w
it
h
o ut
2 0
"C
)
3 9
T
ab l
e1
0
.C h
a r a ct
e ri
st
i
c s of
E
c ol
i D
et
e ct
i
o nM
et
h
od
s5
6
L I
S
T
O
F F I
G
U
R
E S
F
i g
u r e1
.A
v e r ag
eC
F
U / m L
-
A
l l F i
v eM
eth
od
s-A l l Si
xT
em
p
e r at
u r e s-
2 4 H
ou
r s3 4
F
i
g
u r e2
A
v e r ag
eC
F
U / m
L
-
A
l l
F
iv e
M
eth
od
s-A l l S i
xT
em
p
e r at
u r e s -4 8 H
o u r s3 4
F i
g
u r e3 A
v e r ag
eC
F
U /m
L
-
A
l l
F i
v eM
et
h
od
s-A l l Si
xT
em
p
e r at
u r e s-
12 0 H
o u r s34
F i g
u r e4
.A
v e r ag
eE
c ol
i
c o n c e nt
r at
io
n s(
al l
st
r ain s
)
b
y
M
F
o nM
I A g
a rf
o r al
l
i
n c ub
at
i
o nt
em
p
e r atu r e s a n
d
t
i
m
e s4 1
F
i g
u r e5
.A
v e r ag
eE
. c ol
i
c o n c e nt
r at
io
n s(
al l
str a
in s
)
b
y B
i
oR
ad
A
g
a rm
et
h
od f
o r al l i
n c ub
at
i
o nt
em
p
e r at
u r e s a nd
t
i m
e s4 1
F
i
g
u r e6
A
v e r ag
eE
, c ol
i
c o n c e nt
r at
i
o n s(
al l
st
r ai
n s)
b
y C
ol
i l
e rt
m
et
h
od f
o r al
l
i
n c ub
at
io n
t
em
p
e r at
u r e s a nd
t
i m
e s4 1
F i
g
u r e7 A
v e r ag
eE
. c ol
i
c o n c e nt
r at
i
o n s(
al l
st
r ain s
)
b
y
P
et
ri f
il m m
et
h
od f
o r al l
in c u
b
ati
o nt
em
p
e r at
u r e s a nd
t
i m
e
s4 1
F i g
u r e8
.A
v e r ag
eE
. c ol
i
c o n c e nt
r at
i
o n s(
al l
st
r ain s
)
b
y E
a sy g
el f
o r al l i
n c ub
at
i
o nte
m p
e r at
u r e s a nd
t
i m
e s4 1
F
i g
u r e9 A
v e r ag
eE
c ol
i
(
C F
U /m
L
)
,A
c r o s sA
l l
T
i m
e s a nd
T
em
p
e r at
u r e s,b
y S
t
r ai
n4 3
1
.I
nt
r od
u ct i
o nE
v e ry y
e a r1
.8 m i l l i
o np
e op
l
ed i
ef
r om d i
a r rh
e al d i
s e a s e s(
in c
l
ud in
g
ch
ole r a
);
9 0
%
a r e ch i l d
r e n u nd
e r5
,m
o st
l
y
in
d
e v el
op
i
ng
c o u nt
ri
e s .A
p p
r o xi m
at
el
y
8
8
%
of
d
i
a r rh
e al
d
i
s e a s ei
s at tr
i
b
ut
ed
t
o u n s af
ew
at
e r s up p
l
y
, a nd i
n ad
eq
u at
e s a ni
t
at
i
o n a nd
h
y g
i
e n eA d d
i
t
io n a
l l
y
,d
u rin
g
th
e af
t
e rm
at
h
of
a n at
u r al d i
s a st
e r s u ch
a st
h
eP
ak
i
st
a ne a r
t
h
q
u ak
e,t
h
eA
si
a nts u n a
m i
o rt
h
eU S G
ul f
c o a st H
u r ric a n e
K
at
rin a
, c o nt
am i
n at
ed
d
rin
k
i
ng w
ate r
h
a st
h
ep
ot
e nt
i
al
t
o cl
ai m m
a ny
l i
v e s of
th
o s ei
n v ol
v ed i
nt
h
ed i
s a st
e r.T
h
e r e a r em
a ny w
at
e rt
e sts a v a
i l
ab l
et
om
o ni
t
o rd
ri
nk in
g
w
at
e r;
h
ow
e v e r,th
ew
at
e rt
e st
sc u r r e n
t
l y i
n u s eto
d
et
e ct
m i
c r ob
e s(t y
p i
c al l
y
e nte r
i
cb
a ct
e ria
)
i
nd i
c at
i
v e of f
e c al
c o n
t
am i
n ati
o n of
w
at
e r a r e u s ed
p
ri m
a ri l
y
b
y
d
e v el
op
ed
c o u nt
rie s
.T
h
et
e st
s r eq
ui
r ee x
p
e n si
v e eq
ui
p
m
e nt
a nd k
n
ow
le
d
g
e ab l
ep
e r s o n n el
,b
oth
of w h i
ch m
ay
b
e s c a r c e o ru n a v a
i l
ab l
ein
m
o st
d
e v elo
p
i
ng
c o u nt
ri
e s a nd i
nt
h
e af
t
e rm
ath
of
n at
u r al d i
s a st
e r s.O
n e of
th
ele a s
t
a c c e s si b l
e a nd m
o st
e xp
e n si
v eit
em
s r eq
ui
r ed d
u ri
ng t
h
ep
e rf
o rm
a n c e of d
rin
k i
ng
w
at
e r a n al
y
si
sf
o rf
e c al b
a ct
e ri
ai
s a nin c u
b
at
o r,w
h i
ch
al l
ow
si
nd i
c at
o rb
a cte r
i
a, s u ch
a sE
. c oli
,
t
og
r ow
f
o r ap
r ed
et
e rm i
n ed
am
o u nt
of
ti m
e at
a s et
t
em
p
e r atu r e
(
3
5
°C
)
a nd
th
e r e s ult
i
ng g
r ow
th
q
u a nt
i
f
i ed
.I
f
am
et
h
od
c o ul d b
ef
o u nd
t
h
at
a
l l
ow
ed f
o rt
h
eE
c ol
i
i
nth
e s am
p
l
et
ob
eg
r ow
n at
r o om
o r am b i
e nt
t
em
p
e r at
u r ei
nl
oc
at
i
o n sw
i t
h
aw
a rm
cl i m
at
e,th
e n a nin c u
b
at
o rw
o ul
d
n ot
b
e n e c e s s a ry
f
o rth
ep
e rf
o rm
a n c e of
t
h
e a s s ay
,t
h
u si
n c r e a si
ng
a c c e s s a nd
r ed
u cin
g
c o st
c o n si d
e r ab l
y
N
um
e r o u s st
ud ie s
h
a v eb
e e np
e rf
o rm
ed
c om
p
a ri
ng
v a ri
o u sm
et
h
od
s u s ed
t
od
et
e ct
E
. c ol i i
nd
ri
nk i
ng
w
at
e r(
E
ck
n e r,
1 9 9 8 ; H
o rm
a n&
H
a n ni
n e n,2
0 0 6
)
.H
ow
e v e r,l i
t tl
er e s e a r c
h h
a sb
e e n c o nd
u ct
ed
c om
p
a ri
ng t
h
ep
e rf
o rm
a n c e of
v a ri
o u sm
eth
od
s a nd m
ed i
a at
h
a sb
e e np
e rf
o rm
ed
c om
p
a ri
ng
t
h
ep
e rf
o rm
a n c e of w
el l
-k
n o
w
nE
c ol
i
d
ete c
t
i
o nm
et
h
od
sa
t
r o om
t
em
p
e r at
u r ei
n c ub
at
i
o n .T
h i
sl i
n e of
r e s e a r ch i
s a c ri
t
i
c al
st
ep f
o rt
h
ed
e v el
op
m
e nt
of
a si m p l
e,l
ow
-c o s
t E
c ol
i
d
et
e ct
i
o nm
et
h
od f
o rd
ri
nk i
ng
w
at
e r.T
h
i
sp
r oj
e ct
e v al
u at
e sfi
v eE
c ol i d
et
e ct
i
o nm
et
h
od
s a st
ot
h
ei
r s ui
t
ab
i l it
y
t
ob
eu s e
d i
n r e s o u r c e-p
o o r s et t
i
ng
s.Sp
e ci
f
i c al l
y
,t
h
ep
e rf
o rm
a n c e of
t
h
em
et
h
od
s at
n o n ¬s
t
a nd
a rd i
n c ub
at
i
o n c o nd
i
t
i
o n sw
a s a s s e s s ed
to
d
ete r
m i
n ei f
p
e rfo r
m
a n c e at
n o n-st
a nd
a rd
c o n
d i
t
i
o n s a r e si m i l
a rt
o st
a nd
a rd i
n c ub
at
i
o n c o nd i
t
i
o n s,t
h
e r eb
y
n eg
at
i
ng
t
h
e n e ed f
o r a ni
n c ub
at
o r a nd
l
ow
e ri
ng
a n al
y
si
s c o st
s co
n si d
e r ab
l y
.Si
x(
6
)
d i f f
e r e nt E
c ol i
str a
i
n sw
e r ee v
a
l
u at
ed
a sw
el l
a s s ew
ag
et
og
ai
nk
n ow l
ed
g
e of
t
h
e ef f
e ct
s of
str a
i
n st
h
at
m
ay
b
ep
r e s e nt
i
nt
h
e e n vi
r o nm
e nt
a nd
i
nw
ate r s a
m
p
l
e s o nm
et
h
od
p
e rf
o rm
a n c ea.
O
b
j
e ct i
v e si
.T
od
et
e rm i
n et
h
e u s ab i l i
t y
of
al
t
e r n at
i
v el
ow
c o st
m
et
h
od
sf
o rc u
l
t
u r eq
u a nt
i fi
c at
i
o n of
E
. c ol
i
i
n c o nt
am i
n at
ed
w
at
e r si i
.T
od
et
e rm i
n et
h
ei
n c ub
at
i
o nte
m
p
e r at
u r e r a ng
e of
E
. c ol
i
t
e st
i
ng
b
.E
xp
e ri
m
e nt
al D
e si g
ni
E
x am i
n e5 k
ey
c u r r e ntl
y
a
v ai l
ab l
em
et
h
od
s a nd
t
h
ei
rm
ed ia
f
o rd
et
e ct
in
g E
. c ol
i
i
nd
rin
k
i
ng w
at
e r(
2
b
r oth
,2
ag
a r(
m
em b
r a n ef
il
tr a
t
io n
)
a nd
2
n on
-tr a
d i
ti
o n al m
et
h
od
s)
w h
e n ap p
l i
ed
t
o sp
ik
ed
w
at
e r s am
p
l
e si i
.E
v alu a
t
eE
c ol
i
g
r ow
t
h b y
e a ch
te s
t
at
6
t
em
p
e r at
u r e s(
2 0
-4
5
d
eg
r e e sC
)
a nd 3 i
n c ub
at
i
o nt
i m
e s(
2 4
,4 8
, a nd 12
0 h
o u r s)
i i i
E
v al
u ate
th
eg
r ow t
h
of
v a ri
o u sh
um
a n , a ni m
al
a nd
e n vi
r o nm
e nt
al
s
t
r ain s o
f
E
. c ol
i
(
r a ng i
ng f
r om
"
c
l
a s si
c al
" str a
i
n s s u ch
a sE
. c ol
i
B
t
o str a
in s r e c e n
t
l
y i
s ola
te
d f
r om
n at
u r al
w
at
e r sin
th
e e n vi
r o nm
e nt
)
i
v.T
o a s s e s st
h
efi
el d
ap p l i
c ab i l i
t y
of
t
h
em
et
h
od
si
n r e s o u r c e-p
o o r2
.R
e vi
ew
of t h
eL i t
e r at
u r eW
at
e rb
om
ed i
s e a s e o ut
b
r e ak
sh
a v el
o ng p
o s ed
a ch
al
l
e ng
et
oh
um
a n s a si l l
u st
r at
ed i
nt
h
efi
r st
s ci
e nt
i fi
c al l
y
d
o c um
e nt
ed
c a s ei d
e nt
i f
i ed i
nL
o nd
o n,E
ng l
a nd i
n1 8 5 4
J
oh
nS
n ow
, al
o c al p h y
si
ci
a n,t
r a c ed
t
h
e sp
r e ad
of
ch
ol
e r ab
a ck
t
o aw
at
e rp
um
p
c o n
t
am i
n at
ed w i
t
h
s ew
ag
e.(
N
ew
s om
,
2 0
0 6
)
.W
ek
n ow
n ow
t
h
at t
h
ei l l
n e s sw
a s c a u s ed
b
y
m i
c r ob
e si
nt
h
ew
at
e ri
nt
r od
u c ed w i
t
h
t
h
e s ew
ag
e, a nd
t
h
at
d i
s e a s e- c a u s
i
ng
m i
c r ob
e sm
u st
b
e n e ut
r al i
z ed
o r r em
o v ed f
r om d
ri
nk
i
ng
w
at
e r.T h
o ug h
m
u ch
ad
v a n c em
e nt
i
ns a n
i
t
at
i
o n a nd d
ri
nk i
ng
w
at
e rt
r e at
m
e nt
t
o r em
o v em i
c r ob
e sh
a s c om
e ab
o ut
i
nt
h
eU
ni
t
ed
S
t
at
e s si
n c et
h i
si
ni
t
i
al
st
ud
y
, n um
e r o u sw
at
e rb
om
e o ut
b
r e ak
sh
a v e st
i l l
o c c u r r ed d
e sp
i
t
eo u r
b
e st
ef f
o rt
s.T
h
el
a rg
e st
d
o c um
e nt
ed w
at
e rb
om
e-
d i
s e a s e o u
t
b
r e ak i
nU
.S
.h i
st
o ry
o c c u r r e
d i
nM
i lw
a uk
e e,W
i
s c o n si
ni
n19 9 3
.O
v e r4 0 3
,0 0 0
p
e op l
e,2
5
%
of
t
h
e ci
t y
'
s
p
op
ul
ati
o n,b
e c am
ei l l
f
r om
e xp
o s u r et
oC
ry p
t
o sp
o ri d i
um
c o nt
am i
n at
i
o ni
nt
h
ei
rd
ri
nk
i
ng
w
at
e r s up p
l
y
(
M
a cK
e n zi
e et
al
,1
9 9
4
)
A
st
h i
s c a s e sh
ow
s, o ut
b
r e ak
s st
i l l
o c c u r e v e nw i
t
h
t
e ch
n ol
og
i
c al l
y
ad
v a n c ed
t
r e at
m
e nt
sy
st
em
si
np
l
a c eH
ow
e v e r ,i
t i
sth
o s ei
nr e s o u r c e
-p
o o r s et t
i
ng
st
h
at
a r em
a ny
t
i m
e sl
ef
t
ut t
e rl
y
d
ef
e n s el
e s s ag
ai
n st w
at
e rb
om
ei l l
n e s s.a.
E
. c ol
i D
et
e ct i
o nM
et h
od
si
nD
e v el
op
ed
C
o u nt
ri
e sT
h
o ug
h
t
h
et
e ch
n ol
og y
e xi
st
st
ot
e st
a nd
t
r e at w
at
e r,t
h
e s et
o ol
s a r ei
nm
a ny
c a s e so u
t
si d
et
h
e r e a ch
of
p
e op
l
ei
n r e s o u r c e-p
o o r s et t
i
ng
s s u ch
a si
nd
e v el
op
i
ng
c o u nt
ri
e s, a sw
el l
a si
nt
h
e af
t
e rm
at
h
of
n at
u r al d i
s a st
e r sT
e st
i
ng i
np
a rt
i
c ul
a ri
s of
c o n c e r nb
e c a u s ew
at
e rq
u al i
t
y
m
u st
b
e a s s e s s ed
p
ri
o rt
o u s e.D
ri
nk i
ng w
at
e rt
e st
sw
i
d
el y
u s ed i
nt
h
er e
q
ui
r e s el
e ct
ri
ci
t
y
a nd
t
r ai
n ed
p
e r s o n n el
.M
em b
r a n efi l
t
r ati
o ni
s ag
o od
e x am
p
l
e of
t
h i
st
y p
e of
t
e st
si
n c ei
t
r eq
ui
r e s n um
e r o u sp
ie c e s o
f
s up p
l
em
e nt
al
eq
ui p
m
e nt
, r eq
ui
r e se
l
e ct
ri
ci
t
y
a nd
t
ak
e s si
g
n
i fi
c a nt t
r ain
i
ng
i
np
e rf
o rm
a n c e of t h
em
et
h
od
t
ob
e c om
ep
r ofi
cie n
t
i
ni
t
s u se
.T
h
em
et
h
od i
sp
e rf
o rm
ed b
y
fi l
t
e rin
g
aw
at
e r s am
p
l
e of
at
l
e a st 1
0
m
i l l i l i
t
e r st h
r o ug
h
a st
e ri
l
e ap p
a r at
u s a c r o s sa
fi l
t
e rw
h
e r et
h
em i
c r ob
e s a r e c ap
t
u r ed
.T
h
ef
il
t
e ri
s t
h
e n r em
o v ed
a nd
p
l
a c ed
o nt
o a n ag
a r c o nt
ai
ni
ng
a ch
r om
ag
e n o r ac
h
r om
ag
e n/ fl
u o r og
e n c om b i
n at
i
o nt
h
at
i
st
ak
e n up
b
y
t
h
em ic r o
b
e of i
nt
e r e st
d
u ri
ng
i
n c ub
at
i
o n .T
h
e c olo n
i
e sp
r od
u c e ap
a rt
i
c ul
a r c olo r a
n
d/
o rfl
u o r e s c e up
o n e xp
o s u r et
ol
o ng w
a v eU V l i
g
h
t
a nd
a
r e e n um
e r at
ed
.T
w
om
ed ia
in v o
l
v ed i
n
t
h i
sp
r oj
e ct
w
e r eB
i
o-R
ad
R
A
P I D E
. c ol
i 2
™
ag
a r(
B
io
R
ad
)
a nd
B
D
M
I
ag
a r(
M
I
)
.I D E
X X C
ol i l
e rt
®
Q
u a nt
i
t
r ay 2 0
0 0
(
C
ol
i
l
e rt
)
i
s a n ot
h
e rm
et
h
od
w
i d
el
y
u s ed i
nt
h
eU
ni
t
ed
S
t
at
e s a nd
ap
p
r o v ed b
y t
h
eE
n vi
r o nm
e nt
al Pr o
t
e ct
i
o nA g
e n cy
t
h
at
r eq
uir e s
b
ot
h
e x
p
e n siv e e
q
ui p m
e nt
a nd
ele c
tr
i
ci
t
y
.T
h
eC
ol i l
e rt
m
et
h
od
c o n si
st
s of
1
0 0 m L b
ot
t
le s
,p
a ck
et
s of C
ol i l
e rt
m
ed ia
,Q
u a nt
it
r ay
s, a nd
aQ
u a nt
i
t
r ay
s e al
e r.A
to
t
al
of 10 0 m L
of
s a
m
p
le
is
p
l
a c ed
i
nt
ot
h
eb
ot t
le
.O
n ep
a ck
et o
f C
ol i l
e rt
m
ed i
ai
sp
o u r ed i
nt
ot
h
eb
ot
fl
e a nd
th
el i d
r ep
l
a c ed
a nd
t
h
e nm ix e
d
t
h
o r o ug
h l
y
t
od i
s s olv e
t
h
em
ed i
a.T
h
e s am
p
l
ei
st
h
e np
o u r ed i
nt
ot
h
eQ
u a nt
it
r ay w
h i
ch
i
sp
la c e
d
i
nt
ot
h
eQ
u a nt i
t
r ay
s e ale r
a nd
i
n c ub
at
ed
C
ol i
s c a n T '^E
a sy g
el ®
(
E
a sy g
el
)
a nd SM
^^
P
et
ri fi l m
^ ' ^(
P
et
ri
fi l m
)
m
et
h
od
s a r eb
ot
h m
u ch
e a si
e rt
op
e rf
o rm
.E
a sy
g
el m
et
h
od i
s ap
p
r o v ed b
y
t
h
eE P
A
a nd
u s ed i
nt
h
eU
S
.,t
h
o ug h
o n a sm
al l
e r s c al
et
h
a nt
h
et w
op
re
vi
o u sm
et
h
od
s.T
h
eE
a sy
g
el m
et
h
od i
sp
o u r-p l
at
em
et
h
od
t
h
at
in c
l
ud
e st
h
r e e r eq
ui
r ed
el
em
e nt
s : ap
r e-t
r e a
t
ed p
et
ri d i
sh
, ab
ot t
l
eo
f
m
ed i
a, a nd
s am
p
le
w
ate r
.F
i
v em
i l l i l i
t
e r s of
t
h
es
am
p
l
ew
at
e r a r ep l
a c ed i
n si d
eth
es
m
al
l
b
ot t
l
e c o nt
ai
nin
g
r oo
m
m
i
x ed
, a n
d
t
h
e s ol
ut
io n
is
t
h
e np
o u r ed
i
nt
ot
h
ep
r e-t
r e at
ed d i
sh
.T
h
e s ol
ut
i
o ni
s
al l
ow
ed
t
os o
l i d i f
y
f
o r ap p
r o xi m
at
el
y 4
0 m i
n ut
e s a nd
t
h
e ni
n c ub
at
ed
.P
etr
i fi l m m
et
h
od i
s n ot
u s ed in
t
h
eU
.S
f
o rd
ri
nk in
g
w
at
e r a n al
y
si
s a nd i
s n ot
a
p p
r o v ed b y
t
h
eE P A f
o rt
h
at
p
u rp
o s eI
t
h
a sh i
st
o ri
c al l y b
e e nt
e st
ed
a nd
u s ed
t
od
et
e ct
E
. c ol
i
in
f
o od
, a nd
t
h
e r ei
sl i
t t
l
ek
n ow
l
ed
g
e of i
ts
p
e rf
o rm
a n c e r eg
a rd i
ng d
ri
nk i
ng
w
at
e rs a
m
p
l
e s.I t
h
a s s e v e r al
ch
a r a ct
e ri
s
t
ic s
t
h
at
m
ak
ei
t
i d
e al f
o rt
h i
sp
u rp
o s e,
h
ow
e v e r,e s
p
e ci
al l
y
i
n r e s o u r c e-p
o o r s et t
i
ng
s.T
h
eP
et
ri fi l m m
et
h
od
c o n si
st
s of
a c a rd
w
i
t
h
afi l m
o n
t
op
, ap
la s
t
i
cd
e vic e a n
d
t
h
e s am
p
le
w
at
e r.T
h
efi l m i
s r ai
s ed
, a nd
o n em i l l i l i
t
e r of
s a
m p l
ei
sp
l
a c ed in
t
ot
h
e c e nt
e r of
t
h
e c a rd
.T
h
efi l m i
s sl
ow l
y
l
ow
e r ed
a nd
t
h
ep
l
a st
i
cd
e vi
ce
i
sp
l
a c ed
o nt
o
p
of
t
h
efi l m
a
nd
c a rd
t
od is
p
e r s eth
e u nd
e
rl
y
i
ng
s am
p
le
fl
ui d
e v e n
l
y
a c r o s st
h
e c a rd
,w h i
ch i
st
h
e nin c
u
b
ate
d
.b
.C
ri
t
e ri
af
o rL
o
w
-c
o st D
ri
nk i
ng
W
at
e rT
e st f
o rE
. c ol i
T
h
e r e s o u r c e s a v ai l
ab l
ei
nd
e v elo
p
i
ng
c o u nt
rie s a n
d
af
t
e r n at
u r al d is a s
t
e r sm
ay
b
em
u ch m
o r el i
m
i t
ed
t
h
a nin
d
e v el
op
ed
c o u nt
ri
e s,t
h
u sh i g h l i g h
t
i
ng
t
h
e n e ed f
o r at
e st t
h
at
c a n
b
ep
e rfo r
m
ed i
n r e s o u r c e-l im it
ed
s et t
i
ng
s.T h
e a v ai l
ab i l i
t y
of
el
e ct
ric
i
t y
, am
o u nt
of
s
p
a c et
o r u nt
h
et
e st
, am
o u nt
of
s am
p l
ew
at
e r a v ai
la
b
l
e,t
h
e a v ai
l
ab
i l i
t
y
of
t
r ai
n ed
p
e rs
o n n el
a sw
el l
a st
h
e am
o u nt
of m
o n ey
a v ai l
ab l
ef
o rte s
t
in
g
a r ej
u st
af
ew
f
a ct
o r st
h
at
C
ri
t
e ri
ai d
e nt
i f
i ed
t
ob
e of i
m
p
o rt
a n c ei
n cl
ud
ef
a ct
or s s uch
a s :V
ol
um
e of
s am
p
l
et
h
et
e st
a n al
y
z eQ
u a nt
i f
i c at
i
o
nm
et
h
od
N
e ed f
o r el
e ct
ri
ci
t y
N
e ed f
o r s up p
l
em
e nt
al
eq
ui
p
m
e nt
1
st
ep
v sm
ult
i
p
l
e st
ep
P
e ri
sh
ab
i l
i
t y
P
o rt
ab i l i
t
y
/
c om
p
a ct
n e s sC
o n v e ni
e n c e of
ap p
l i
c at
i
o
nP
r e s e n c e/
ab
s e n s eR
e ad i l
y
d
et
e ct
ab l
e e nd p
oi
nt
E
a si
l
y
vi
s u ali
z eE
c ol
i
o np
oi
nt
(
r a ng
e of
c o u nt
ab l
eC P
U
s)
B
r ot
h
v s ag
a r v sp
e ct
i
nC h
r om
ag
e n v sf l
u o r og
e nS
e n si
t
i
vi
t
y
Sp
e ci f
i ci
t y
P
r e ci
si
o nU
ni
t
c o st
P
e rf
o rm
a n c e of m
et
h
od
at
n o n-c on v
e nt
i
o n al
t
em
p
e r at u
r e s(
N
at
i
o n al
R
e s e a r ch C
o u n ci l
of
th
eN
at
i
o n al A
c ad
em i
e s,2
0 0 4
)
T
h
e s ef
a ct
o r s a r e o ut
l i
n ed i
n at
ab l
eb
el
ow
a nd d
e s c ri
b
ed
a c c o rd
i
ng
t
om
et
h
od
.T h
et
ab l
ei
sf
ol
l
ow
ed b
y
d
et
ai l
ed
c om
p
a ri
s o n s of
t
h
em
et
h
od
s a c r o s s c ri
t
e ri
a.T h
ef
ol l
ow
i
ng
ab b
r e vi
at
i
o n s a r e u s ed
:M
em b
r a n efi l
t
r at
i
o nw i
t
h
M
I
ag
a r(M
I
)
,m
em b
r a n ef
il
t
r at
i
o nw i
t
h
B
i
o-R
a