Chapter 7 Study 1
7.4 Comparison of Experimental Groups
Las cepas utilizadas a lo largo de este trabajo se muestran en la Tabla I. Con el objetivo de simplificar y facilitar la lectura de esta memoria nos hemos referido a las distintas cepas de C. albicans y S. cerevisiae como genX, para referirse al mutante homocigoto genX/genX, y GENX/genX, para la cepa heterocigota en dicho gen. Para referirse a la reintegración del gen en su propio promotor se empleó la nomenclatura gen::GEN.
La cepa de S. cerevisiae KT063 empleada para la realización del escrutinio genético fue cedida amablemente por el Dr. Haruo Saito. La cepa opy2 ssk1 para los estudios de complementación de CaOPY2 en S. cerevisiae fue proporcionada por el Dr. Cunle Wu. Los distintos mutantes en Pmts fueron cedidas y se usaron en el laboratorio del Dr. Joachim Ernst durante una estancia breve (Institut für Mikrobiologie. Heinrich-Heine-Universität Düsseldorf. Alemania).
Tabla I. Relación de cepas: genotipos y origen.
MICROOR- GANISMO CEPA GENOTIPOOFONDO GENÉTICO NOMENCLATURAENTEXTO YFIGURAS ORIGEN Escherichia coli DH5αF’ K12Δ (lacZYA-argF)u169 supE44 thi1 recA1 endA1 hsdR17 gyrA relA1 (ø80lacZΔM15)F'
DH5α (Hanahan, 1988)
C. albicans SC5314 Silvestre SC5314 (wt) (Gillum et al., 1984) C. albicans CAF2 URA3/ura3::imm434 CAF2 (wt) (Fonzi and Irwin, 1993) C. albicans CAI4 ura3::imm434/ura3::imm434 CAI4 (wt) (Fonzi and Irwin, 1993) C. albicans RM1000 ura3::imm434/ura3::imm434
his1::hisG/his1::hisG RM1000
(Negredo et al., 1997) C. albicans RM100 ura3::imm434/ura3::imm434 his1::hisG/his1::hisG-URA3-
hisG RM100 (wt)
(Negredo et al., 1997) C. albicans CHO1 [CAF2]
OPY2/opy2::FRT-FLP-SAT1- OPY2/opy2 N
FRT C. albicans CHO2-1 [CAF2]
OPY2/opy2::FRT OPY2/opy2 NS (OPY2/opy2) Este trabajo C. albicans CHO3
[CAF2]
opy2::FRT/opy2::FRT-FLP- SAT1-FRT
opy2/opy2 NR Este trabajo
C. albicans CHO4-1 [CAF2]
opy2::FRT/opy2::FRT
opy2/opy2 NS
(opy2) Este trabajo C. albicans CHO38
[CAF2]
opy2::FRT/opy2::FRT ura3::/ura3::
opy2/opy2 URA3-
(opy2 U-) Este trabajo
C. albicans CHO5-1
[RM1000]
sho1::hisG/sho1::hisG-URA3- hisG OPY2/opy2::FRT-FLP- SAT1-FRT
sho1 OPY2/opy2 NR Este trabajo
C. albicans CHO6
[RM1000]
sho1::hisG/sho1::hisG-URA3- hisG OPY2/opy2::FRT
sho1 OPY2/opy2 NS Este trabajo
C. albicans CHO7-1
[RM1000]
sho1::hisG/sho1::hisG-URA3- hisG opy2::FRT/opy2::FRT- FLP-SAT1-FRT
sho1 opy2/opy2 NR Este trabajo
C. albicans CHO8-1
[RM1000]
sho1::hisG/sho1::hisG-URA3- hisG opy2::FRT/opy2::FRT
sho1 opy2/opy2 NS
(sho1 opy2) Este trabajo
C. albicans CHO9-1
[CAI4]
ssk1::hisG/ssk1::hisG-URA3- hisG OPY2/opy2::FRT-FLP- SAT1-FRT
ssk1 OPY2/opy2 NR Este trabajo
C. albicans CHO10-1
[CAI4]
ssk1::hisG/ssk1::hisG-URA3- hisG OPY2/opy2::FRT
ssk1 OPY2/opy2 NS Este trabajo
C. albicans CHO11-1
[CAI4]
ssk1::hisG/ssk1::hisG-URA3- hisG opy2::FRT/opy2::FRT- FLP-SAT1-FRT
ssk1 opy2/opy2 NR Este trabajo
C. albicans CHO12-1
[CAI4]
ssk1::hisG/ssk1::hisG-URA3- hisG opy2::FRT/opy2::FRT
ssk1 opy2/opy2 NS
(ssk1 opy2) Este trabajo
C. albicans CHO13
[RM100]
msb2::FTR/msb2::FTR OPY2/opy2::FRT-FLP-SAT1- FRT
msb2 OPY2/opy2 NR Este trabajo
OPY2/opy2::FRT C. albicans CHO15 [RM100] msb2::FTR/msb2::FTR opy2::FRT/opy2::FRT-FLP- SAT1-FRT
msb2 opy2/opy2 NR Este trabajo
C. albicans CHO16-1
[RM100]
msb2::FTR/msb2::FTR opy2::FRT/opy2::FRT
msb2 opy2/opy2 NS
(msb2 opy2) Este trabajo
C. albicans CHO17-1 [CAI4] ssk1::hisG/ssk1::hisG sho1::hisG-URA3- hisG/sho1::hisG OPY2/opy2::FRT-FLP-SAT1- FRT
ssk1 sho1 OPY2/opy2 NR Este trabajo
C. albicans CHO18-1 [CAI4] ssk1::hisG/ssk1::hisG sho1::hisG-URA3- hisG/sho1::hisG OPY2/opy2::FRT
ssk1 sho1 OPY2/opy2 NS Este trabajo
C. albicans CHO19-1 [CAI4] ssk1::hisG/ssk1::hisG sho1::hisG-URA3- hisG/sho1::hisG opy2::FRT/opy2::FRT ssk1 sho1 opy2/opy2 NS
(ssk1 sho1 opy2) Este trabajo
C. albicans CHO20-1 [RM100] msb2::FTR/msb2::FTR sho1::hisG/sho1::hisG-URA3- hisG OPY2/opy2::FRT-FLP- SAT1-FRT
msb2 sho1 OPY2/opy2 NR Este trabajo
C. albicans CHO21-1
[RM100]
msb2::FTR/msb2::FTR sho1::hisG/sho1::hisG-URA3- hisG OPY2/opy2::FRT
msb2 sho1 OPY2/opy2 NS Este trabajo
C. albicans CHO22 [RM100] msb2::FTR/msb2::FTR sho1::hisG/sho1::hisG-URA3- hisG opy2::FRT/opy2::FRT- FLP-SAT1-FRT
msb2 sho opy2/opy2 NR Este trabajo
C. albicans CHO23-1 [RM100] msb2::FTR/msb2::FTR sho1::hisG/sho1::hisG-URA3- hisG opy2::FRT/opy2::FRT msb2 sho opy2/opy2 NS
(msb2 sho1 opy2) Este trabajo
C. albicans CHO24-1 [CAI4] ssk1::hisG/ssk1:: hisG- URA3-hisG msb2::FTR/msb2::FRT OPY2/opy2::FRT-FLP-SAT1- FRT
C. albicans CHO25-1 [CAI4] ssk1::hisG/ssk1:: hisG- URA3-hisG msb2::FTR/msb2::FRT OPY2/opy2::FRT
ssk1 msb2 OPY2/opy2 NS Este trabajo
C. albicans CHO26-1 [CAI4] ssk1::hisG/ssk1:: hisG- URA3-hisG msb2::FTR/msb2::FRT opy2::FRT/opy2::FRT-FLP- SAT1-FRT
ssk1 msb2 opy2/opy2 NR Este trabajo
C. albicans CHO27-1 [CAI4] ssk1::hisG/ssk1:: hisG- URA3-hisG msb2::FTR/msb2::FRT opy2::FRT/opy2::FRT ssk1 msb2 opy2/opy2 NS
(ssk1 msb2 opy2) Este trabajo
C. albicans CHO28-1 [CAI4] ssk1::hisG/ssk1::hisG msb2::FTR/msb2::FRT sho1::hisG/sho1::hisG-URA3- hisG OPY2/opy2::FRT-FLP- SAT1-FRT
ssk1 msb2 sho1 OPY2/opy2 NR Este trabajo
C. albicans CHO29-1 [CAI4] ssk1::hisG/ssk1::hisG msb2::FTR/msb2::FRT sho1::hisG/sho1::hisG-URA3- hisG OPY2/opy2::FRT
ssk1 msb2 sho1 OPY2/opy2 NS Este trabajo
C. albicans CHO30-1 [CAI4] ssk1::hisG/ssk1::hisG msb2::FTR/msb2::FRT sho1::hisG/sho1::hisG-URA3- hisG opy2::FRT/opy2::FRT- FLP-SAT1-FRT
ssk1 msb2 sho1 opy2/opy2 NR Este trabajo
C. albicans CHO31-1 [CAI4] ssk1::hisG/ssk1::hisG msb2::FTR/msb2::FRT sho1::hisG/sho1::hisG-URA3- hisG opy2::FRT/opy2::FRT ssk1 msb2 sho1 opy2/opy2 NS
(ssk1 msb2 sho1 opy2) Este trabajo
C. albicans REP3
[RM1000]
sho1::hisG/sho1::hisG-URA3- hisG
sho1 (Román et al., 2005)
C. albicans REP18-1 [RM100] msb2::FRT/msb2::FRT msb2 (Román et al., 2009b) C. albicans CNC13 [RM1000] hog1::hisG/hog1::hisG- URA3-hisG
hog1 (San José C. et al., 1996)
C. albicans HI3-21 [CAI4]
hog1::hisG/hog1::hisG- hog1
Correia, I., datos sin publicar
URA3-hisG C. albicans CSSK21-U-6 [CAI4] ssk1::hisG/ssk1::hisG-URA3- hisG ssk1 (Calera et al., 2000b) C. albicans REP22-1 [RM100] msb2::FRT/ msb2::FRT sho1::hisG/sho1::hisG
msb2 sho1 (Román et al., 2009b)
C. albicans REP29F-1 [CAI4] ssk1::hisG/ssk1::hisG msb2::FRT/ msb2:: FRT sho1::hisG/sho1::hisG-URA3- hisG
ssk1 msb2 sho1 (Román et al., 2009b)
C. albicans REP12-1
[CAI4]
ssk1::hisG/ssk1::hisG sho1::hisG-URA3- hisG/sho1::hisG
ssk1 sho1 (Román, E., Tesis Doctoral) C. albicans CK43B-16 cek1::hisG/cek1::hisG-URA3-hisG cek1 (Csank et al., 1998)
C. albicans E5 [CAI4] cek1::hisG-URA3- hisG/cek1::hisG hog1::hisG/hog1::hisG ARD1/ard1::FRT pSAP2- FLP-URA3
cek1 hog1 (Arana et al., 2007)
C. albicans CHO39
[CAF2]
opy2::FRT/opy2::FRT pOPY2::pOPY2-OPY2-URA3
opy2::OPY2 (OPY2reint) Este trabajo
C. albicans CHO41 [CAI4] ssk1::hisG/ssk1::hisG msb2::FTR/msb2::FRT sho1::hisG/sho1::hisG-URA3- hisG opy2::FRT/opy2::FRT ura3::/ura3 pOPY2::pOPY2- OPY2-URA3
ssk1 msb2 sho1 opy2::OPY2 Este trabajo
C. albicans CHOM-16
[CAF2]
opy2::FRT/opy2::FRT ADH1/adh1:: tTA pTET- OPY2-myc-SAT1
opy2::OPY2-myc
(Opy2-myc) Este trabajo
C. albicans CHpO41
opy2::FRT/opy2::FRT ura3::/ura3::
pOPY2::pOPY2-RLuc-URA3
opy2::prOPY2-RLuc
(prOPY2-RLuc) Este trabajo
C. albicans RMpS-1 [RM100] pSTL1::pSTL1-RLuc-URA3 RM100-prSTL1-RLuc (prSTL1-RLuc) (Alonso- Monge, R. datos sin publicar) C. albicans HpS-3 [RM1000] hog1::hisG/hog1::hisG hog1::prSTL1-RLuc (Alonso- Monge, R. datos sin
pSTL1::pSTL1-RLuc-URA3 publicar) C. albicans CH042-2
opy2::FRT/opy2::FRT ura3::/ura3::
pSTL1::pSTL1-RLuc-URA3
opy2::prSTL1-RLuc Este trabajo
C. albicans RM1000/pAG2 [RM1000] pACT1-CDC10-GFP3-URA3 RM1000-CDC10-GFP (Alonso- Monge, R. datos sin publicar) C. albicans CNC15/pAG2 [RM1000] hog1::hisG/hog1::hisG pACT1-CDC10-GFP3-URA3 hog1-CDC10-GFP (Alonso- Monge, R. datos sin publicar) C. albicans CHCG2 [CAI4] ssk1::hisG/ssk1::hisG msb2::FTR/msb2::FRT sho1::hisG/sho1::hisG-URA3- hisG opy2::FRT/opy2::FRT ura3::/ura3 pACT1- CDC10-GFP3-URA3 ssk1 msb2 sho1 opy2- CDC10-GFP Este trabajo C. albicans CHMG1 [CAI4]
pACT1-MYO5-GFP-URA3 CAI4 Myo5-GFP Este trabajo
C. albicans CHMG2 [CAI4] ssk1::hisG/ssk1::hisG msb2::FTR/msb2::FRT sho1::hisG/sho1::hisG-URA3- hisG opy2::FRT/opy2::FRT ura3::/ura3 pACT1- MYO5-GFP-URA3 ssk1 msb2 sho1 opy2
Myo5-GFP Este trabajo
C. albicans SPCa2 pmt1::hisG/pmt1::hisG ura3::imm434/URA3 pmt1 (Prill et al., 2005) C. albicans SPCa4 pmt2::hisG/PMT2 ura3::imm434/URA3 PMT2/pmt2 (Prill et al., 2005) C. albicans SPCa6 pmt4::hisG/pmt4::hisG ura3::imm434/URA3 pmt4 (Prill et al., 2005)
C. albicans CPOM1-1
[pmt1]
ADH1/adh1:: tTA pTET- OPY2-myc-SAT1
pmt1::Opy2-myc Este trabajo
C. albicans CPOM2-B
[PMT2/pmt2]
ADH1/adh1:: tTA pTET- OPY2-myc-SAT1
PMT2/pmt2::Opy2-myc Este trabajo
C. albicans CPOM4-9
[pmt4]
ADH1/adh1:: tTA pTET- OPY2-myc-SAT1
pmt4::Opy2-myc Este trabajo
C. albicans CHM321-2
[CAI4]
hog1::hisG/hog1::hisG- URA3-hisG ADH1/adh1:: tTA pTET-HOG1321L-myc-SAT1
hog1::HOG1F321L-myc
S. cerevisiae KT063 MATα ura3 leu2 trp1 his3 ssk2::LEU2 ssk22::LEU
hkr1::natMX4 msb2:: kanMX6 KT063
(Tatebayashi et al., 2007) S. cerevisiae CHKY [KT063]
YEp352 KT063 +YEp352 Este trabajo
S. cerevisiae CHKS [KT063] YEp352 KT063 +SSK2 (clones 3, 4, 5, 7, 8, 9, 20, 38, 43) Este trabajo S. cerevisiae CHKM [KT063]
YEp352 con fragmentos del gen MSB2 KT063 +MSB2 (clones 1, 13, 15, 18, 19, 23, 26, 29, 30, 32, 35, LC) Este trabajo S. cerevisiae CHKP [KT063]
YEp352 con fragmentos del gen PBS2 KT063 +PBS2 c.21 (clon 21) Este trabajo S. cerevisiae CHKpCM [KT063] pCM190 KT063 +pCM190 Este trabajo S. cerevisiae CHKH [KT063]
pCM190-HOG1 KT063+HOG1 Este trabajo S. cerevisiae CHKH321 [KT063]
pCM190-HOG1 F321L KT063+HOG1
F321L Este trabajo
S. cerevisiae CHKP [KT063]
pCM190-PBS2 KT063+PBS2 Este trabajo S. cerevisiae BY4741 MATa his3 1 leu2 met15 ura3 BY4741 (wt) EUROSCARF
S. cerevisiae BY4741 opy2 (Y05494)
MATa opy2::KanMX4 (BY4741 Mat a his3 1 leu2 met15 ura3
YPR075c::kanMX4)
opy2 EUROSCARF
S. cerevisiae BY4741 ssk1 MATa ssk1::kanMX4 ssk1 EUROSCARF S. cerevisiae YCW1380 MATa opy2::Kanura3 his3 leu2 R ssk1::NatR opy2 ssk1 (Wu et al., 2006) S. cerevisiae CD1-1 MATa his3 1 leu2 met15 ura3::TetO pCM189-URA3 wt pCM189 (de Dios et al., 2012)
S. cerevisiae CD2-4 MATa his3 1 leu2 met15 ura3::TetO pCM189-CaOPY2
myc-URA3 wt CaOPY2-myc
(de Dios et al., 2012)
S. cerevisiae CD3-2
MATa his3 1 leu2 met15 ura3::TetO pCM189-ScOPY2
myc-URA3 wt ScOPY2-myc
(de Dios et al., 2012)
S. cerevisiae CD9-1
MATa opy2::KanR ssk1::NatR
ura3 his3 leu2::TetO pCMV-
CaOPY2 myc-URA3 opy2 ssk1 CaOPY2-myc
(de Dios et al., 2012)
S. cerevisiae CD7-2 BY4741 isogenic, opy2::KanMX4 :: TetO
pCMV-ScOPY2 myc-URA3 opy2 ScOPY2-myc
(de Dios et al., 2012) S. cerevisiae CD8-1 MATa opy2::Kan
R ssk1 ::NatR
ura3 his3 leu2:: TetO pC189- URA3
opy2 ssk1 pCM189 (de Dios et al., 2012)
S. cerevisiae CD9-1
MATa opy2::KanR ssk1::NatR
ura3 his3 leu2:: TetO
pCM189-CaOPY2 myc-URA3 opy2 ssk1 CaOPY2-myc
(de Dios et al., 2012)
S. cerevisiae CD10-23 MATa opy2::Kan
R ssk1::NatR
ura3 his3 leu2:: TetO
pCM189-ScOPY2 myc-URA3 opy2 ssk1 ScOPY2-myc
(de Dios et al., 2012)
Nota: Para simplificar y para una mayor claridad se han omitido los genotipos de las cepas que se indican entre corchetes [ ] indicándose a continuación las mutaciones adicionales que posee.