Setup

Se genotiparon 18 loci microsatélite en el lote de 139 progenitores y 150 individuos de la semilla producida para comparar su diversidad tanto entre sí como con la muestra recogida en 2008 en la misma localidad que los reproductores (Barallobre), referida en adelante como población natural. La tabla 4.XXI muestra los valores obtenidos para los diferentes parámetros de diversidad. Tanto el lote de reproductores como los progenitores identificados y el total de la semilla mostraron un número medio de alelos por locus (8,110-9,056) superior al de la población natural (6,500) debido probablemente a que el tamaño de muestra de la población natural fue menor. Veintitrés

4. RESULTADOS

87 alelos observados en los progenitores no aparecieron en la semilla y, por otro lado, nueve alelos observados en la semilla no se encontraron en los progenitores. En términos de riqueza alélica media, las tres muestras tienen valores similares, encontrándose los valores más altos del rango en el lote de reproductores (6,497)/progenitores (6,493) y los más bajos en la población natural (5,794). Las tres clases de semilla, con un tamaño de muestra más similar al de la población natural, tienen también un número medio de alelos equivalente a ésta. En la comparación población natural-progenitores-grupos de semilla, la riqueza alélica media osciló entre 5,540 (progenitores) y 4,633 (semilla pequeña). Respecto a la heterocigosidad observada y esperada, todas las muestras reflejaron valores cercanos (0,392-0,436 y 0,503-0,578, respectivamente).

Tabla 4.XXI. Diversidad genética de la población natural, reproductores/progenitores y semilla.

Reproductores Semilla

Población natural

Lote Progenitores Total Grande Mediana Pequeña

N 50 139 103 150 32 44 69 Na 6,500 9,056 8,556 8,110 6,056 6,278 6,333 Rs1 5,794 6,497 — 6,024 — — — Rs2 5,794 — 6,493 6,024 — — — Rs3 5,029 — 5,540 — 5,207 5,016 4,633 Ho 0,392 0,427 0,428 0,421 0,419 0,436 0,400 He 0,572 0,578 0,577 0,562 0,577 0,560 0,503

Ba: Barallobre; N: número de individuos; Na: número medio de alelos, Rs: riqueza alélica calculada en base a:Rs1: 27, Rs2:27 y Rs3: 16individuos; Ho: heterocigosidad observada; He: heterocigosidad esperada.

Al aplicar el test de Friedman a los valores de riqueza alélica y heterocigosidad observada y esperada de las muestras, no se encontraron diferencias significativas en la comparación población natural-lote de reproductores-semilla total ni en la comparación población natural-progenitores-semilla total. Sin embargo, al hacer la comparación población natural-progenitores-grupos de semilla se detectaron diferencias significativas en la riqueza alélica. En el test post hoc realizado las diferencias significativas se encontraron en dos de los grupos de tamaño (mediana y pequeña) frente a sus progenitores.

Los análisis de desequilibrio de ligamiento dieron resultados diferentes en progenitores, semilla y población natural. Mientras que en el caso de los progenitores y la población natural no se encontró desequilibrio de ligamiento para ningún par de loci,

Estudio genético poblacional en la almeja babosa Venerupis pullastra

88

en el caso de la semilla, cuatro parejas mostraron desequilibrio de ligamiento tras la corrección secuencial de Bonferroni (VpAT1-85 y VpAT2-30; VpAT2-8a y VpAT1-92; VpAT2-8a y VpAT2-4; VpAT2-8a y VpTE81). En el análisis por grupos de semilla, tras la corrección secuencial de Bonferroni, el desequilibrio de ligamiento se detectó únicamente en la semilla pequeña en consonancia con un valor alto en el coeficiente de parentesco.

Además de comparar la diversidad genética, se evaluó la diferenciación genética de reproductores/progenitores y semilla total/grupos de semilla respecto a todas las muestras tomadas del medio natural en base a 13 loci microsatélite (VpAT1-6, VpAC2- 34b, VpAT1-54, VpAT1-36, VpAT2-74, VpAT1-35, VpAT1-67, VpTE-139, VpAC1- 59b, VpAT2-30, VpAT2-36, VpAT2-4 y VpTE-181). La tabla 4.XXII indica los valores

FST de las comparaciones realizadas. Ni el lote de reproductores ni los progenitores

identificados mostraron diferencias significativas con la población natural, después de la corrección secuencial de Bonferroni. Lo mismo ocurre al comparar con el resto de localidades gallegas, excepto con O Barqueiro que muestra una diferenciación baja (F’ST= 0,020-0,021) pero significativa. Por tanto, globalmente los reproductores y

progenitores pueden considerarse una muestra representativa de los individuos del medio natural.

Aunque el total de la semilla resulta significativamente distinta al lote de reproductores y a todas las localidades, el valor de FST estandarizado no excede el 5%

en el contexto de la costa gallega. La semilla grande y mediana constituyen un grupo homogéneo tanto entre sí como con sus progenitores y muestras de las poblaciones naturales, excepto con la de O Barqueiro. La semilla pequeña difiere significativamente de todas las muestras comparadas: progenitores (F’ST= 0,032), semilla grande (F’ST=

0,054) y mediana (F’ST= 0,030) y poblaciones naturales de Galicia (F’ST= 0,051-0,062),

pero el grado de diferenciación, aunque superior a las comparaciones anteriores, resulta bajo. De los tres grupos de semilla, la de tamaño mediano destaca por no mostrar diferencias significativas con ninguna de las muestras de las localidades gallegas. Como cabría esperar, por la elevada diferenciación detectada previamente en el análisis de las localidades, todas las comparaciones que incluyeron Faro mostraron siempre niveles muy altos de diferenciación genética (F’ST= 0,447-0,472).

4. RESULTADOS

Estudio genético poblacional en la almeja babosa Venerupis pullastra

90

El análisis filogenético realizado con las muestras de Galicia indicó que la distancia entre el lote de reproductores/progenitores y la población natural es equivalente a la existente entre las muestras de las otras localidades. También que la semilla, independientemente del grupo de tamaño del que se trate, está más estrechamente relacionada con el lote de reproductores/progenitores que con cualquiera de las muestras de las localidades. No obstante, debe señalarse que los valores bootstrap

son bajos.

Figura 4.15. Árbol filogenético inferido mediante el algoritmo Neighbour-joining a partir de las frecuencias alélicas de 13 loci microsatélite. Los números de los nodos indican los valores bootstrap obtenidos para 10000 réplicas.