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Appendix E SPEL Application Configuration

Componentes

Members

Jarillo Quiroga, José Antonio Investigador OPIs

Miguel Casado, Eugenio José Colaborador I+D+i

Sáez de las Heras, David Ayudante Invest.

Lázaro Somoza, Ana Tit. Sup. Act.Téc. Prof. Ruiz Montejano, Sandra Téc. Sup. Act.Téc. Prof.

Gómez Zambrano, Mª Ángeles Becaria

D e p a r t a m e n t o d e B i o t e c n o l o g í a

expresión de FLC y de genes FLC-like. También hemos demostrado que ESD1 interacciona con AtSWC6 y que ambas proteínas son requeridas para la acetilación de la histona H3 y la trimeti- lación de los residuos de lisina 4 de la histona H3 de la cromatina de FLC.

En paralelo, hemos seguido caracterizando a nivel genético y molecular ESD6 y ESD7, otros dos loci represores de la floración. El fenotipo de los mutantes esd6 y esd7 es muy pleiotrópico, presentando alteraciones visibles en cuanto al tiempo de floración y al tamaño y morfología de diferentes órganos de la planta. Su clonación molecular ha revelado que ESD6 codifica HOS1, una proteína con un motivo “RING-finger” que podría funcionar como una ligasa de ubiquitina tipo E3. El fenotipo de floración temprana de esd6 está correlacionado con bajos niveles de expresión de FLC, aunque tenemos evidencias de que ESD6 podría también actuar a nivel de la ruta de fotoperiodo.

Por su parte, esd7 está afectado en el gen que codifica la subunidad catalítica de la DNA poli- merasa epsilon (AtPOL2A). ESD7 controla el tiempo de floración participando en la represión de la expresión de los integradores florales FT y SOC1, a través de mecanismos de silenciamien- to transcripcional.

Dentro del proyecto Consolider Trasplanta parti- cipamos en la obtención de una colección de líne- as transgénicas de Arabidopsis, en cada una de las cuales se expresará, bajo el control de un promo- tor inducible un gen de un factor de transcripción. También hemos iniciado la identificación de nue- vas variantes alélicas inducidas en una población de tomate para caracteres de respuesta a la luz, precocidad y calidad de fruto.

The group has got a deeper insight into the epige- netic mechanisms that participate in the regulation of floral transition through the characterization of two Arabidopsis mutations, esd1 and swc6 that cause an acceleration of flowering in comparison to the wild type strain.

Their molecular cloning reveals that both proteins maybe part of the SWR1 chromatin remodelling complex existing in plants.

We have demonstrated that both genes participate in the repression of flowering acting at the level of FLC and FLC-like gene expression. We have also shown that ESD1 interacts to ATSWC6 and that both proteins are required for both histone H3 acetylation and H3K4 trimethylation of the FLC chromatin.

In parallel, we have continued with the genetic and molecular characterization of ESD6 and ESD7 flo- ral repressor loci. esd6 and esd7 mutant pheno- types are quite pleiotropic, showing visible alter- ations in flowering time and in size and morpholo- gy of several plant organs. Their molecular cloning has revealed that ESD6 encodes HOS1, a RING- finger that may function as an E3 ubiquitin ligase. The esd6 early flowering phenotype may correlate with low level FLC expression, although we have some evidence indicating that ESD6 might also work in the photoperiodic pathway.

On the other hand, esd7 is affected in the catalyt- ic subunit of the DNA polymerase epsilon gene (AtPOL2A). ESD7 controls flowering time partici- pating in the repression of FT and SOC1 floral inte- grators through a mechanism involving transcrip- tional silencing.

Under the Consolider Project we participate in the preparation of a collection of transgenic lines each of which will express under the control of an inducible promoter a single TF-encoding gene or and RNAi against two or more highly related TF genes.

We have also initiated the isolation of new allelic variants induced in tomato for light responses, pre- cocity and fruit quality traits.

Artículos científicos

Scientific papers

Lázaro A, Gómez-Zambrano A, López- González L, Piñeiro M, Jarillo JA (2008). “Mutations in the Arabidopsis SWC6 gene, en- coding a component of the SWR1 chromatin remodeling complex, accelerate flowering time and alter leaf and flower development”. Journal

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Objetivos

Objectives

La diversidad natural de las plantas constituye la principal fuente de variación genética de las especies cultivadas y el primer objeto de la con- servación de las especies silvestres. En la actuali- dad se desconocen las bases genéticas y moleculares de toda esta variación natural, y solo recientemente se han comenzado a estu- diar a nivel molecular. La principal línea de nues- tro grupo de investigación es profundizar en el desarrollo y evaluación de herramientas genó- micas dirigidas a identificar los genes o variantes alélicas responsables de la variación fenotípica natural en vid.

Otra línea de investigación de nuestro grupo se ha centrado en la evaluación de cambios epige- néticos en los distintos procesos biotecnológi- cos de multiplicación y regeneración in vitro de plantas.

Palabras clave:

poblaciones naturales, vid, diversi- dad genética, genómica funcional, variación somaclonal.

The natural diversity of the plants is the main source of the genetic variation in the cultivated species and the first objective in the conservation of the wild species.Actually, the genetic and molecular bases of these natural variation are unknown and only recently we have started to study molecular level. The main interest of our group is focused in the development and evaluation of the genomic tools to identify the genes and allelic variants responsible of the phenotypic natural variation in grape.

Another investigation line has been the evaluation of epigenetic changes in the biotechnological process of multiplication and regeneration in vitro of plants.

Key words:

natural populations, grape, genetic diver- sity, functional genomics, somaclonal variation.

Actividades de I+D

R&D activities

La diversidad genética de vides silvestres en toda la cuenca mediterránea con microsatélites nucle- ares muestra claramente tres grupos genéticos que están representados por individuos pertene- cientes al centro de diversidad de la especie en Turquía e individuos pertenecientes al norte y sur de la Península Ibérica. Además se ha iniciado la caracterización fenotípica de las accesiones de la Península Ibérica, las cuales presentan caracteres agronómicos que son relevantes para su utiliza- ción en variedades cultivadas. Con estos resulta- dos se ha podido desarrollar una colección nuclear alélica de 25 individuos que correspon- den al 95% de la diversidad nucleotídica analizada. Con esta herramienta se ha analizado la presen- cia del retrotransposón ¨Gret 1¨ cuya inserción se ha asociado al promotor del gen de un factor transcripcional VvMybA1 con la desaparición de color en las bayas y por lo tanto relacionado con la ausencia de síntesis de antocioanina. En este

3. Análisis molecular y genético de la variación

natural en plantas / Molecular and genetic analysis